seq1 = pF1KE2791.tfa, 3495 bp
seq2 = pF1KE2791/gi568815587r_2304940.tfa (gi568815587r:2304940_2523036), 218097 bp

>pF1KE2791 3495
>gi568815587r:2304940_2523036 (Chr11)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-298  (100716-100896)   100% ->
299-465  (101839-102005)   100% ->
466-649  (102632-102815)   100% ->
650-714  (104446-104510)   100% ->
715-906  (104679-104870)   100% ->
907-1009  (105208-105310)   100% ->
1010-1128  (107013-107131)   100% ->
1129-1479  (107566-107916)   100% ->
1480-1620  (107990-108130)   100% ->
1621-1744  (108199-108322)   100% ->
1745-1890  (108831-108976)   100% ->
1891-2003  (109449-109561)   100% ->
2004-2096  (109811-109903)   100% ->
2097-2355  (110025-110283)   100% ->
2356-2474  (110784-110902)   100% ->
2475-2607  (111270-111402)   100% ->
2608-2782  (111511-111685)   100% ->
2783-2936  (115125-115278)   100% ->
2937-3118  (115737-115918)   100% ->
3119-3251  (116244-116376)   100% ->
3252-3324  (116946-117018)   100% ->
3325-3391  (117444-117510)   100% ->
3392-3495  (117994-118097)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGATGTCCAAGGCCCCCGTCCCGGAAGCCCCGGGGATGCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGATGTCCAAGGCCCCCGTCCCGGAAGCCCCGGGGATGCTGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCGGGAGCTGGGCTTGCACAGGGGCGAGGTCAACTTTGGAGGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCGGGAGCTGGGCTTGCACAGGGGCGAGGTCAACTTTGGAGGGTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAAGAAGCGAGGCAAG         TTTGTACGGGTGCCGAGCGGAGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAAGAAGCGAGGCAAGGTA...CAGTTTGTACGGGTGCCGAGCGGAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCCGTCTGTGCTCTTTGACCTGCTGCTTGCTGAGTGGCACCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100740 GCCCCGTCTGTGCTCTTTGACCTGCTGCTTGCTGAGTGGCACCTGCCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCAACCTGGTGGTGTCCCTGGTGGGTGAGGAGCAGCCTTTCGCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100790 CCCCAACCTGGTGGTGTCCCTGGTGGGTGAGGAGCAGCCTTTCGCCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCCTGGCTGCGGGATGTGCTGCGCAAGGGGCTGGTGAAGGCGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100840 AGTCCTGGCTGCGGGATGTGCTGCGCAAGGGGCTGGTGAAGGCGGCTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCACAG         GAGCCTGGATCCTGACCAGTGCCCTCCGCGTGGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100890 AGCACAGGTG...CAGGAGCCTGGATCCTGACCAGTGCCCTCCGCGTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGCCAGGCATGTCGGGCAGGCCGTGCGCGACCACTCGCTGGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 CCTGGCCAGGCATGTCGGGCAGGCCGTGCGCGACCACTCGCTGGCCAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGTCCACCAAGGTCCGTGTGGTTGCTGTCGGCATGGCCTCGCTGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101923 CGTCCACCAAGGTCCGTGTGGTTGCTGTCGGCATGGCCTCGCTGGGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCCTGCACCGCCGCATTCTGGAGGAGGCCCAG         GAGGATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101973 GTCCTGCACCGCCGCATTCTGGAGGAGGCCCAGGTG...CAGGAGGATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCCTGTCCACTACCCTGAGGATGACGGCGGCAGCCAGGGCCCCCTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102640 TCCTGTCCACTACCCTGAGGATGACGGCGGCAGCCAGGGCCCCCTCTGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CACTGGACAGCAACCTCTCCCACTTCATCCTGGTGGAGCCAGGCCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102690 CACTGGACAGCAACCTCTCCCACTTCATCCTGGTGGAGCCAGGCCCCCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGAAGGGCGATGGGCTGACGGAGCTGCGGCTGAGGCTGGAGAAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102740 GGGAAGGGCGATGGGCTGACGGAGCTGCGGCTGAGGCTGGAGAAGCACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTCGGAGCAGAGGGCGGGCTACGGGG         GCACTGGCAGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102790 CTCGGAGCAGAGGGCGGGCTACGGGGGTG...CAGGCACTGGCAGCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGATCCCTGTCCTCTGCTTGCTGGTCAATGGTGATCCCAACACCTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104461 AGATCCCTGTCCTCTGCTTGCTGGTCAATGGTGATCCCAACACCTTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715          