seq1 = pF1KE2638.tfa, 792 bp
seq2 = pF1KE2638/gi568815576r_32314306.tfa (gi568815576r:32314306_32542732), 228427 bp

>pF1KE2638 792
>gi568815576r:32314306_32542732 (Chr22)

(complement)

1-36  (97063-97098)   100% ->
37-97  (100002-100062)   100% ->
98-189  (104882-104973)   100% ->
190-366  (106853-107029)   100% ->
367-420  (108961-109014)   100% ->
421-488  (111319-111386)   100% ->
489-531  (123329-123371)   100% ->
532-595  (125585-125648)   100% ->
596-672  (126742-126818)   100% ->
673-792  (128308-128427)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAACCCATTTTAAAGAACTTAAATGAAATG         CTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  97063 ATGGAGAAACCCATTTTAAAGAACTTAAATGAAATGGTG...CAGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCCATTATTGCAAGTGAAGTCAAAGCGCTAAATGCCAACCTCAGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 TCCCATTATTGCAAGTGAAGTCAAAGCGCTAAATGCCAACCTCAGCACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAGG         TTTTAACCAAGATTGACAACTACACTCTGCTGGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 TGGAGGGTG...TAGTTTTAACCAAGATTGACAACTACACTCTGCTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TACTCCCTAATCAGTTCTCCAGAAATTACTGAGAACTACCTTGACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104917 TACTCCCTAATCAGTTCTCCAGAAATTACTGAGAACTACCTTGACCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTGAAG         GGTGTATTCTACCCACTGGAAAACCTCACCGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104967 CTTGAAGGTA...CAGGGTGTATTCTACCCACTGGAAAACCTCACCGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCCCCTTCTCACCAGTTCCTTTTGTGCTCCCAGAACGCAGCAACTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106887 CCCCCTTCTCACCAGTTCCTTTTGTGCTCCCAGAACGCAGCAACTCCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTCTACATTGGAATCGCCGAGTATTTCTTTAAATCTGCGTCCTTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106937 CTCTACATTGGAATCGCCGAGTATTTCTTTAAATCTGCGTCCTTTGCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTCACAGCTGGGGTTTTCAATGTCACTCTCTCCACCGAAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106987 TTTCACAGCTGGGGTTTTCAATGTCACTCTCTCCACCGAAGAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   ATTTCCAACCATTTTGTTCAAAACTCTCAAGGCCTTGGCAACGTGCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108959 AGATTTCCAACCATTTTGTTCAAAACTCTCAAGGCCTTGGCAACGTGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCCCGG         GTTGCTAGTACCAGTGTTGGCCTGGTTATTTTGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109009 TCCCGGGTA...TAGGTTGCTAGTACCAGTGTTGGCCTGGTTATTTTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ACAAAGACTGGTCTGCTCCTTGTCTCTGAACAG         ATTCCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 111354 ACAAAGACTGGTCTGCTCCTTGTCTCTGAACAGGTA...TAGATTCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTGCTTTGCCAGAGTCCAATCGCAGCAACATTGAG         GTCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123337 TTGCTTTGCCAGAGTCCAATCGCAGCAACATTGAGGTA...TAGGTCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 AGGTTTGAAAATATTCTATCGTCCATTCTTCACTTTGGAGTCCTCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125591 AGGTTTGAAAATATTCTATCGTCCATTCTTCACTTTGGAGTCCTCCCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGCCAATG         CAAAATTGCAGCAAGGATTTCCTCTGTCCAATC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125641 GGCCAATGGTA...TAGCAAAATTGCAGCAAGGATTTCCTCTGTCCAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CACACAAATTCTTATTCGTCAATTCAGATATTGAAGTTCTTGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 126775 CACACAAATTCTTATTCGTCAATTCAGATATTGAAGTTCTTGAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    673    GGTTTCCTTTTGATTTCCACCGACCTGAAGTATGAAACATCCTCAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128305 CAGGGTTTCCTTTTGATTTCCACCGACCTGAAGTATGAAACATCCTCAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GCAGCAGCCAAGTTTCCACGTATGGGAAGGTCTGAACCTGATAAGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128355 GCAGCAGCCAAGTTTCCACGTATGGGAAGGTCTGAACCTGATAAGCAGAC

    850     .    :    .    :
    770 AGTGGAGGGGGAAGTCAGCCCCT
        |||||||||||||||||||||||
 128405 AGTGGAGGGGGAAGTCAGCCCCT