seq1 = pF1KE2707.tfa, 711 bp
seq2 = pF1KE2707/gi568815580f_9814278.tfa (gi568815580f:9814278_10054193), 239916 bp

>pF1KE2707 711
>gi568815580f:9814278_10054193 (Chr18)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-211  (117533-117685)   100% ->
212-315  (121833-121936)   100% ->
316-396  (122709-122789)   100% ->
397-570  (136118-136291)   100% ->
571-711  (139776-139916)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGATCCGCCCACAGACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGATCCGCCCACAGACCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTCAAAG         GCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTCAAAGGTA...CAGGCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTGTGTTTCAAAGTGAAGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117566 AATTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTGTGTTTCAAAGTGAAGACTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCACCTCGCCGGTACTGTGTGAGGCCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117616 GCACCTCGCCGGTACTGTGTGAGGCCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTCAACTGTGACTGTTTCAG         TAATGCTACAGCCCTTTGACT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117666 GTCAACTGTGACTGTTTCAGGTA...TAGTAATGCTACAGCCCTTTGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGATCCGAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121854 ATGATCCGAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCCACCAAACACTTCAGATATGGAAGCTGTG         TGGAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 121904 GCTCCACCAAACACTTCAGATATGGAAGCTGTGGTA...TAGTGGAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCAAAACCTGATGAATTAATGGATTCCAAATTGAGATGCGTATTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122717 GGCAAAACCTGATGAATTAATGGATTCCAAATTGAGATGCGTATTTGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCCCAATGAAAATGATAAATTG         AATGATATGGAACCTAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 122767 TGCCCAATGAAAATGATAAATTGGTA...CAGAATGATATGGAACCTAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGCTGTTCCACTGAATGCATCTAAGCAAGATGGACCTATGCCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136136 AAAGCTGTTCCACTGAATGCATCTAAGCAAGATGGACCTATGCCAAAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACACAGTGTTTCACTTAATGATACCGAAACAAGGAAACTAATGGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136186 ACACAGTGTTTCACTTAATGATACCGAAACAAGGAAACTAATGGAAGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTAAAAGACTTCAGGGAGAAATGATGAAGCTATCAGAAGAAAATCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136236 GTAAAAGACTTCAGGGAGAAATGATGAAGCTATCAGAAGAAAATCGGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGAGA         GATGAAGGTTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACATTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136286 CTGAGAGTA...TAGGATGAAGGTTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACATTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCATCCTTCAGAGATAATGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139811 GGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCATCCTTCAGAGATAATGTCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139861 GTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTC

    750     .
    706 TTTCTA
        ||||||
 139911 TTTCTA