AGGATCTCCAGGGCCGTGGAGCAGGCTGCCCCGTGGCTGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104511 GTA...CAGAGGATCTCCAGGGCCGTGGAGCAGGCTGCCCCGTGGCTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGGTAGGCTCGGGGGGCATCGCCGATGTGCTTGCTGCCCTAGTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104720 CCTGGTAGGCTCGGGGGGCATCGCCGATGTGCTTGCTGCCCTAGTGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCCCCACCTCCTGGTGCCCAAGGTGGCCGAGAAGCAGTTTAAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104770 AGCCCCACCTCCTGGTGCCCAAGGTGGCCGAGAAGCAGTTTAAGGAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCCCCAGCAAGCATTTCTCTTGGGAGGACATCGTGCGCTGGACCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104820 TTCCCCAGCAAGCATTTCTCTTGGGAGGACATCGTGCGCTGGACCAAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 G         CTGCAGAACATCACCTCACACCAGCACCTGCTCACCGTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104870 GGTA...CAGCTGCAGAACATCACCTCACACCAGCACCTGCTCACCGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATGACTTCGAGCAGGAGGGCTCCGAGGAGCTGGACACGGTCATCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105248 ATGACTTCGAGCAGGAGGGCTCCGAGGAGCTGGACACGGTCATCCTGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCGCTGGTGAAAG         CCTGCAAGAGCCACAGCCAGGAGCCTCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105298 GCGCTGGTGAAAGGTG...CAGCCTGCAAGAGCCACAGCCAGGAGCCTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGACTATCTGGATGAGCTCAAGCTGGCCGTGGCCTGGGACCGCGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107041 GGACTATCTGGATGAGCTCAAGCTGGCCGTGGCCTGGGACCGCGTGGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCGCCAAGAGTGAGATCTTCAATGGGGACGTGGAGTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107091 TCGCCAAGAGTGAGATCTTCAATGGGGACGTGGAGTGGAAGGTG...AAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCCTGTGACCTGGAGGAGGTGATGGTGGACGCCCTGGTCAGCAACAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107566 TCCTGTGACCTGGAGGAGGTGATGGTGGACGCCCTGGTCAGCAACAAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGAGTTTGTGCGCCTCTTTGTGGACAACGGCGCAGACGTGGCCGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107616 CGAGTTTGTGCGCCTCTTTGTGGACAACGGCGCAGACGTGGCCGACTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGACGTATGGGCGGCTGCAGGAGCTCTACCGCTCCGTGTCACGCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107666 TGACGTATGGGCGGCTGCAGGAGCTCTACCGCTCCGTGTCACGCAAGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGCTCTTCGACCTGCTGCAGCGGAAGCAGGAGGAGGCCCGGCTGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107716 CTGCTCTTCGACCTGCTGCAGCGGAAGCAGGAGGAGGCCCGGCTGACGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCGGCCTGGGCACCCAGCAGGCCCGGGAGCCACCCGCGGGGCCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107766 GGCCGGCCTGGGCACCCAGCAGGCCCGGGAGCCACCCGCGGGGCCACCGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCTTCTCCCTGCACGAGGTCTCCCGCGTACTCAAGGACTTCCTGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107816 CCTTCTCCCTGCACGAGGTCTCCCGCGTACTCAAGGACTTCCTGCAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GCCTGCCGAGGCTTCTACCAGGACGGCCGGCCAGGGGACCGCAGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107866 GCCTGCCGAGGCTTCTACCAGGACGGCCGGCCAGGGGACCGCAGGAGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 G         GAGAAGGGCCCGGCCAAGCGGCCCACGGGCCAGAAGTGGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107916 GGTG...CAGGAGAAGGGCCCGGCCAAGCGGCCCACGGGCCAGAAGTGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGCTGGACCTGAACCAGAAGAGCGAGAACCCCTGGCGGGACCTGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108030 TGCTGGACCTGAACCAGAAGAGCGAGAACCCCTGGCGGGACCTGTTCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TGGGCCGTGCTGCAGAACCGCCACGAGATGGCCACCTACTTCTGGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108080 TGGGCCGTGCTGCAGAACCGCCACGAGATGGCCACCTACTTCTGGGCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 G         GGCCAGGAAGGTGTGGCAGCCGCACTGGCCGCCTGCAAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108130 