Result of SIM4 for
pF1KE2667
seq1 = pF1KE2667.tfa, 3315 bp
seq2 = pF1KE2667/gi568815588r_103501819.tfa (gi568815588r:103501819_103955266), 453448 bp
>pF1KE2667 3315
>gi568815588r:103501819_103955266 (Chr10)
(complement)
1-72 (100001-100072) 100% ->
73-153 (153905-153985) 100% ->
154-229 (188098-188173) 100% ->
230-306 (219459-219535) 100% ->
307-398 (230906-230997) 100% ->
399-427 (262211-262239) 100% ->
428-472 (286615-286659) 100% ->
473-604 (294153-294284) 100% ->
605-718 (328065-328178) 100% ->
719-836 (337953-338070) 100% ->
837-1174 (342077-342414) 100% ->
1175-1224 (343637-343686) 100% ->
1225-1344 (349350-349469) 100% ->
1345-3315 (351478-353448) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCTCGCCTACTGCGTGCAGGATGCCACCGTGGTGGACGTGGAGAAGCG
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100001 ATGCTCGCCTACTGCGTGCAGGATGCCACCGTGGTGGACGTGGAGAAGCG
50 . : . : . : . : . :
51 GAGGAACCCCTCCAAGCACTAC GTATACATAATCAATGTGA
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100051 GAGGAACCCCTCCAAGCACTACGTG...CAGGTATACATAATCAATGTGA
100 . : . : . : . : . :
92 CCTGGTCTGACTCCACCTCCCAGACTATCTACCGGAGGTACAGCAAGTTC
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153924 CCTGGTCTGACTCCACCTCCCAGACTATCTACCGGAGGTACAGCAAGTTC
150 . : . : . : . : . :
142 TTTGACCTGCAG ATGCAGCTTTTGGATAAGTTTCCCATTGA
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153974 TTTGACCTGCAGGTG...CAGATGCAGCTTTTGGATAAGTTTCCCATTGA
200 . : . : . : . : . :
183 AGGTGGCCAGAAGGACCCCAAGCAAAGGATCATCCCCTTCCTCCCAG
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188127 AGGTGGCCAGAAGGACCCCAAGCAAAGGATCATCCCCTTCCTCCCAGGTA
250 . : . : . : . : . :
230 GCAAGATCCTCTTCCGCAGAAGCCACATCCGGGACGTAGCTGTG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
188177 ...CAGGCAAGATCCTCTTCCGCAGAAGCCACATCCGGGACGTAGCTGTG
300 . : . : . : . : . :
274 AAGAGACTGAAGCCCATCGATGAATACTGCCGG GCACTTGT
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219503 AAGAGACTGAAGCCCATCGATGAATACTGCCGGGTG...CAGGCACTTGT
350 . : . : . : . : . :
315 CCGGCTGCCCCCCCACATCTCACAGTGTGACGAAGTCTTCCGGTTCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
230914 CCGGCTGCCCCCCCACATCTCACAGTGTGACGAAGTCTTCCGGTTCTTCG
400 . : . : . : . : . :
365 AGGCTCGACCCGAGGATGTCAACCCTCCAAAAGA GGACTAT
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230964 AGGCTCGACCCGAGGATGTCAACCCTCCAAAAGAGTA...CAGGGACTAT
450 . : . : . : . : . :
406 GGCAGTTCCAAGAGGAAATCAG TGTGGCTGTCCAGCTGGGC
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262218 GGCAGTTCCAAGAGGAAATCAGGTA...AAGTGTGGCTGTCCAGCTGGGC
500 . : . : . : . : . :
447 TGAGTCGCCCAAGAAGGACGTGACAG GTGCCGACGCCACCG
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286634 TGAGTCGCCCAAGAAGGACGTGACAGGTA...CAGGTGCCGACGCCACCG
