seq1 = pF1KE2724.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE2724/gi568815589r_74966755.tfa (gi568815589r:74966755_75177581), 210827 bp

>pF1KE2724 597
>gi568815589r:74966755_75177581 (Chr9)

(complement)

1-29  (94467-94495)   100% ->
30-120  (100002-100092)   100% ->
121-169  (100375-100423)   100% ->
170-317  (107540-107687)   100% ->
318-389  (107769-107840)   98% ->
390-496  (108480-108586)   100% ->
497-580  (110742-110825)   100% ->
581-597  (116015-116031)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAACATTTATCATTGGAATCAGTGG         TGTGACAAACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  94467 ATGAAAACATTTATCATTGGAATCAGTGGGTG...CAGTGTGACAAACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGCAAAACAACACTGGCTAAGAATTTGCAGAAACACCTCCCAAATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 TGGCAAAACAACACTGGCTAAGAATTTGCAGAAACACCTCCCAAATTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTCATATCTCAGGATGATTTCTTCAAG         CCAGAGTCTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100064 GTGTCATATCTCAGGATGATTTCTTCAAGGTA...CAGCCAGAGTCTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATAGAGACAGATAAAAATGGATTTTTGCAGTACGATG         TGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100387 ATAGAGACAGATAAAAATGGATTTTTGCAGTACGATGGTA...AAGTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TGAAGCACTTAACATGGAAAAAATGATGTCAGCCATTTCCTGCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107544 TGAAGCACTTAACATGGAAAAAATGATGTCAGCCATTTCCTGCTGGATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAAGCGCAAGACACTCTGTGGTATCAACAGACCAGGAAAGTGCTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107594 AAAGCGCAAGACACTCTGTGGTATCAACAGACCAGGAAAGTGCTGAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATTCCCATTTTAATCATCGAAGGTTTTCTTCTTTTTAATTATAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107644 ATTCCCATTTTAATCATCGAAGGTTTTCTTCTTTTTAATTATAAGTA...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    318    GCCCCTTGACACTATATGGAATAGAAGCTATTTCCTGACGATTCCAT
        >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 107766 TAGGCCCCTTGACACTATATGGAATAGAAGCTATTTCCTGACTATTCCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAAGAATGTAAAAGGAGGAGGAG         TACAAGGGTCTATCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107816 ATGAAGAATGTAAAAGGAGGAGGAGGTA...TAGTACAAGGGTCTATCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CCTCCAGACTCTCCGGGATACTTTGATGGCCATGTGTGGCCCATGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108496 CCTCCAGACTCTCCGGGATACTTTGATGGCCATGTGTGGCCCATGTATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAAGTACAGACAAGAAATGCAGGACATCACATGGGAAGTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108546 AAAGTACAGACAAGAAATGCAGGACATCACATGGGAAGTTGGTA...TAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGTACCTGGATGGAACAAAATCTGAAGAGGACCTCTTTTTGCAAGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110742 TGTACCTGGATGGAACAAAATCTGAAGAGGACCTCTTTTTGCAAGTATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAAGATCTAATACAAGAACTAGCAAAGCAAAAGT         GTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110792 GAAGATCTAATACAAGAACTAGCAAAGCAAAAGTGTA...AAGGTTTGCA

    650     .    :
    588 AGTGACAGCA
        ||||||||||
 116022 AGTGACAGCA