GGTG...TAGGGCCAGGAAGGTGTGGCAGCCGCACTGGCCGCCTGCAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCCTCAAAGAGATGTCGCACCTGGAGACGGAGGCCGAGGCGGCCCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108239 TCCTCAAAGAGATGTCGCACCTGGAGACGGAGGCCGAGGCGGCCCGAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ACGCGCGAGGCGAAATACGAGCGGCTGGCCCTTG         ACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108289 ACGCGCGAGGCGAAATACGAGCGGCTGGCCCTTGGTG...CAGACCTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CTCCGAGTGCTACAGCAACAGTGAGGCCCGCGCCTTCGCCCTGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108838 CTCCGAGTGCTACAGCAACAGTGAGGCCCGCGCCTTCGCCCTGCTGGTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GCCGGAACCGCTGCTGGAGCAAGACCACCTGCCTGCACCTGGCCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108888 GCCGGAACCGCTGCTGGAGCAAGACCACCTGCCTGCACCTGGCCACCGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GCTGACGCCAAGGCCTTCTTTGCCCACGACGGCGTTCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108938 GCTGACGCCAAGGCCTTCTTTGCCCACGACGGCGTTCAGGTG...CAGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CTTCCTGACCAGGATCTGGTGGGGGGACATGGCCGCAGGCACGCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109451 CTTCCTGACCAGGATCTGGTGGGGGGACATGGCCGCAGGCACGCCCATCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TGCGGCTGCTAGGAGCCTTCCTCTGCCCCGCCCTCGTCTATACCAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109501 TGCGGCTGCTAGGAGCCTTCCTCTGCCCCGCCCTCGTCTATACCAACCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ATCACCTTCAG         TGAGGAAGCTCCCCTGAGGACAGGCCTGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109551 ATCACCTTCAGGTG...CAGTGAGGAAGCTCCCCTGAGGACAGGCCTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GGACCTGCAGGACCTGGACAGCCTGGACACGGAGAAGAGCCCGCTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109841 GGACCTGCAGGACCTGGACAGCCTGGACACGGAGAAGAGCCCGCTGTATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GCCTGCAGAGCCG         GGTGGAGGAGCTGGTGGAGGCGCCGAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109891 GCCTGCAGAGCCGGTG...CAGGGTGGAGGAGCTGGTGGAGGCGCCGAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GCTCAGGGTGACCGAGGCCCACGTGCTGTCTTCCTGCTCACACGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110053 GCTCAGGGTGACCGAGGCCCACGTGCTGTCTTCCTGCTCACACGCTGGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GAAATTCTGGGGCGCTCCCGTGACTGTGTTCCTGGGGAACGTGGTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110103 GAAATTCTGGGGCGCTCCCGTGACTGTGTTCCTGGGGAACGTGGTCATGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 ACTTCGCCTTCCTCTTCCTGTTCACCTACGTCCTGCTGGTGGACTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110153 ACTTCGCCTTCCTCTTCCTGTTCACCTACGTCCTGCTGGTGGACTTCAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CCGCCCCCCCAGGGCCCCTCAGGGCCCGAGGTCACCCTCTACTTCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110203 CCGCCCCCCCAGGGCCCCTCAGGGCCCGAGGTCACCCTCTACTTCTGGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CTTTACGCTGGTGCTGGAGGAAATCCGGCAG         GGCTTCTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110253 CTTTACGCTGGTGCTGGAGGAAATCCGGCAGGTC...CAGGGCTTCTTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 CAGACGAGGACACACACCTGGTGAAGAAGTTCACACTGTATGTGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110794 CAGACGAGGACACACACCTGGTGAAGAAGTTCACACTGTATGTGGGGGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 AACTGGAACAAGTGTGACATGGTGGCCATCTTCCTGTTCATCGTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110844 AACTGGAACAAGTGTGACATGGTGGCCATCTTCCTGTTCATCGTGGGTGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 CACCTGCAG         GATGCTGCCGTCGGCGTTTGAGGCTGGCCGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110894 CACCTGCAGGTC...CAGGATGCTGCCGTCGGCGTTTGAGGCTGGCCGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CAGTCCTCGCCATGGACTTCATGGTGTTCACGCTGCGGCTGATCCATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111302 CAGTCCTCGCCATGGACTTCATGGTGTTCACGCTGCGGCTGATCCATATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 TTTGCCATACACAAGCAGCTGGGCCCCAAGATCATCGTGGTAGAGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111352 TTTGCCATACACAAGCAGCTGGGCCCCAAGATCATCGTGGTAGAGCGCAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 