550 . : . : . : . : . :
488 CCGAGCCCATGATCCTGGAACAGTACGTGGTGGTGTCCAACTATAAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294168 CCGAGCCCATGATCCTGGAACAGTACGTGGTGGTGTCCAACTATAAGAAG
600 . : . : . : . : . :
538 CAGGAGAACTCGGAGCTGAGCCTCCAGGCCGGGGAGGTGGTGGATGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294218 CAGGAGAACTCGGAGCTGAGCCTCCAGGCCGGGGAGGTGGTGGATGTCAT
650 . : . : . : . : . :
588 CGAGAAGAACGAGAGCG GCTGGTGGTTCGTGAGCACTTCTG
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
294268 CGAGAAGAACGAGAGCGGTG...CAGGCTGGTGGTTCGTGAGCACTTCTG
700 . : . : . : . : . :
629 AGGAGCAGGGCTGGGTCCCTGCCACCTACCTGGAGGCCCAGAATGGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
328089 AGGAGCAGGGCTGGGTCCCTGCCACCTACCTGGAGGCCCAGAATGGTACT
750 . : . : . : . : . :
679 CGGGATGACTCCGACATCAACACCTCTAAGACTGGAGAAG A
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328139 CGGGATGACTCCGACATCAACACCTCTAAGACTGGAGAAGGTG...CAGA
800 . : . : . : . : . :
720 GGAGAAGTATGTCACCGTGCAGCCTTACACCAGCCAAAGCAAGGACGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
337954 GGAGAAGTATGTCACCGTGCAGCCTTACACCAGCCAAAGCAAGGACGAGA
850 . : . : . : . : . :
770 TTGGCTTTGAGAAGGGCGTCACAGTGGAGGTGATCCGGAAGAATCTGGAA
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338004 TTGGCTTTGAGAAGGGCGTCACAGTGGAGGTGATCCGGAAGAATCTGGAA
900 . : . : . : . : . :
820 GGCTGGTGGTATATCAG ATACCTGGGCAAAGAGGGCTGGGC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
338054 GGCTGGTGGTATATCAGGTA...CAGATACCTGGGCAAAGAGGGCTGGGC
950 . : . : . : . : . :
861 GCCAGCATCCTACCTGAAGAAGGCCAAGGATGACCTGCCAACCCGGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342101 GCCAGCATCCTACCTGAAGAAGGCCAAGGATGACCTGCCAACCCGGAAGA
1000 . : . : . : . : . :
911 AGAACCTGGCCGGCCCAGTGGAGATCATTGGGAACATCATGGAGATCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342151 AGAACCTGGCCGGCCCAGTGGAGATCATTGGGAACATCATGGAGATCAGC
1050 . : . : . : . : . :
961 AACCTGCTGAACAAGAAGGCGTCTGGGGACAAGGAAACTCCACCAGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342201 AACCTGCTGAACAAGAAGGCGTCTGGGGACAAGGAAACTCCACCAGCCGA
1100 . : . : . : . : . :
1011 AGGCGAGGGCCATGAGGCCCCCATTGCCAAGAAGGAGATCAGCCTGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342251 AGGCGAGGGCCATGAGGCCCCCATTGCCAAGAAGGAGATCAGCCTGCCCA
1150 . : . : . : . : . :
1061 TCCTCTGCAATGCCTCCAATGGCAGTGCCGTGGGCGTTCCTGACAGGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342301 TCCTCTGCAATGCCTCCAATGGCAGTGCCGTGGGCGTTCCTGACAGGACT
1200 . : . : . : . : . :
1111 GTCTCCAGGCTGGCCCAGGGCTCTCCAGCTGTGGCCAGGATTGCCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
342351 GTCTCCAGGCTGGCCCAGGGCTCTCCAGCTGTGGCCAGGATTGCCCCTCA
1250 . : . : . : . : . :
1161 GCGGGCCCAGATCA GCTCCCCGAACCTACGGACAAGACCTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
342401 GCGGGCCCAGATCAGTA...TAGGCTCCCCGAACCTACGGACAAGACCTC
1300 . : . : . : . : . :
1202 CACCACGCAGAGAATCCAGCCTG GGGTTCCAACTGCCAAAG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
343664 CACCACGCAGAGAATCCAGCCTGGTA...TAGGGGTTCCAACTGCCAAAG
1350 . : . : . : . : . :
1243 CCACCAGAGCCCCCTTCTGTTGAGGTGGAGTACTACACCATTGCCGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349368 CCACCAGAGCCCCCTTCTGTTGAGGTGGAGTACTACACCATTGCCGAATT
1400 . : . : . : . : . :
1293 CCAGTCGTGCATTTCCGATGGCATCAGCTTTCGGGGTGGACAGAAGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349418 CCAGTCGTGCATTTCCGATGGCATCAGCTTTCGGGGTGGACAGAAGGCAG
1450 . : . : . : . : . :
1343 AG GTCATTGATAAGAACTCAGGTGGCTGGTGGTACGTGCAG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349468 AGGTA...CAGGTCATTGATAAGAACTCAGGTGGCTGGTGGTACGTGCAG
1500 . : . : . : . : . :
1384 ATCGGTGAGAAGGAGGGCTGGGCCCCCGCATCATACATCGATAAGCGCAA
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351517 ATCGGTGAGAAGGAGGGCTGGGCCCCCGCATCATACATCGATAAGCGCAA
1550 . : . : . : . : . :
1434 GAAGCCCAACCTGAGCCGCCGCACAAGCACGCTGACCCGGCCCAAGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351567 GAAGCCCAACCTGAGCCGCCGCACAAGCACGCTGACCCGGCCCAAGGTGC
1600 . : . : . : . : . :
1484 CCCCGCCAGCACCCCCCAGCAAGCCCAAGGAGGCCGAGGAGGGCCCTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351617 CCCCGCCAGCACCCCCCAGCAAGCCCAAGGAGGCCGAGGAGGGCCCTACG
1650 . : . : . : . : . :
1534 GGGGCCAGTGAGAGCCAGGACTCCCCGCGGAAGCTCAAGTATGAGGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351667 GGGGCCAGTGAGAGCCAGGACTCCCCGCGGAAGCTCAAGTATGAGGAGCC
1700 . : . : . : . : . :
1584 TGAGTATGACATCCCTGCATTCGGCTTTGACTCAGAGCCTGAGCTGAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351717 TGAGTATGACATCCCTGCATTCGGCTTTGACTCAGAGCCTGAGCTGAGCG
1750 . : . : . : . : . :
1634 AGGAGCCCGTGGAGGACAGAGCCTCAGGGGAGAGGCGGCCTGCCCAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351767 AGGAGCCCGTGGAGGACAGAGCCTCAGGGGAGAGGCGGCCTGCCCAGCCC
1800 . : . : . : . : . :
1684 CACCGGCCCTCGCCGGCCTCTTCTCTGCAGCGGGCCCGCTTCAAGGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351817 CACCGGCCCTCGCCGGCCTCTTCTCTGCAGCGGGCCCGCTTCAAGGTGGG
1850 . : . : . : . : . :
1734 TGAGTCTTCAGAGGATGTGGCCCTGGAAGAGGAGACCATCTATGAGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351867 TGAGTCTTCAGAGGATGTGGCCCTGGAAGAGGAGACCATCTATGAGAATG
1900 . : . : . : . : . :
1784 AGGGCTTCCGGCCATATGCAGAGGACACCCTGTCAGCCAGAGGCTCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351917 AGGGCTTCCGGCCATATGCAGAGGACACCCTGTCAGCCAGAGGCTCCTCC
1950 . : . : . : . : . :
1834 GGGGACAGCGACTCCCCAGGCAGCTCCTCGCTGTCCCTGACCAGGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351967 GGGGACAGCGACTCCCCAGGCAGCTCCTCGCTGTCCCTGACCAGGAAAAA
2000 . : . : . : . : . :
1884 CTCCCCCAAATCAGGCTCCCCCAAGTCATCATCACTCCTAAAGCTCAAGG
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352017 CTCCCCCAAATCAGGCTCCCCCAAGTCATCATCACTCCTAAAGCTCAAGG
2050 . : . : . : . : . :
1934 CAGAGAAGAATGCCCAGGCAGAAATGGGGAAGAACCACTCCTCAGCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352067 CAGAGAAGAATGCCCAGGCAGAAATGGGGAAGAACCACTCCTCAGCCTCC
2100 . : . : . : . : . :
1984 TTTTCCTCATCCATCACCATCAACACCACTTGCTGCTCCTCCTCTTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352117 TTTTCCTCATCCATCACCATCAACACCACTTGCTGCTCCTCCTCTTCCTC
2150 . : . : . : . : . :
2034 CTCCTCCTCTTCCTTGTCCAAAACCAGTGGCGACCTGAAGCCCCGCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352167 CTCCTCCTCTTCCTTGTCCAAAACCAGTGGCGACCTGAAGCCCCGCTCTG
2200 . : . : . : . : . :
2084 CTTCGGACGCAGGCATCCGCGGCACTCCCAAGGTCAGGGCAAAGAAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352217 CTTCGGACGCAGGCATCCGCGGCACTCCCAAGGTCAGGGCAAAGAAGGAT
2250 . : . : . : . : . :
2134 GCTGATGCGAACGCTGGGCTGACCTCCTGTCCCCGGGCCAAGCCATCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352267 GCTGATGCGAACGCTGGGCTGACCTCCTGTCCCCGGGCCAAGCCATCGGT
2300 . : . : . : . : . :
2184 CCGGCCCAAGCCATTCCTAAACCGAGCAGAGTCGCAGAGCCAAGAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352317 CCGGCCCAAGCCATTCCTAAACCGAGCAGAGTCGCAGAGCCAAGAGAAGA
2350 . : . : . : . : . :
2234 TGGACATCAGCACTTTACGGCGCCAGCTGAGACCCACAGGCCAGCTCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352367 TGGACATCAGCACTTTACGGCGCCAGCTGAGACCCACAGGCCAGCTCCGT
2400 . : . : . : . : . :
2284 GGAGGGCTCAAGGGCTCCAAGAGTGAGGATTCGGAGCTGCCCCCGCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352417 GGAGGGCTCAAGGGCTCCAAGAGTGAGGATTCGGAGCTGCCCCCGCAGAC
2450 . : . : . : . : . :
2334 GGCCTCCGAGGCTCCCAGTGAGGGGTCTAGGAGAAGCTCATCCGACCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352467 GGCCTCCGAGGCTCCCAGTGAGGGGTCTAGGAGAAGCTCATCCGACCTCA
2500 . : . : . : . : . :
2384 TCACCCTCCCAGCCACCACTCCCCCATGTCCCACCAAGAAGGAATGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352517 TCACCCTCCCAGCCACCACTCCCCCATGTCCCACCAAGAAGGAATGGGAA
2550 . : . : . : . : . :
2434 GGGCCAGCCACCTCGTACATGACATGCAGCGCCTACCAGAAGGTCCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352567 GGGCCAGCCACCTCGTACATGACATGCAGCGCCTACCAGAAGGTCCAGGA
2600 . : . : . : . : . :
2484 CTCGGAGATCAGCTTCCCCGCGGGCGTGGAGGTGCAGGTGCTGGAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352617 CTCGGAGATCAGCTTCCCCGCGGGCGTGGAGGTGCAGGTGCTGGAGAAGC
2650 . : . : . : . : . :
2534 AGGAGAGCGGGTGGTGGTATGTGAGGTTTGGGGAGCTGGAGGGCTGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352667 AGGAGAGCGGGTGGTGGTATGTGAGGTTTGGGGAGCTGGAGGGCTGGGCC
2700 . : . : . : . : . :
