seq1 = pF1KE2586.tfa, 2373 bp
seq2 = pF1KE2586/gi568815597r_205815360.tfa (gi568815597r:205815360_206035820), 220461 bp

>pF1KE2586 2373
>gi568815597r:205815360_206035820 (Chr1)

(complement)

1-125  (100001-100125)   100% ->
126-265  (102737-102876)   99% ->
266-376  (103009-103119)   100% ->
377-552  (103786-103961)   100% ->
553-717  (105765-105929)   100% ->
718-870  (106465-106617)   100% ->
871-953  (106912-106994)   100% ->
954-1101  (107772-107919)   100% ->
1102-1215  (108216-108329)   100% ->
1216-1293  (108533-108610)   100% ->
1294-1389  (109191-109286)   100% ->
1390-1496  (111332-111438)   100% ->
1497-1566  (112208-112277)   100% ->
1567-1659  (112394-112486)   100% ->
1660-1773  (112626-112739)   100% ->
1774-2055  (113974-114255)   100% ->
2056-2110  (115591-115645)   100% ->
2111-2256  (116836-116981)   100% ->
2257-2328  (118467-118538)   100% ->
2329-2373  (120417-120461)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCAGCCCAGGCCCCGCTACGTGGTAGACAGAGCCGCATACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCAGCCCAGGCCCCGCTACGTGGTAGACAGAGCCGCATACTCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCCTCTTCGACGATGAGTTTGAGAAGAAGGACCGGACATACCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCCTCTTCGACGATGAGTTTGAGAAGAAGGACCGGACATACCCAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGAGAAACTTCGCAATGCCTTCAG         ATGTTCCTCAGCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100101 GAGAGAAACTTCGCAATGCCTTCAGGTA...CAGATGTTCCTCAGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAAAGCTGTGGTGTTTGGGCTGCTGCCTGTGCTCTCCTGGCTCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102753 ATCAAAGCTGTGGTGTTTGGGCTGCTGCCTGTGCTCTCCTGGCTCCCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACAAGATTAAAGACTACATCATTCCTGACCTGCTCGGTGGACTCAGCG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102803 GTACAAGATTAAAGACTACATCATTCCTGACCTGCTCGGTGGACTCAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGGATCCATCCAGGTCCCACAAG         GCATGGCATTTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102853 GGGGATCCATCCAGGTCCCACAAGGTG...CAGGCATGGCATTTGCTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGCCAACCTTCCTGCAGTCAATGGCCTCTACTCCTCCTTCTTCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103026 CTGGCCAACCTTCCTGCAGTCAATGGCCTCTACTCCTCCTTCTTCCCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGACCTACTTCTTCCTGGGGGGTGTTCACCAGATGGTGCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103076 CCTGACCTACTTCTTCCTGGGGGGTGTTCACCAGATGGTGCCAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    377    GTACCTTTGCCGTTATCAGCATCCTGGTGGGTAACATCTGTCTGCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103783 CAGGTACCTTTGCCGTTATCAGCATCCTGGTGGGTAACATCTGTCTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGCCCCAGAGTCGAAATTCCAGGTCTTCAACAATGCCACCAATGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103833 CTGGCCCCAGAGTCGAAATTCCAGGTCTTCAACAATGCCACCAATGAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTATGTGGACACAGCAGCCATGGAGGCTGAGAGGCTGCACGTGTCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103883 CTATGTGGACACAGCAGCCATGGAGGCTGAGAGGCTGCACGTGTCAGCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCTAGCCTGCCTCACCGCCATCATCCAG         ATGGGTCTGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103933 CGCTAGCCTGCCTCACCGCCATCATCCAGGTG...CAGATGGGTCTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCATGCAGTTTGGCTTTGTGGCCATCTACCTCTCCGAGTCCTTCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105777 TTCATGCAGTTTGGCTTTGTGGCCATCTACCTCTCCGAGTCCTTCATCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGGCTTCATGACGGCCGCCGGCCTGCAGATCCTGATTTCGGTGCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105827 