seq1 = pF1KE2670.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KE2670/gi568815588f_49222546.tfa (gi568815588f:49222546_49427013), 204468 bp

>pF1KE2670 2133
>gi568815588f:49222546_49427013 (Chr10)

1-2073  (100001-102073)   99% <-
2074-2133  (104408-104468)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCAAGGAAATAAGAAGTGCACAGACGCGTTCAGCGACTCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCAAGGAAATAAGAAGTGCACAGACGCGTTCAGCGACTCCTCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGGCAGCGTGTTGGATGATGCAGACAGGGAGGTGAGCAGCCTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCGGCAGCGTGTTGGATGATGCAGACAGGGAGGTGAGCAGCCTAACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGGGCATTCCGGAGTTTGTGCATCTCCGAGGACACATCCTTCCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGGGCATTCCGGAGTTTGTGCATCTCCGAGGACACATCCTTCCATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTATCTGGCTGTGTCCCCGGATATCACCCGACAGGTGTTTGGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTATCTGGCTGTGTCCCCGGATATCACCCGACAGGTGTTTGGGACTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCACCAGAGAACAGTGGGCCACACCCAGAGGAAAAGTGGCATTTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCACCAGAGAACAGTGGGCCACACCCAGAGGAAAAGTGGCATTTGGAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTTACCGTCACAGGGCACGGAACATTCGGGCTGGGCGGCCACCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTTACCGTCACAGGGCACGGAACATTCGGGCTGGGCGGCCACCTTCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCTACCCAAGTACGTTCAGGGAGAGGAAAAGTACCCCAAAACCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGCTACCCAAGTACGTTCAGGGAGAGGAAAAGTACCCCAAAACCAGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCACCAACGCCAGTCCAGAGGAGACTGGAGGTGCCAGTTTCCGGCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCACCAACGCCAGTCCAGAGGAGACTGGAGGTGCCAGTTTCCGGCCTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGAGCAGCAATAAGCCTGTCTCCAAAGTATCAACACTAATTAAATCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGAGCAGCAATAAGCCTGTCTCCAAAGTATCAACACTAATTAAATCTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACAGGACCGAGAGCCAACGTTGTGAGAGCAGGCCCACTGCCAGCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACAGGACCGAGAGCCAACGTTGTGAGAGCAGGCCCACTGCCAGCAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCGGCTCTGAAAAATCCTCCCAAATTCGCTCCTCTTCCAGAAAACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCGGCTCTGAAAAATCCTCCCAAATTCGCTCCTCTTCCAGAAAACAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAACTTCTGCTTCGATTCTGCCTTTCTGACAGTCAGGAGGGTGCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAACTTCTGCTTCGATTCTGCCTTTCTGACAGTCAGGAGGGTGCCCGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAAGTTTCCAACACCCATCAGAACAGCTACCAGCCAGGCAGGAAGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAAGTTTCCAACACCCATCAGAACAGCTACCAGCCAGGCAGGAAGCACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAACAGGAGTCCTCCAAGAATCCAGAAATGGCCTGTCACGGCTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAACAGGAGTCCTCCAAGAATCCAGAAATGGCCTGTCACGGCTCCAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTTCCTCCCAGCAGCCAATGACACGGCCACCTTATGTGAGTCAAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTTCCTCCCAGCAGCCAATGACACGGCCACCTTATGTGAGTCAAAGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCTCTCCACACCACAAGCCAGTCACGGGTGAGCCTGGGAGAGGCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCTCTCCACACCACAAGCCAGTCACGGGTGAGCCTGGGAGAGGCAAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TACCTTTCTGCACAGTGAAAATAGTGCTTTTGAGTCATGGAATGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TACCTTTCTGCACAGTGAAAATAGTGCTTTTGAGTCATGGAATGCCCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACCAAAGCTGCTGGAGAGAAAGGACACAGCTGGAACCGTCCCAGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AACCAAAGCTGCTGGAGAGAAAGGACACAGCTGGAACCGTCCCAGAAAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAGCTCCCAAGCACTATGGGGACACGACCTTGCTAAGAGAACCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAGCTCCCAAGCACTATGGGGACACGACCTTGCTAAGAGAACCCTGTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCCTGAGCTCACAGTCTCTCCCTGCCAGGTCCAGGCCAGCTGCAGTCAGG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCCTGAGCGCACAGTCTCTCCCTGCCAGGTCCAGGCCAGCTGCAGTCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGAGAACAGACTCGAAGCAGGGGCTCTGTCCACATCTATACCCTGGGGG
        ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGAGAACAGACTTGCAGCAGGGGCTCTGTCCACATCTATACCCTGGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGCAGGGATCCAGGAGCCCAGGTATTTGCTGTGGAAGGAAAAGCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGCAGGGATCCAGGAGCCCAGGTATTTGCTGTGGAAGGAAAAGCTCCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTCACAACCTGATTCTCAAGAGAAGCCAGCCCAGCCCCCATGGAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTCACAACCTGATTCTCAAGAGAAGCCAGCCCAGCCCCCATGGAGGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CAAAGACTGGCAAAAAAGGGAAAGAAAGTCTACAAGATACTTTAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CAAAGACTGGCAAAAAAGGGAAAGAAAGTCTACAAGATACTTTAGAAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGACACAGACCAACCAGAGAGGCCCACCTTTGTATACAAAACACAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGACACAGACCAACCAGAGAGGCCCACCTTTGTATACAAAACACAACCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCAGGAACAGTTTTCAGAAAACAATGCTCTTGACCTGCCTGTGGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCAGGAACAGTTTTCAGAAAACAATGCTCTTGACCTGCCTGTGGAACCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGAACATTATGATCCCCCCTTTAACATCAGTAAGCTCCTGACCCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGAACATTATGATCCCCCCTTTAACATCAGTAAGCTCCTGACCCCCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATACCCAGCAAGCACGCCCTGGATTCAGCAGCCAGCCAGCCAGCAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101351 ATACCCAGCAAGCACGCCCTGGATTCAGCAGACAGCCAGCCAGCAGAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AACCCCATCACCCCCAGGACAGCTAAACGGATACCAAGAGAAGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AACCCCATCACCCCCAGGACAGCTAAACGGATACCAAGAGAAGGAGCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTGAATGTCAGTCTCGAGACAGCTACAAGTCCAAAGCCCCTAGCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTGAATGTCAGTCTCGAGACAGCTACAAGTCCAAAGCCCCTAGCCTGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TTCAACCTCAAGGACGTGCGGAAGCGTGTTAAGAGCACATACAGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TTCAACCTCAAGGACGTGCGGAAGCGTGTTAAGAGCACATACAGTTCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ACCTCTCTTGAAAGTGCTTGATGAGAAAACTAGAGGTAAGGTTGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 ACCTCTCTTGAAAGTGCTTGATGAGAAAACTAGAGGTAAGGTTGATGGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGCAAGAACCTGTGAGCAACGGTGTCATCCTCCCCAATGGGCTTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGCAAGAACCTGTGAGCAACGGTGTCATCCTCCCCAATGGGCTTGAGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AGCCCTCCAAATGAGCTTTCTAAGGAGAGACCCGCTGATGACCCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AGCCCTCCAAATGAGCTTTCTAAGGAGAGACCCGCTGATGACCCCACTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ATCACACATCAATCCCCAGAAGGACCCTACAGCTGACCCCAGTGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ATCACACATCAATCCCCAGAAGGACCCTACAGCTGACCCCAGTGAGCCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CTGCAGACAGCTATCTAACTCTTAGCACAGCTCCGACTATCGCCAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CTGCAGACAGCTATCTAACTCTTAGCACAGCTCCGACTATCGCCAAAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CCCTTCTATGTCAATGGGGAGGCTGCTGAGAGAAGCAGTTATGAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CCCTTCTATGTCAATGGGGAGGCTGCTGAGAGAAGCAGTTATGAGAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGAGGTGGAAGGAGAGTTGGAGATGGGTCCTGCCGGATCCAGCTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGAGGTGGAAGGAGAGTTGGAGATGGGTCCTGCCGGATCCAGCTGGTGTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CAGACTCCAGGGAACACCGCCCCAGGAAACACCTCTCCCTGAGGCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CAGACTCCAGGGAACACCGCCCCAGGAAACACCTCTCCCTGAGGCTTTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AATAGGGATCCTGAGCCTGGAGGGGCTACAGAGAAAATGAAGACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AATAGGGATCCTGAGCCTGGAGGGGCTACAGAGAAAATGAAGACCCACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GCTAGAGAATGGGCTCTCCAGATCTGTGTCCCAAGAGACAGAACCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GCTAGAGAATGGGCTCTCCAGATCTGTGTCCCAAGAGACAGAACCTGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 GGGAAGCAGGACTTCAGAACACA          CACACACACGATCATCA
        |||||||||||||||||||||||<<<...<<<-|||||||||||||||||
 102051 GGGAAGCAGGACTTCAGAACACACAT...CACACACACACACGATCATCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :
   2091 ACACATACTTAGCCTTTTTAGATCCATAAAGTCCAGAAGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104426 ACACATACTTAGCCTTTTTAGATCCATAAAGTCCAGAAGGCAG