seq1 = pF1KE3055.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KE3055/gi568815589r_21381071.tfa (gi568815589r:21381071_21581694), 200624 bp

>pF1KE3055 624
>gi568815589r:21381071_21581694 (Chr9)

(complement)

1-624  (100001-100624)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTATCAAGCACTTCTTTGGAACTGTGTTGGTGCTGCTGGCCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTATCAAGCACTTCTTTGGAACTGTGTTGGTGCTGCTGGCCTCTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTATCTTCTCTCTAGATTTGAAACTGATTATCTTCCAGCAAAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTATCTTCTCTCTAGATTTGAAACTGATTATCTTCCAGCAAAGACAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAATCAAGAAAGTTTAAAACTCTTGAATAAGTTGCAAACCTTGTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAATCAAGAAAGTTTAAAACTCTTGAATAAGTTGCAAACCTTGTCAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAGTGTCTACCACACAGGAAAAACTTTCTGCTTCCTCAGAAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAGTGTCTACCACACAGGAAAAACTTTCTGCTTCCTCAGAAGTCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGTCCTCAGCAGTACCAAAAAGGACACACTCTGGCCATTCTCCATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGTCCTCAGCAGTACCAAAAAGGACACACTCTGGCCATTCTCCATGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTTCAGCAGATCTTCAGCCTCTTCAGGGCAAATATTTCTCTGGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTTCAGCAGATCTTCAGCCTCTTCAGGGCAAATATTTCTCTGGATGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGGAGGAAAACCACACGGAGAAATTCCTCATTCAACTTCATCAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGGAGGAAAACCACACGGAGAAATTCCTCATTCAACTTCATCAACAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAATACCTAGAAGCACTCATGGGACTGGAAGCAGAGAAGCTAAGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAATACCTAGAAGCACTCATGGGACTGGAAGCAGAGAAGCTAAGTGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTTTGGGTAGTGATAACCTTAGATTACAAGTTAAAATGTACTTCCGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTTTGGGTAGTGATAACCTTAGATTACAAGTTAAAATGTACTTCCGAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCATGATTACCTGGAAAACCAGGACTACAGCACCTGTGCCTGGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCATGATTACCTGGAAAACCAGGACTACAGCACCTGTGCCTGGGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCCAAGTAGAAATCAGCCGATGTCTGTTCTTTGTGTTCAGTCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTCCAAGTAGAAATCAGCCGATGTCTGTTCTTTGTGTTCAGTCTCACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAAACTGAGCAAACAAGGAAGACCCTTGAACGACATGAAGCAAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAAAACTGAGCAAACAAGGAAGACCCTTGAACGACATGAAGCAAGAGCTT

    600     .    :    .    :
    601 ACTACAGAGTTTAGAAGCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTACAGAGTTTAGAAGCCCGAGG