seq1 = pF1KE2639.tfa, 2160 bp
seq2 = pF1KE2639/gi568815583r_43133194.tfa (gi568815583r:43133194_43360581), 227388 bp

>pF1KE2639 2160
>gi568815583r:43133194_43360581 (Chr15)

(complement)

1-190  (99996-100182)   97% ->
191-436  (100285-100530)   99% ->
437-555  (103896-104014)   100% ->
556-684  (106948-107076)   100% ->
685-862  (107646-107823)   100% ->
863-1001  (119592-119730)   99% ->
1002-1105  (121316-121419)   100% ->
1106-1345  (121526-121765)   100% ->
1346-1714  (124745-125113)   100% ->
1715-1875  (125653-125813)   100% ->
1876-2009  (126895-127028)   100% ->
2010-2160  (127238-127388)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAAGGGCTAGAAGTGGCCCTCACAGACCTCCAGAGCTCCAGAAA
        || |--||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATTG  CA GGGCTAGAAGTGGCCCTCACAGACCTCCAGAGCTCCAGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATGTGCGGCACCACACGGAGGAGATCACTGTGGACCACCTGCTTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 TAATGTGCGGCACCACACGGAGGAGATCACTGTGGACCACCTGCTTGTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCGGGGCCAGGCCTTCAACCTCACCCTGTACTTCAGGAACCGGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100093 GCCGGGGCCAGGCCTTCAACCTCACCCTGTACTTCAGGAACCGGAGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCCAGGCCTGGACAACATCATCTTCGTGGTTGAAACTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100143 CAGCCAGGCCTGGACAACATCATCTTCGTGGTTGAAACTGGTA...TAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCGCTGCCAGACCTGGCCTTGGGGACTCGGGCTGTGTTCAGCCTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100286 ACCGCTGCCAGACCTGGCCTTGGGGACTCGGGCTGTGTTCAGCCTGGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCATCACAGCCCCAGCCCCTGGATTGCCTGGCTGGAGACCAATGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100336 GCCATCACAGCCCCAGCCCCTGGATTGCCTGGCTGGAGACCAATGGGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCTCCACAGAGGTGAGCTTGTGCGCTCCTCCCAAGGCGGCCGTGGGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100386 ACCTCCACAGAGGTGAGCTTGTGCGCTCCTCCCACGGCGGCCGTGGGTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTACCTCTTGAAAATCCACATCGACTCCTTCCAGGGGTCTGTGACGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100436 GTACCTCTTGAAAATCCACATCGACTCCTTCCAGGGGTCTGTGACGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCAGCTAGGGGAGTTCATCCTGCTTTTCAATCCCTGGTGCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100486 ACCAGCTAGGGGAGTTCATCCTGCTTTTCAATCCCTGGTGCCCAGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    437     AGGATGCTGTCTACTTGGACAGTGAACCCCAGAGGCAGGAGTATGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100536 .TAGAGGATGCTGTCTACTTGGACAGTGAACCCCAGAGGCAGGAGTATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATGAATGATTATGGCTTCATCTACCAAGGCAGCAAGAACTGGATCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103942 CATGAATGATTATGGCTTCATCTACCAAGGCAGCAAGAACTGGATCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CATGTCCCTGGAACTATGGACAG         TTTGAAGACAAAATCATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103992 CATGTCCCTGGAACTATGGACAGGTG...AAGTTTGAAGACAAAATCATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACATCTGCCTGAAGCTGCTAGACAAGAGCCTGCACTTCCAGACTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106966 GACATCTGCCTGAAGCTGCTAGACAAGAGCCTGCACTTCCAGACTGACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGCCACAGACTGTGCTCTGCGGGGAAGCCCCGTCTACGTCAGCAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107016 AGCCACAGACTGTGCTCTGCGGGGAAGCCCCGTCTACGTCAGCAGAGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGTGTGCCATG         ATCAACAGCAATGATGATAATGGGGTGCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 107066 TGTGTGCCATGGTG...CAGATCAACAGCAATGATGATAATGGGGTGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATGGAAACTGGAGTGAGAATTACACAGACGGCGCCAACCCTGCGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107676 AATGGAAACTGGAGTGAGAATTACACAGACGGCGCCAACCCTGCGGAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GACGGGCAGCGTGGCCATCCTGAAGCAGTGGAACGCCACAGGCTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107726 GACGGGCAGCGTGGCCATCCTGAAGCAGTGGAACGCCACAGGCTGCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCGTGCGCTACGGGCAATGCTGGGTCTTTGCTGCCGTCATGTGCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107776 CCGTGCGCTACGGGCAATGCTGGGTCTTTGCTGCCGTCATGTGCACAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    863        TGATGAGGTGTCTGGGGATCCCTACCCGTGTGATCACCAACTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107826 A...CAGTGATGAGGTGTCTGGGGATCCCTACCCGTGTGATCACCAACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGACTCTGGCCACGATACAGATGGAAACCTGATCATAGATGAGTACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 119635 CGACTCTGGCCACGATACAGATGGAAACCTGATCATAGATGAGTATTATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACAACACAGGCAGGATTTTGGGGAATAAGAAGAAGGATACTATCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 119685 ACAACACAGGCAGGATTTTGGGGAATAAGAAGAAGGATACTATCTGGTG.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002      GAACTTCCATGTCTGGAATGAGTGCTGGATGGCCCGGAAGGATCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119735 ..CAGGAACTTCCATGTCTGGAATGAGTGCTGGATGGCCCGGAAGGATCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCCCCCTGCATATGGAGGCTGGCAGGTGCTGGACGCCACACCTCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121361 GCCCCCTGCATATGGAGGCTGGCAGGTGCTGGACGCCACACCTCAGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGAGCAACG         GCGTCTACTGCTGTGGCCCTGCCTCTGTCAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121411 TGAGCAACGGTG...CAGGCGTCTACTGCTGTGGCCCTGCCTCTGTCAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCCATCAAAGAAGGAGAAGTGGACCTGAACTATGACACGCCCTTTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121558 GCCATCAAAGAAGGAGAAGTGGACCTGAACTATGACACGCCCTTTGTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TTCGATGGTGAATGCTGACTGCATGTCCTGGCTCGTCCAGGGAGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121608 TTCGATGGTGAATGCTGACTGCATGTCCTGGCTCGTCCAGGGAGGGAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGCAGAAGCTTCACCAGGACACGAGTTCTGTTGGCAATTTTATCAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121658 AGCAGAAGCTTCACCAGGACACGAGTTCTGTTGGCAATTTTATCAGCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AAGAGCATCCAGAGTGACGAGCGGGATGACATCACAGAGAACTACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121708 AAGAGCATCCAGAGTGACGAGCGGGATGACATCACAGAGAACTACAAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGAAGAAG         GATCCCTCCAGGAGAGGCAGGTGTTTCTGAAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121758 TGAAGAAGGTA...CAGGATCCCTCCAGGAGAGGCAGGTGTTTCTGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CTCTGCAGAAGCTGAAGGCTAGAAGCTTCCATGGCTCCCAAAGAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124778 CTCTGCAGAAGCTGAAGGCTAGAAGCTTCCATGGCTCCCAAAGAGGAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GAGTTGCAACCTTCCAGGCCCACATCACTGAGCCAGGACAGCCCTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124828 GAGTTGCAACCTTCCAGGCCCACATCACTGAGCCAGGACAGCCCTCGGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CCTGCATACACCTTCCCTTCGACCCAGTGATGTGGTGCAAGTCTCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124878 CCTGCATACACCTTCCCTTCGACCCAGTGATGTGGTGCAAGTCTCCCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AATTCAAGCTGCTCGACCCGCCCAACATGGGCCAGGATATATGCTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124928 AATTCAAGCTGCTCGACCCGCCCAACATGGGCCAGGATATATGCTTTGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CTGCTGGCCCTCAACATGTCCTCCCAGTTCAAGGACCTCAAAGTGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124978 CTGCTGGCCCTCAACATGTCCTCCCAGTTCAAGGACCTCAAAGTGAACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GAGTGCCCAGTCTCTGCTGCACGATGGCAGCCCCCTGTCCCCATTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125028 GAGTGCCCAGTCTCTGCTGCACGATGGCAGCCCCCTGTCCCCATTCTGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AGGACACAGCGTTCATCACACTCTCTCCTAAAGAAG         CAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 125078 AGGACACAGCGTTCATCACACTCTCTCCTAAAGAAGGTA...TAGCAAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ACCTACCCCTGCAAAATCTCCTATTCCCAGTACAGCCAGTACCTGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125658 ACCTACCCCTGCAAAATCTCCTATTCCCAGTACAGCCAGTACCTGTCAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 AGACAAGCTGATCCGCATCAGTGCCCTGGGTGAAGAGAAAAGCAGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125708 AGACAAGCTGATCCGCATCAGTGCCCTGGGTGAAGAGAAAAGCAGTCCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AGAAAATCCTGGTGAACAAGATCATCACCTTATCTTATCCAAGCATCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125758 AGAAAATCCTGGTGAACAAGATCATCACCTTATCTTATCCAAGCATCACG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 ATTAAT         GTTCTAGGAGCAGCCGTTGTGAACCAGCCACTCTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125808 ATTAATGTA...TAGGTTCTAGGAGCAGCCGTTGTGAACCAGCCACTCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CATACAGGTGATATTTTCAAACCCCCTCTCGGAGCAGGTTGAGGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126930 CATACAGGTGATATTTTCAAACCCCCTCTCGGAGCAGGTTGAGGACTGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 TGCTGACTGTGGAAGGAAGTGGCCTCTTCAAGAAACAGCAGAAAGTCTT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 126980 TGCTGACTGTGGAAGGAAGTGGCCTCTTCAAGAAACAGCAGAAAGTCTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2010         CCTTGGAGTCCTCAAACCCCAACACCAAGCAAGCATCATTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127030 TA...CAGCCTTGGAGTCCTCAAACCCCAACACCAAGCAAGCATCATTCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 GGAGACCGTCCCCTTCAAGAGTGGACAAAGGCAGATCCAAGCTAATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127280 GGAGACCGTCCCCTTCAAGAGTGGACAAAGGCAGATCCAAGCTAATATGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 GAAGCAACAAGTTTAAGGACATTAAGGGTTACAGGAATGTTTATGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127330 GAAGCAACAAGTTTAAGGACATTAAGGGTTACAGGAATGTTTATGTAGAC

   2250     .
   2152 TTTGCATTA
        |||||||||
 127380 TTTGCATTA