seq1 = pF1KE2627.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KE2627/gi568815586f_49850831.tfa (gi568815586f:49850831_50055605), 204775 bp

>pF1KE2627 813
>gi568815586f:49850831_50055605 (Chr12)

1-360  (100001-100360)   100% ->
361-525  (103325-103489)   100% ->
526-606  (103800-103880)   100% ->
607-813  (104569-104775)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGAGCTCCGCTCCATAGCCTTCTCCAGGGCTGTGTTCGCAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGAGCTCCGCTCCATAGCCTTCTCCAGGGCTGTGTTCGCAGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCCACACTCCTCTTCGTCTTCTTTGGCCTCGGCTCTGCCCTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGCCACACTCCTCTTCGTCTTCTTTGGCCTCGGCTCTGCCCTCAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCACAGGCCCTGCCCTCTGTGCTACAGATTGCCATGGCGTTTGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCACAGGCCCTGCCCTCTGTGCTACAGATTGCCATGGCGTTTGGCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTATTGGCACCCTGGTACAGGCTCTGGGCCACATAAGCGGGGCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTATTGGCACCCTGGTACAGGCTCTGGGCCACATAAGCGGGGCCCACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCCTGCCGTGACTGTGGCCTGCCTGGTGGGCTGCCACGTCTCCGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCCTGCCGTGACTGTGGCCTGCCTGGTGGGCTGCCACGTCTCCGTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGAGCCGCCTTCTACGTGGCTGCCCAGCTGCTGGGGGCTGTGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCGAGCCGCCTTCTACGTGGCTGCCCAGCTGCTGGGGGCTGTGGCCGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGCTCTGCTCCATGAGATCACGCCAGCAGACATCCGCGGGGACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCGCTCTGCTCCATGAGATCACGCCAGCAGACATCCGCGGGGACCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTCAATGCT         CTCAGCAACAGCACGACGGCTGGCCAGGCGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTCAATGCTGTG...CAGCTCAGCAACAGCACGACGGCTGGCCAGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGACTGTGGAGCTCTTCCTGACACTGCAGCTGGTGCTCTGCATCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103356 TGACTGTGGAGCTCTTCCTGACACTGCAGCTGGTGCTCTGCATCTTCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCACCGATGAGCGCCGCGGAGAGAACCCGGGCACCCCTGCTCTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103406 TCCACCGATGAGCGCCGCGGAGAGAACCCGGGCACCCCTGCTCTCTCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGGCTTCTCTGTGGCCCTGGGCCACCTCCTTGGG         ATCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103456 AGGCTTCTCTGTGGCCCTGGGCCACCTCCTTGGGGTA...CAGATCCATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACACCGGCTGCTCTATGAATCCTGCCCGCTCCCTGGCTCCAGCTGTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103807 ACACCGGCTGCTCTATGAATCCTGCCCGCTCCCTGGCTCCAGCTGTCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACTGGCAAATTTGATGACCACTGG         GTCTTCTGGATCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103857 ACTGGCAAATTTGATGACCACTGGGTA...CAGGTCTTCTGGATCGGACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTGGTGGGCGCCATCCTGGGCTCCCTCCTCTACAACTACGTGCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104586 CCTGGTGGGCGCCATCCTGGGCTCCCTCCTCTACAACTACGTGCTGTTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CGCCAGCCAAGAGCCTGTCGGAGCGCCTGGCAGTGCTGAAGGGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104636 CGCCAGCCAAGAGCCTGTCGGAGCGCCTGGCAGTGCTGAAGGGCCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCGGACACCGATTGGGAGGAGCGCGAGGTGCGACGGCGGCAGTCGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104686 CCGGACACCGATTGGGAGGAGCGCGAGGTGCGACGGCGGCAGTCGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCTGCACTCGCCGCAGAGCCTGCCACGGGGTACCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104736 GCTGCACTCGCCGCAGAGCCTGCCACGGGGTACCAAGGCC