2584 CCTTCCCACTATTTGGTGCTGGATGAGAACGAGCAACCTGACCCCTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352717 CCTTCCCACTATTTGGTGCTGGATGAGAACGAGCAACCTGACCCCTCTGG
2750 . : . : . : . : . :
2634 CAAAGAGCTGGACACAGTGCCCGCCAAGGGCAGGCAGAACGAAGGCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352767 CAAAGAGCTGGACACAGTGCCCGCCAAGGGCAGGCAGAACGAAGGCAAAT
2800 . : . : . : . : . :
2684 CAGACAGCCTGGAGAAGATCGAGAGGCGCGTCCAAGCACTGAACACCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352817 CAGACAGCCTGGAGAAGATCGAGAGGCGCGTCCAAGCACTGAACACCGTC
2850 . : . : . : . : . :
2734 AACCAGAGCAAGAAGGCCACGCCCCCCATCCCCTCCAAACCTCCCGGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352867 AACCAGAGCAAGAAGGCCACGCCCCCCATCCCCTCCAAACCTCCCGGGGG
2900 . : . : . : . : . :
2784 CTTCGGCAAGACCTCAGGCACTCCAGCGGTGAAGATGAGGAACGGAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352917 CTTCGGCAAGACCTCAGGCACTCCAGCGGTGAAGATGAGGAACGGAGTGC
2950 . : . : . : . : . :
2834 GGCAGGTGGCGGTCAGGCCCCAGTCGGTGTTTGTGTCCCCGCCACCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352967 GGCAGGTGGCGGTCAGGCCCCAGTCGGTGTTTGTGTCCCCGCCACCCAAG
3000 . : . : . : . : . :
2884 GACAACAACCTGTCCTGCGCCCTGCGGAGGAATGAGTCACTCACGGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353017 GACAACAACCTGTCCTGCGCCCTGCGGAGGAATGAGTCACTCACGGCCAC
3050 . : . : . : . : . :
2934 TGATGGCCTCCGAGGCGTCCGACGGAACTCCTCCTTTAGCACTGCTCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353067 TGATGGCCTCCGAGGCGTCCGACGGAACTCCTCCTTTAGCACTGCTCGCT
3100 . : . : . : . : . :
2984 CCGCTGCCGCCGAGGCCAAGGGCCGCCTGGCCGAACGGGCTGCCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353117 CCGCTGCCGCCGAGGCCAAGGGCCGCCTGGCCGAACGGGCTGCCAGCCAG
3150 . : . : . : . : . :
3034 GGTTCAGACTCACCCCTACTGCCCGCCCAGCGCAACAGCATACCCGTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353167 GGTTCAGACTCACCCCTACTGCCCGCCCAGCGCAACAGCATACCCGTGTC
3200 . : . : . : . : . :
3084 CCCTGTGCGCCCCAAGCCCATCGAGAAGTCTCAGTTCATCCACAATAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353217 CCCTGTGCGCCCCAAGCCCATCGAGAAGTCTCAGTTCATCCACAATAACC
3250 . : . : . : . : . :
3134 TCAAAGATGTGTACGTCTCTATCGCAGACTACGAGGGGGATGAGGAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353267 TCAAAGATGTGTACGTCTCTATCGCAGACTACGAGGGGGATGAGGAGACA
3300 . : . : . : . : . :
3184 GCAGGCTTCCAGGAGGGGGTGTCCATGGAGGTTCTGGAGAGGAACCCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353317 GCAGGCTTCCAGGAGGGGGTGTCCATGGAGGTTCTGGAGAGGAACCCTAA
3350 . : . : . : . : . :
3234 TGGCTGGTGGTACTGCCAGATCCTGGATGGTGTGAAGCCCTTCAAAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
353367 TGGCTGGTGGTACTGCCAGATCCTGGATGGTGTGAAGCCCTTCAAAGGCT
3400 . : . : . :
3284 GGGTGCCTTCCAACTACCTTGAGAAAAAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||
353417 GGGTGCCTTCCAACTACCTTGAGAAAAAGAAC