seq1 = pF1KE3050.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KE3050/gi568815589r_21187532.tfa (gi568815589r:21187532_21227606), 40075 bp

>pF1KE3050 567
>gi568815589r:21187532_21227606 (Chr9)

(complement)

1-567  (20510-21076)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTGTCCTTTTCTTTACTGATGGCCGTGCTGGTGCTCAGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
  20510 ATGGCCCTGTCCTTTTCTTTACTTATGGCCGTGCTGGTGCTCAGCTACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCATCTGTTCTCTAGGCTGTGATCTGCCTCAGACCCACAGCCTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20560 ATCCATCTGTTCTCTAGGCTGTGATCTGCCTCAGACCCACAGCCTGGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGCACAAATGGGAAGAATCTCTCCTTTC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  20610 ATAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGGACAAATGGGAAGAATCTCTCCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGACTTTGGACTTCCCCAGGAGGAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||
  20660 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGATTTCCGAATCCCCCAGGAGGAGTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCAACCAGTTCCAGAAGACTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
  20710 TGGCAACCAGTTCCAGAAGGCTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAGAGGACTCATCTGCTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20760 TCCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAGAGGACTCATCTGCTGCTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAACAGAGCCTCCTAGAAAAATTTTCCACTGAACTTTACCAGCAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20810 GAACAGAGCCTCCTAGAAAAATTTTCCACTGAACTTTACCAGCAACTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAACCTGGAAGCATGTGTGATACAGGAGGTTGGGATGGAAGAGACTCCCC
        | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  20860 TGACCTGGAAGCATGTGTGATACAGGAGGTTGGGGTGGAAGAGACTCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGAATGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20910 TGATGAATGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCTTTATCTAACAGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT
        ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
  20960 ACTCTTTATCTAATAGAGAGGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCTCTCTCTTTTTCAACAAACTTGCAAAAAA
        ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
  21010 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCCTCTCGTTTTCAACAAACTTGCAAAAAA

    550     .    :    .
    551 TATTAAGGAGGAAGGAT
         ||||||||||||||||
  21060 GATTAAGGAGGAAGGAT