seq1 = pF1KE2798.tfa, 1770 bp
seq2 = pF1KE2798/gi568815579r_35424711.tfa (gi568815579r:35424711_35628281), 203571 bp

>pF1KE2798 1770
>gi568815579r:35424711_35628281 (Chr19)

(complement)

1-1638  (100001-101638)   100% ->
1639-1704  (103358-103423)   100% ->
1705-1749  (103527-103571)   100% ->
1750-1770  (104749-104769)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCTTGCACGTCTGGTCGGCTCCTGCTCCCTCCTTCTGCTACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCTTGCACGTCTGGTCGGCTCCTGCTCCCTCCTTCTGCTACTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGTCTGGATGGGCGGCCAGCGATGACCCCATTGAGAAGGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGTCTGGATGGGCGGCCAGCGATGACCCCATTGAGAAGGTCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGGATCAACCGAGGGCTGAGCAATGCAGAGAGAGAGGTGGGCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGGATCAACCGAGGGCTGAGCAATGCAGAGAGAGAGGTGGGCAAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGATGGCATCAACAGTGGAATCACGCATGCCGGAAGGGAAGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGATGGCATCAACAGTGGAATCACGCATGCCGGAAGGGAAGTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTTTTCAACGGACTTAGCAACATGGGGAGCCACACCGGCAAGGAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTTTTCAACGGACTTAGCAACATGGGGAGCCACACCGGCAAGGAGTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAAAGGCGTCCAGGGGCTCAACCACGGCATGGACAAGGTTGCCCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAAAGGCGTCCAGGGGCTCAACCACGGCATGGACAAGGTTGCCCATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCAACCATGGTATTGGACAAGCAGGAAAGGAAGCAGAGAAGCTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCAACCATGGTATTGGACAAGCAGGAAAGGAAGCAGAGAAGCTTGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGGGTCAACAACGCTGCTGGACAGGTTGGGAAGGAGGCAGACAAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGGGTCAACAACGCTGCTGGACAGGTTGGGAAGGAGGCAGACAAACTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCATCATGGGGTCCATCACGGGGCCAACCAGGCGGGAAGTGAGGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCATCATGGGGTCCATCACGGGGCCAACCAGGCGGGAAGTGAGGCAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGTTTGGCCAGGGAGTCGACAATGCTGCAGGGCAGGCTGGAAATGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGTTTGGCCAGGGAGTCGACAATGCTGCAGGGCAGGCTGGAAATGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGGAGGTTTGGCCAGGGAGTCCACCATGCTGCAGGGCAGGCCGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGGAGGTTTGGCCAGGGAGTCCACCATGCTGCAGGGCAGGCCGGAAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGCTGGGAGGTTTGGCCAGGGAGTCCACCATGCTGCAGGGCAGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGCTGGGAGGTTTGGCCAGGGAGTCCACCATGCTGCAGGGCAGGCCGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGAGGCTGGGAGATTTGGCCAGGGGGCCCACCATGGTCTCAGTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGAGGCTGGGAGATTTGGCCAGGGGGCCCACCATGGTCTCAGTGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGGAAGGAGACAGAGAAGTTTGGCCAGGGGATCCACCATGCTGCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGGAAGGAGACAGAGAAGTTTGGCCAGGGGATCCACCATGCTGCCGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGTTGGGAAGGAGGCAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGCCCACCATGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGTTGGGAAGGAGGCAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGCCCACCATGCTGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGCAGGCCGGAAATGAGGCAGGGAGATTTGGCCAGGGGGTCCACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGCAGGCCGGAAATGAGGCAGGGAGATTTGGCCAGGGGGTCCACCATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTCAGTGAGGGCTGGAAGGAGACAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTCAGTGAGGGCTGGAAGGAGACAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGTCCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATACTGCTGGTCAGGTTGGGAAGGAGGCAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATACTGCTGGTCAGGTTGGGAAGGAGGCAGAGAAGTTTGGCCAGGGGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCATGCTGCGGGGCAGGCCGGAAATGAGGCAGGGAGATTTGGCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACCATGCTGCGGGGCAGGCCGGAAATGAGGCAGGGAGATTTGGCCAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGCCCACCATGCTGCGGGGCAGGCCGGAAATGAGGCTGGGAGGTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCCCACCATGCTGCGGGGCAGGCCGGAAATGAGGCTGGGAGGTTTGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGGGGTCCACCATGGTCTCAGTGAGGGCTGGAAGGAGACAGAGAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGGGGTCCACCATGGTCTCAGTGAGGGCTGGAAGGAGACAGAGAAGTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCCAGGGGGTCCACCATGCTGCCAGTCAGTTTGGGAAGGAAACAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCCAGGGGGTCCACCATGCTGCCAGTCAGTTTGGGAAGGAAACAGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCTCGGCCATGGGGTCCACCATGGGGTTAATGAGGCCTGGAAGGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCTCGGCCATGGGGTCCACCATGGGGTTAATGAGGCCTGGAAGGAAGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAAGTTTGGCCAGGGTGTCCACCATGCTGCCTCGCAGGTGGGGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAAGTTTGGCCAGGGTGTCCACCATGCTGCCTCGCAGGTGGGGAAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAAGACAGAGTGGTCCAAGGCCTCCATCATGGCGTTAGTCAGGCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAAGACAGAGTGGTCCAAGGCCTCCATCATGGCGTTAGTCAGGCTGGAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGAGGCGGGGCAGTTTGGCCACGACATTCACCACACAGCAGGGCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGAGGCGGGGCAGTTTGGCCACGACATTCACCACACAGCAGGGCAGGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GGAAAGAGGGAGACATAGCAGTTCATGGTGTCCAACCTGGGGTCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GGAAAGAGGGAGACATAGCAGTTCATGGTGTCCAACCTGGGGTCCACGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCGGGAAGGAGGCAGGGCAGTTTGGCCAGGGAGTTCACCATACCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCGGGAAGGAGGCAGGGCAGTTTGGCCAGGGAGTTCACCATACCCTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 ACAGGCCGGGAAGGAAGCAGACAAAGCGGTCCAAGGGTTCCACACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 ACAGGCCGGGAAGGAAGCAGACAAAGCGGTCCAAGGGTTCCACACTGGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCCACCAGGCTGGGAAGGAAGCAGAGAAACTTGGCCAAGGGGTCAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCCACCAGGCTGGGAAGGAAGCAGAGAAACTTGGCCAAGGGGTCAACCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCTGCTGACCAGGCTGGAAAGGAAGTGGAGAAGCTTGGCCAAGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCTGCTGACCAGGCTGGAAAGGAAGTGGAGAAGCTTGGCCAAGGTGCCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CCATGCTGCTGGCCAGGCCGGGAAGGAGCTGCAGAATGCTCATAATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CCATGCTGCTGGCCAGGCCGGGAAGGAGCTGCAGAATGCTCATAATGGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TCAACCAAGCCAGCAAGGAGGCCAACCAGCTGCTGAAT         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101601 TCAACCAAGCCAGCAAGGAGGCCAACCAGCTGCTGAATGTA...CAGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AACCATCAAAGCGGATCTTCCAGCCATCAAGGAGGGGCCACAACCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103361 AACCATCAAAGCGGATCTTCCAGCCATCAAGGAGGGGCCACAACCACGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GTTAGCCTCTGGG         GCCTCGGTCAACACGCCTTTCATCAACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103411 GTTAGCCTCTGGGGTA...CAGGCCTCGGTCAACACGCCTTTCATCAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1733 TTCCCGCCCTGTGGAGG         AGCGTCGCCAACATCATGCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103555 TTCCCGCCCTGTGGAGGGTG...CAGAGCGTCGCCAACATCATGCCC