GGGCTTCATGACGGCCGCCGGCCTGCAGATCCTGATTTCGGTGCTCAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACATCTTCGGACTGACCATCCCCTCCTACACAGGCCCAGGGTCCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105877 ACATCTTCGGACTGACCATCCCCTCCTACACAGGCCCAGGGTCCATCGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTT         ACCTTCATTGACATTTGCAAAAACCTCCCCCACACCAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105927 TTTGTG...CAGACCTTCATTGACATTTGCAAAAACCTCCCCCACACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATCGCCTCGCTCATCTTCGCTCTCATCAGCGGTGCCTTCCTGGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106503 CATCGCCTCGCTCATCTTCGCTCTCATCAGCGGTGCCTTCCTGGTGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGAAGGAGCTCAATGCTCGCTACATGCACAAGATTCGCTTCCCCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106553 TGAAGGAGCTCAATGCTCGCTACATGCACAAGATTCGCTTCCCCATCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACAGAGATGATTGTG         GTGGTGGTGGCAACAGCTATCTCCGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106603 ACAGAGATGATTGTGGTA...CAGGTGGTGGTGGCAACAGCTATCTCCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGGCTGTAAGATGCCCAAAAAGTATCACATGCAGATCGTGGGAGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106938 GGGCTGTAAGATGCCCAAAAAGTATCACATGCAGATCGTGGGAGAAATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AACGCGG         GTTCCCCACCCCGGTGTCGCCTGTGGTCTCACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106988 AACGCGGGTG...CAGGTTCCCCACCCCGGTGTCGCCTGTGGTCTCACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGGAAGGACATGATAGGCACAGCCTTCTCCCTAGCCATCGTGAGCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107806 TGGAAGGACATGATAGGCACAGCCTTCTCCCTAGCCATCGTGAGCTACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CATCAACCTGGCTATGGGCCGGACCCTGGCCAACAAGCACGGCTACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107856 CATCAACCTGGCTATGGGCCGGACCCTGGCCAACAAGCACGGCTACGACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGATTCGAACCAG         GAGATGATCGCTCTCGGCTGCAGCAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107906 TGGATTCGAACCAGGTA...CAGGAGATGATCGCTCTCGGCTGCAGCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTCTTTGGCTCCTTCTTTAAAATTCATGTCATTTGCTGTGCGCTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108243 TTCTTTGGCTCCTTCTTTAAAATTCATGTCATTTGCTGTGCGCTTTCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CACTCTGGCTGTGGATGGAGCTGGAGGAAAATCCCAG         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108293 CACTCTGGCTGTGGATGGAGCTGGAGGAAAATCCCAGGTG...TAGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCAGCCTGTGTGTGTCTCTGGTGGTGATGATCACCATGCTGGTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108537 CCAGCCTGTGTGTGTCTCTGGTGGTGATGATCACCATGCTGGTCCTGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATCTATCTGTATCCTCTCCCTAAG         TCTGTGCTAGGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108587 ATCTATCTGTATCCTCTCCCTAAGGTA...TAGTCTGTGCTAGGAGCCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GATCGCTGTCAATCTCAAGAACTCCCTCAAGCAACTCACCGACCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109208 GATCGCTGTCAATCTCAAGAACTCCCTCAAGCAACTCACCGACCCCTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACCTGTGGAGGAAGAGCAAGCTGGACTGT         TGCATCTGGGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109258 ACCTGTGGAGGAAGAGCAAGCTGGACTGTGTA...CAGTGCATCTGGGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGAGCTTCCTCTCCTCCTTCTTCCTCAGCCTGCCCTATGGTGTGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111344 GTGAGCTTCCTCTCCTCCTTCTTCCTCAGCCTGCCCTATGGTGTGGCAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGGTGTCGCCTTCTCCGTCCTGGTCGTGGTCTTCCAGACTCAGTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 111394 GGGTGTCGCCTTCTCCGTCCTGGTCGTGGTCTTCCAGACTCAGTTGTA..

