seq1 = pF1KE3048.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KE3048/gi568815589r_21101599.tfa (gi568815589r:21101599_21302165), 200567 bp

>pF1KE3048 567
>gi568815589r:21101599_21302165 (Chr9)

(complement)

1-567  (100001-100567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGTCCTTTTCTTTACTGATGGTCGTGCTGGTACTCAGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGTCCTTTTCTTTACTGATGGTCGTGCTGGTACTCAGCTACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCATCTGCTCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGACCCACAGCCTGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCCATCTGCTCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGACCCACAGCCTGCGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGCACAAATGGGAAGAATCTCTCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGCACAAATGGGAAGAATCTCTCCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGCTTGAAGGACAGACATGAATTCAGATTCCCAGAGGAGGAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTGCTTGAAGGACAGACATGAATTCAGATTCCCAGAGGAGGAGTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCCACCAGTTCCAGAAGACTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCCACCAGTTCCAGAAGACTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAGAGGACTCATCTGCTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAGAGGACTCATCTGCTGCTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAACAGAGCCTCCTAGAAAAATTTTCCACTGAACTTTACCAGCAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAACAGAGCCTCCTAGAAAAATTTTCCACTGAACTTTACCAGCAACTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACCTGGAAGCATGTGTGATACAGGAGGTTGGGGTGGAAGAGACTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACCTGGAAGCATGTGTGATACAGGAGGTTGGGGTGGAAGAGACTCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGAATGAGGACTTCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGAATGAGGACTTCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCTTTATCTAATGGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTCTTTATCTAATGGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCTTCTCTTTTTCAACAAACTTGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCTTCTCTTTTTCAACAAACTTGAAAAAAG

    550     .    :    .
    551 GATTAAGGAGGAAGGAT
        |||||||||||||||||
 100551 GATTAAGGAGGAAGGAT