seq1 = pF1KE2560.tfa, 627 bp
seq2 = pF1KE2560/gi568815596r_9427778.tfa (gi568815596r:9427778_9655605), 227828 bp

>pF1KE2560 627
>gi568815596r:9427778_9655605 (Chr2)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-230  (112321-112453)   100% ->
231-361  (118778-118908)   100% ->
362-450  (119684-119772)   100% ->
451-627  (127652-127828)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCAGTCTCTCCTATTCCTGACCAGCGTGGTTCCTTTCGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCAGTCTCTCCTATTCCTGACCAGCGTGGTTCCTTTCGTGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCGACCTCCGGATGACCCGGGCTTCGGCCCCCACCAGAGACTCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 GCCGCGACCTCCGGATGACCCGGGCTTCGGCCCCCACCAGAGACTCGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       AGAAGCTTGATTCTTTGCTCTCAGACTACGATATTCTCTCTTTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGAGAAGCTTGATTCTTTGCTCTCAGACTACGATATTCTCTCTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTAATATCCAGCAGCATTCGGTAAGAAAAAGAGATCTACAGACTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112365 TCTAATATCCAGCAGCATTCGGTAAGAAAAAGAGATCTACAGACTTCAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACATGTAGAAACACTACTAACTTTTTCAGCTTTGAAAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112415 ACATGTAGAAACACTACTAACTTTTTCAGCTTTGAAAAGGTA...CAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTTTAAATTATACCTGACATCAAGTACTGAACGTTTTTCACAAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118780 ATTTTAAATTATACCTGACATCAAGTACTGAACGTTTTTCACAAAATTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGTCGTGGTGGTGGATGGTAAAAACGAAAGCGAGTACACTGTAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118830 AAGGTCGTGGTGGTGGATGGTAAAAACGAAAGCGAGTACACTGTAAAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGGACTTCTTCACTGGACACGTGGTTG         GTGAGCCTGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 118880 GCAGGACTTCTTCACTGGACACGTGGTTGGTT...AAGGTGAGCCTGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTAGGGTTCTAGCCCACATAAGAGATGATGATGTTATAATCAGAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119696 CTAGGGTTCTAGCCCACATAAGAGATGATGATGTTATAATCAGAATCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGATGGGGCCGAATATAACATAGAG         CCACTTTGGAGATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119746 ACAGATGGGGCCGAATATAACATAGAGGTA...TAGCCACTTTGGAGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTTAATGATACCAAAGACAAAAGAATGTTAGTTTATAAATCTGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127666 TGTTAATGATACCAAAGACAAAAGAATGTTAGTTTATAAATCTGAAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAAGAATGTTTCACGTTTGCAGTCTCCAAAAGTGTGTGGTTATTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127716 TCAAGAATGTTTCACGTTTGCAGTCTCCAAAAGTGTGTGGTTATTTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGGATAATGAAGAGTTGCTCCCAAAAGGGTTAGTAGACAGAGAACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127766 GTGGATAATGAAGAGTTGCTCCCAAAAGGGTTAGTAGACAGAGAACCACC

    650     .    :
    615 TGAAGGTAAGACT
        |||||||||||||
 127816 TGAAGGTAAGACT