G         ATGAAGGACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTTCTGAGCGTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111402 GGTG...GAGATGAAGGACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTTCTGAGCGTGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 GGCTCGTGGCCTACGGTGTCACCACCCAGGCGCTGCTGCACCCCCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111551 GGCTCGTGGCCTACGGTGTCACCACCCAGGCGCTGCTGCACCCCCATGAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GGCCGCCTGGAGTGGATCTTCCGCCGGGTGCTCTACCGGCCCTACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111601 GGCCGCCTGGAGTGGATCTTCCGCCGGGTGCTCTACCGGCCCTACCTGCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 GATCTTCGGCCAGATCCCACTGGACGAGATTGATG         AAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 111651 GATCTTCGGCCAGATCCCACTGGACGAGATTGATGGTT...CAGAAGCCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 GTGTGAACTGCTCCACCCACCCACTGCTGCTGGAGGACTCACCATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115131 GTGTGAACTGCTCCACCCACCCACTGCTGCTGGAGGACTCACCATCCTGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 CCCAGCCTCTATGCCAACTGGCTGGTCATCCTCCTGCTGGTCACCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115181 CCCAGCCTCTATGCCAACTGGCTGGTCATCCTCCTGCTGGTCACCTTCCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 GTTGGTCACCAATGTGCTGCTCATGAACCTGCTCATCGCCATGTTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 115231 GTTGGTCACCAATGTGCTGCTCATGAACCTGCTCATCGCCATGTTCAGGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2937        CTACACGTTCCAGGTGGTGCAGGGCAACGCAGACATGTTCTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115281 G...CAGCTACACGTTCCAGGTGGTGCAGGGCAACGCAGACATGTTCTGG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 AAGTTCCAGCGCTACAACCTGATTGTGGAGTACCACGAGCGCCCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115780 AAGTTCCAGCGCTACAACCTGATTGTGGAGTACCACGAGCGCCCCGCCCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 GGCCCCGCCCTTCATCCTGCTCAGCCACCTGAGCCTGACGCTCCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115830 GGCCCCGCCCTTCATCCTGCTCAGCCACCTGAGCCTGACGCTCCGCCGGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 TCTTCAAGAAGGAGGCTGAGCACAAGCGGGAGCACCTGG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115880 TCTTCAAGAAGGAGGCTGAGCACAAGCGGGAGCACCTGGGTG...CAGAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 AGAGACCTGCCAGACCCCCTGGACCAGAAGGTCGTCACCTGGGAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116246 AGAGACCTGCCAGACCCCCTGGACCAGAAGGTCGTCACCTGGGAGACAGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 CCAGAAGGAGAACTTCCTGAGCAAGATGGAGAAGCGGAGGAGGGACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116296 CCAGAAGGAGAACTTCCTGAGCAAGATGGAGAAGCGGAGGAGGGACAGCG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 AGGGGGAGGTGCTGCGGAAAACCGCCCACAG         AGTGGACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 116346 AGGGGGAGGTGCTGCGGAAAACCGCCCACAGGTG...CAGAGTGGACTTC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3262 ATTGCCAAGTACCTCGGGGGTCTGAGAGAGCAAGAAAAGCGCATCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116956 ATTGCCAAGTACCTCGGGGGTCTGAGAGAGCAAGAAAAGCGCATCAAGTG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3312 TCTGGAGTCACAG         ATCAACTACTGCTCGGTGCTCGTGTCCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117006 TCTGGAGTCACAGGCA...CAGATCAACTACTGCTCGGTGCTCGTGTCCT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3353 CCGTGGCTGACGTGCTGGCCCAGGGTGGCGGCCCCCGGA         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 117472 CCGTGGCTGACGTGCTGGCCCAGGGTGGCGGCCCCCGGAGTA...CAGGC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3394 TCTCAGCACTGTGGCGAGGGAAGCCAGCTGGTGGCTGCTGACCACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117996 TCTCAGCACTGTGGCGAGGGAAGCCAGCTGGTGGCTGCTGACCACAGAGG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3444 TGGTTTAGATGGCTGGGAACAACCCGGGGCTGGCCAGCCTCCCTCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118046 TGGTTTAGATGGCTGGGAACAACCCGGGGCTGGCCAGCCTCCCTCGGACA

   3700 
   3494 CC
        ||
 118096 CC