seq1 = pF1KE2690.tfa, 1629 bp
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>pF1KE2690 1629
>gi568815591f:150948886_151152744 (Chr7)

1-534  (100001-100534)   100% ->
535-685  (101221-101371)   100% ->
686-813  (101596-101723)   100% ->
814-1009  (101873-102068)   100% ->
1010-1066  (102154-102210)   100% ->
1067-1214  (102287-102434)   100% ->
1215-1306  (102925-103016)   100% ->
1307-1386  (103098-103177)   100% ->
1387-1458  (103281-103352)   100% ->
1459-1629  (103689-103859)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCCCACCTCAGGCCCAGAGGAGGCCCGGCGGCCAGCCTCGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCCCACCTCAGGCCCAGAGGAGGCCCGGCGGCCAGCCTCGGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGTGTTCGCCAGCAACTGCTCGATGCACGGGCTGGGCCACGTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGTGTTCGCCAGCAACTGCTCGATGCACGGGCTGGGCCACGTCTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCAGGCAGCCTGAGCCTGCGCCGGGGGATGTGGGCAGCGGCCGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCAGGCAGCCTGAGCCTGCGCCGGGGGATGTGGGCAGCGGCCGTGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGTCAGTGGCCACCTTCCTCTACCAGGTGGCTGAGAGGGTGCGCTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGTCAGTGGCCACCTTCCTCTACCAGGTGGCTGAGAGGGTGCGCTACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGGAGTTCCACCACCAGACTGCCCTGGATGAGCGAGAAAGCCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGGAGTTCCACCACCAGACTGCCCTGGATGAGCGAGAAAGCCACCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCTTCCCGGCTGTCACCCTGTGCAACATCAACCCACTGCGCCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCTTCCCGGCTGTCACCCTGTGCAACATCAACCCACTGCGCCGCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCCTAACGCCCAACGACCTGCACTGGGCTGGGTCTGCGCTGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCCTAACGCCCAACGACCTGCACTGGGCTGGGTCTGCGCTGCTGGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATCCCGCAGAGCACGCCGCCTTCCTGCGCGCCCTGGGCCGGCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATCCCGCAGAGCACGCCGCCTTCCTGCGCGCCCTGGGCCGGCCCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACCGCCCGGCTTCATGCCCAGTCCCACCTTTGACATGGCGCAACTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACCGCCCGGCTTCATGCCCAGTCCCACCTTTGACATGGCGCAACTCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCGTGCTGGGCACTCCCTGGATGACATGCTGCTGGACTGTCGCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCCGTGCTGGGCACTCCCTGGATGACATGCTGCTGGACTGTCGCTTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGCCAACCTTGTGGGCCTGAGAACTTCACCACG         ATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100501 TGGCCAACCTTGTGGGCCTGAGAACTTCACCACGGTG...CAGATCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCGGATGGGAAAGTGCTACACATTTAACTCTGGCGCTGATGGGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101228 CCCGGATGGGAAAGTGCTACACATTTAACTCTGGCGCTGATGGGGCAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGCTCACCACTACTAGGGGTGGCATGGGCAATGGGCTGGACATCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101278 CTGCTCACCACTACTAGGGGTGGCATGGGCAATGGGCTGGACATCATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGACGTGCAGCAGGAGGAATATCTACCTGTGTGGAGGGACAATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101328 GGACGTGCAGCAGGAGGAATATCTACCTGTGTGGAGGGACAATGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    686    AGGAGACCCCGTTTGAGGTGGGGATCCGAGTGCAGATCCACAGCCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101593 CAGAGGAGACCCCGTTTGAGGTGGGGATCCGAGTGCAGATCCACAGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAGGAGCCGCCCATCATCGATCAGCTGGGCTTGGGGGTGTCCCCGGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101643 GAGGAGCCGCCCATCATCGATCAGCTGGGCTTGGGGGTGTCCCCGGGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCAGACCTTTGTTTCTTGCCAGCAGCAGCAG         CTGAGCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101693 CCAGACCTTTGTTTCTTGCCAGCAGCAGCAGGTA...CAGCTGAGCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCCACCGCCCTGGGGCGATTGCAGTTCAGCATCTCTGAACCCCAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101883 TGCCACCGCCCTGGGGCGATTGCAGTTCAGCATCTCTGAACCCCAACTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGCCAGAGCCCTCTGATCCCCTAGGCTCCCCCAGCCCCAGCCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101933 GAGCCAGAGCCCTCTGATCCCCTAGGCTCCCCCAGCCCCAGCCCCAGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCCCTATACCCTTATGGGGTGTCGCCTGGCCTGCGAAACCCGCTACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101983 TCCCTATACCCTTATGGGGTGTCGCCTGGCCTGCGAAACCCGCTACGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTCGGAAGTGCGGCTGCCGAATGGTGTACATGCCAG         GCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102033 CTCGGAAGTGCGGCTGCCGAATGGTGTACATGCCAGGTG...CAGGCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGCCAGTGTGCAGCCCCCAGCAGTACAAGAACTGTGCCCACCCGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102159 GTGCCAGTGTGCAGCCCCCAGCAGTACAAGAACTGTGCCCACCCGGCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AG         ATGCCATGCTTCGCAAGGACTCGTGCGCCTGCCCCAACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102209 AGGTA...CAGATGCCATGCTTCGCAAGGACTCGTGCGCCTGCCCCAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CGTGCGCCAGCACGCGCTACGCCAAGGAGCTCTCCATGGTGCGGATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102326 CGTGCGCCAGCACGCGCTACGCCAAGGAGCTCTCCATGGTGCGGATCCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AGCCGCGCCGCCGCGCGCTTCCTGGCCCGGAAGCTCAACCGCAGCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102376 AGCCGCGCCGCCGCGCGCTTCCTGGCCCGGAAGCTCAACCGCAGCGAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CTACATCGC         GGAGAACGTGCTGGCCCTGGACATCTTCTTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 CTACATCGCGTG...CAGGGAGAACGTGCTGGCCCTGGACATCTTCTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGGCCCTCAACTATGAGACCGTGGAGCAGAAGAAGGCCTATGAGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102957 AGGCCCTCAACTATGAGACCGTGGAGCAGAAGAAGGCCTATGAGATGTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGCTGCTTG         GTGACATTGGGGGCCAGATGGGGCTGTTCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103007 GAGCTGCTTGGTG...CAGGTGACATTGGGGGCCAGATGGGGCTGTTCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CGGGGCCAGCCTGCTCACCATCCTCGAGATCCTAGACTACCTCTGTGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103129 CGGGGCCAGCCTGCTCACCATCCTCGAGATCCTAGACTACCTCTGTGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387         GTGTTCCGAGACAAGGTCCTGGGATATTTCTGGAACCGACAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103179 TG...CAGGTGTTCCGAGACAAGGTCCTGGGATATTTCTGGAACCGACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACTCCCAAAGGCACTCCAGCACCAATCTG         ACCTCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103323 CACTCCCAAAGGCACTCCAGCACCAATCTGGTA...AAGACCTCCCACCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCCCTGTGCCGTCACCAAGACTCTCTCCGCCTCCCACCGCACCTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103700 CTCCCTGTGCCGTCACCAAGACTCTCTCCGCCTCCCACCGCACCTGCTAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTTGTCACACAGCTCTAGACCTGCTGTCTGTGTCCTCGGAGCCCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103750 CTTGTCACACAGCTCTAGACCTGCTGTCTGTGTCCTCGGAGCCCCGCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GACATCCTGGACATGCCTAGCCTGCACGTAGCTTTTCCGTCTTCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103800 GACATCCTGGACATGCCTAGCCTGCACGTAGCTTTTCCGTCTTCACCCCA

   1700     .    :
   1620 AATAAAGTCC
        ||||||||||
 103850 AATAAAGTCC