seq1 = pF1KE2802.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KE2802/gi568815582r_2671993.tfa (gi568815582r:2671993_2877128), 205136 bp

>pF1KE2802 354
>gi568815582r:2671993_2877128 (Chr16)

(complement)

1-138  (100000-100136)   99% ->
139-244  (101573-101678)   100% ->
245-354  (105027-105136)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGTTCCTCATGATCCGGCGCCACAAGACCACCATCTTCACGGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGACGTGTTCCTCATGATCCGGCGCCACAAGACCACCATCTTCACGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCAAGGAGTCCAGCACGGTGTTCGAACTGAAGCGCATCGTCGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CGCCAAGGAGTCCAGCACGGTGTTCGAACTGAAGCGCATCGTCGAGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCAAGCGGCCTCCTGACGAGCAGCGGCTGTACAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100099 TCCTCAAGCGGCCTCCTGACGAGCAGCGGCTGTACAAGGTG...CAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCAACTCTTGGATGATGGCAAGACACTGGGCGAGTGTGGCTTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 GACCAACTCTTGGATGATGGCAAGACACTGGGCGAGTGTGGCTTCACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAAACAGCACGGCCACAGGCCCCAGCCACAGTGGGGCTGGCCTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 TCAAACAGCACGGCCACAGGCCCCAGCCACAGTGGGGCTGGCCTTCCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAG         ATGACACCTTTGAGGCCCTGTGCATCGAGCCGTTTTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101676 CAGGTG...CAGATGACACCTTTGAGGCCCTGTGCATCGAGCCGTTTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCCGCCAGAGCTGCCCGATGTGATGAAGCCCCAGGACTCGGGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105065 AGCCCGCCAGAGCTGCCCGATGTGATGAAGCCCCAGGACTCGGGAAGCAG

    350     .    :    .    :
    333 TGCCAATGAACAAGCCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||
 105115 TGCCAATGAACAAGCCGTGCAG