seq1 = pF1KE2615.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KE2615/gi568815581r_7569612.tfa (gi568815581r:7569612_7776251), 206640 bp

>pF1KE2615 1062
>gi568815581r:7569612_7776251 (Chr17)

(complement)

1-258  (100001-100258)   99% ->
259-442  (101016-101199)   100% ->
443-555  (101281-101393)   100% ->
556-665  (101962-102071)   100% ->
666-802  (102415-102551)   100% ->
803-876  (102644-102717)   100% ->
877-983  (105537-105643)   100% ->
984-1062  (106562-106640)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGATTTGATGCTGTCCCCGGACGATATTGAACAATGGTTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGATTTGATGCTGTCCCCGGACGATATTGAACAATGGTTCACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACCCAGGTCCAGATGAAGCTCCCAGAATGCCAGAGGCTGCTCCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100051 AGACCCAGGTCCAGATGAAGCTCCCAGAATGCCAGAGGCTGCTCCCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCCCTGCACCAGCAGCTCCTACACCGGCGGCCCCTGCACCAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCCCTGCACCAGCAGCTCCTACACCGGCGGCCCCTGCACCAGCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGGCCCCTGTCATCTTCTGTCCCTTCCCAGAAAACCTACCAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTGGCCCCTGTCATCTTCTGTCCCTTCCCAGAAAACCTACCAGGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACGGTTTCCGTCTGGGCTTCTTGCATTCTGGGACAGCCAAGTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACGGTTTCCGTCTGGGCTTCTTGCATTCTGGGACAGCCAAGTCTGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTGCACG         TACTCCCCTGCCCTCAACAAGATGTTTTGCCAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTGCACGGTC...CAGTACTCCCCTGCCCTCAACAAGATGTTTTGCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGCCAAGACCTGCCCTGTGCAGCTGTGGGTTGATTCCACACCCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 CTGGCCAAGACCTGCCCTGTGCAGCTGTGGGTTGATTCCACACCCCCGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGGCACCCGCGTCCGCGCCATGGCCATCTACAAGCAGTCACAGCACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101099 CGGCACCCGCGTCCGCGCCATGGCCATCTACAAGCAGTCACAGCACATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGAGGTTGTGAGGCGCTGCCCCCACCATGAGCGCTGCTCAGATAGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101149 CGGAGGTTGTGAGGCGCTGCCCCCACCATGAGCGCTGCTCAGATAGCGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 G         GTCTGGCCCCTCCTCAGCATCTTATCCGAGTGGAAGGAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101199 GGTG...TAGGTCTGGCCCCTCCTCAGCATCTTATCCGAGTGGAAGGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTTGCGTGTGGAGTATTTGGATGACAGAAACACTTTTCGACATAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101321 TTTGCGTGTGGAGTATTTGGATGACAGAAACACTTTTCGACATAGTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGTGCCCTATGAGCCGCCTGAG         GTTGGCTCTGACTGTACC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101371 TGGTGCCCTATGAGCCGCCTGAGGTC...TAGGTTGGCTCTGACTGTACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACCATCCACTACAACTACATGTGTAACAGTTCCTGCATGGGCGGCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101980 ACCATCCACTACAACTACATGTGTAACAGTTCCTGCATGGGCGGCATGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGGAGGCCCATCCTCACCATCATCACACTGGAAGACTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 102030 CCGGAGGCCCATCCTCACCATCATCACACTGGAAGACTCCAGGTC...TA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    666  TGGTAATCTACTGGGACGGAACAGCTTTGAGGTGCGTGTTTGTGCCTGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102414 GTGGTAATCTACTGGGACGGAACAGCTTTGAGGTGCGTGTTTGTGCCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGGGAGAGACCGGCGCACAGAGGAAGAGAATCTCCGCAAGAAAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102464 CCTGGGAGAGACCGGCGCACAGAGGAAGAGAATCTCCGCAAGAAAGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCCTCACCACGAGCTGCCCCCAGGGAGCACTAAGCGAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102514 GCCTCACCACGAGCTGCCCCCAGGGAGCACTAAGCGAGGTA...TAGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGCCCAACAACACCAGCTCCTCTCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102647 TGCCCAACAACACCAGCTCCTCTCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACTGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGAGAATATTTCACCCTTCAG         ATCCGTGGGCGTGAGCGCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102697 GGAGAATATTTCACCCTTCAGGTA...CAGATCCGTGGGCGTGAGCGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGAGATGTTCCGAGAGCTGAATGAGGCCTTGGAACTCAAGGATGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105557 CGAGATGTTCCGAGAGCTGAATGAGGCCTTGGAACTCAAGGATGCCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGGGAAGGAGCCAGGGGGGAGCAGGGCTCACTCCAG         CCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105607 CTGGGAAGGAGCCAGGGGGGAGCAGGGCTCACTCCAGGTG...CAGCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGAAGTCCAAAAAGGGTCAGTCTACCTCCCGCCATAAAAAACTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106566 CTGAAGTCCAAAAAGGGTCAGTCTACCTCCCGCCATAAAAAACTCATGTT

   1100     .    :    .    :    .
   1038 CAAGACAGAAGGGCCTGACTCAGAC
        |||||||||||||||||||||||||
 106616 CAAGACAGAAGGGCCTGACTCAGAC