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497     TCGAAATGGCTATGCACTGGCCCAGGTCATGGACACTGACATTTAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111444 .CAGTCGAAATGGCTATGCACTGGCCCAGGTCATGGACACTGACATTTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTGAATCCCAAGACCTATAATAGG         GCCCAGGATATCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112254 GTGAATCCCAAGACCTATAATAGGGTA...CAGGCCCAGGATATCCAGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GATTAAAATCATCACGTACTGCTCCCCTCTCTACTTTGCCAACTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112411 GATTAAAATCATCACGTACTGCTCCCCTCTCTACTTTGCCAACTCAGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TCTTCAGGCAAAAGGTCATCGCCAAG         ACAGGCATGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112461 TCTTCAGGCAAAAGGTCATCGCCAAGGTA...CAGACAGGCATGGACCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CAGAAAGTATTACTAGCCAAGCAAAAATACCTCAAGAAGCAGGAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112641 CAGAAAGTATTACTAGCCAAGCAAAAATACCTCAAGAAGCAGGAGAAGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GAGAATGAGGCCCACACAACAGAGGAGGTCTCTATTCATGAAAACCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112691 GAGAATGAGGCCCACACAACAGAGGAGGTCTCTATTCATGAAAACCAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774         ACTGTCTCCCTGCAGGAGCTGCAGCAGGACTTTGAGAATGCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112741 TG...CAGACTGTCTCCCTGCAGGAGCTGCAGCAGGACTTTGAGAATGCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CCCCCCACCGACCCCAACAACAACCAGACCCCGGCTAACGGCACCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114016 CCCCCCACCGACCCCAACAACAACCAGACCCCGGCTAACGGCACCAGCGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GTCCTATATCACCTTCAGCCCTGACAGCTCCTCACCTGCCCAGAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114066 GTCCTATATCACCTTCAGCCCTGACAGCTCCTCACCTGCCCAGAGTGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CACCAGCCTCCGCTGAGGCCCCCGGCGAGCCCAGTGACATGCTGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114116 CACCAGCCTCCGCTGAGGCCCCCGGCGAGCCCAGTGACATGCTGGCCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GTCCCACCCTTCGTCACCTTCCACACCCTCATCCTGGACATGAGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114166 GTCCCACCCTTCGTCACCTTCCACACCCTCATCCTGGACATGAGTGGAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAGCTTCGTGGACTTGATGGGCATCAAGGCCCTGGCCAAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 114216 CAGCTTCGTGGACTTGATGGGCATCAAGGCCCTGGCCAAGGTG...TAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGAGCTCCACCTATGGGAAGATCGGCGTGAAGGTCTTCTTGGTGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115592 TGAGCTCCACCTATGGGAAGATCGGCGTGAAGGTCTTCTTGGTGAACATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CATG         CCCAGGTGTACAATGACATTAGCCATGGAGGCGTCTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115642 CATGGTA...TAGCCCAGGTGTACAATGACATTAGCCATGGAGGCGTCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGAGGATGGGAGTCTAGAATGCAAGCACGTCTTTCCCAGCATACATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116873 TGAGGATGGGAGTCTAGAATGCAAGCACGTCTTTCCCAGCATACATGACG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CAGTCCTCTTTGCCCAGGCAAATGCTAGAGACGTGACCCCAGGACACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116923 CAGTCCTCTTTGCCCAGGCAAATGCTAGAGACGTGACCCCAGGACACAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TTCCAAGGG         GCTCCAGGGGATGCTGAGCTCTCCTTGTACGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116973 TTCCAAGGGGTA...CAGGCTCCAGGGGATGCTGAGCTCTCCTTGTACGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CTCAGAGGAGGACATTCGCAGCTACTGGGACTTAGAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118499 CTCAGAGGAGGACATTCGCAGCTACTGGGACTTAGAGCAGGTG...CAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AGATGTTCGGGAGCATGTTTCACGCAGAGACCCTGACCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120418 AGATGTTCGGGAGCATGTTTCACGCAGAGACCCTGACCGCCCTG