Result of SIM4 for
pF1KE2544
seq1 = pF1KE2544.tfa, 3231 bp
seq2 = pF1KE2544/gi568815596r_135100345.tfa (gi568815596r:135100345_135604489), 504145 bp
>pF1KE2544 3231
>gi568815596r:135100345_135604489 (Chr2)
(complement)
1-180 (100001-100181) 94% ->
181-359 (250862-251040) 100% ->
360-591 (254275-254506) 100% ->
592-677 (258855-258940) 100% ->
678-849 (288960-289131) 100% ->
850-966 (290885-291001) 99% ->
967-1086 (328735-328854) 100% ->
1087-1206 (332603-332722) 100% ->
1207-1386 (335349-335528) 100% ->
1387-1539 (338804-338956) 100% ->
1540-1954 (373563-373977) 100% ->
1955-2152 (376475-376672) 100% ->
2153-2244 (379973-380064) 100% ->
2245-2346 (385312-385413) 100% ->
2347-2489 (386883-387025) 100% ->
2490-2600 (395512-395622) 100% ->
2601-3003 (396654-397056) 99% ->
3004-3135 (401527-401658) 100% ->
3136-3231 (404050-404145) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCTAGGGTTCATAACATAAAAAAGTCTCTTACACCTCACATTTCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCTAGGGTTCATAACATAAAAAAGTCTCTTACACCTCACATTTCTTG
50 . : . : . : . : . :
51 TGTGACAAATGAATCTGATAATCTGCTGGATTTTTTGCCTGACAGACTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGTGACAAATGAATCTGATAATCTGCTGGATTTTTTGCCTGACAGACTAA
100 . : . : . : . : . :
101 GAGCAAAGCTACTTCCATTCCAGAAAGATGGCATCATTTTTGCCCTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GAGCAAAGCTACTTCCATTCCAGAAAGATGGCATCATTTTTGCCCTCAAA
150 . : . : . : . : . :
151 AGAAATGGCAGGTGTATGGTGGCTGATGA A ATGGGTCTA
||||||||||||| |-| | ||| ||-|->>>...>>>|||||||||
100151 AGAAATGGCAGGTAAA GTTCTTTGAAGACATGCT...TAGATGGGTCTA
200 . : . : . : . : . :
190 GGAAAGACAATCCAGGCAATTGGAATTACTTACTTCTATAAAGAGGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
250871 GGAAAGACAATCCAGGCAATTGGAATTACTTACTTCTATAAAGAGGAATG
250 . : . : . : . : . :
240 GCCTCTGTTAATAGTGGTCCCTTCGTCTCTGAGGTACCCTTGGACAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
250921 GCCTCTGTTAATAGTGGTCCCTTCGTCTCTGAGGTACCCTTGGACAGAAG
300 . : . : . : . : . :
290 AAATTGAAAAATGGATCCCAGAGCTAAGTCCAGAAGAAATCAATGTTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
250971 AAATTGAAAAATGGATCCCAGAGCTAAGTCCAGAAGAAATCAATGTTATT
350 . : . : . : . : . :
340 CAGAATAAAACTGATGTTAG GAGAATGTCGACCAGTAAAGT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
251021 CAGAATAAAACTGATGTTAGGTA...TAGGAGAATGTCGACCAGTAAAGT
400 . : . : . : . : . :
381 GACAGTTCTGGGTTATGGTCTCTTAACCGCAGATGCAAAGACTTTGATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
254296 GACAGTTCTGGGTTATGGTCTCTTAACCGCAGATGCAAAGACTTTGATAG
450 . : . : . : . : . :
431 ATGCACTGAATAATCAGAACTTCAAAGTAGTTATAGTGGATGAATCACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
254346 ATGCACTGAATAATCAGAACTTCAAAGTAGTTATAGTGGATGAATCACAC
500 . : . : . : . : . :
481 TACATGAAATCCAGAAATGCAACTCGCAGCAGGATTTTATTGCCAATAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
254396 TACATGAAATCCAGAAATGCAACTCGCAGCAGGATTTTATTGCCAATAGT
550 . : . : . : . : . :
531 ACAGAAAGCCAGACGAGCCATTCTTCTTACAGGAACACCAGCTTTAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
254446 ACAGAAAGCCAGACGAGCCATTCTTCTTACAGGAACACCAGCTTTAGGAA
600 . : . : . : . : . :
581 GGCCTGAAGAG CTTTTTATGCAGATTGAAGCTCTCTTTCCA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
254496 GGCCTGAAGAGGTA...TAGCTTTTTATGCAGATTGAAGCTCTCTTTCCA
650 . : . : . : . : . :
622 CAAAAATTTGGAAGATGGACCGACTATGCAAAAAGATACTGTAATGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
258885 CAAAAATTTGGAAGATGGACCGACTATGCAAAAAGATACTGTAATGCACA
700 . : . : . : . : . :
672 CATCAG ATATTTTGGTAAAAGACCTCAGTGGGATTGTAGAG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
258935 CATCAGGTA...CAGATATTTTGGTAAAAGACCTCAGTGGGATTGTAGAG
750 . : . : . : . : . :
713 GGGCATCAAATCTTAATGAACTTCACCAGCTATTAAGTGACATAATGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288995 GGGCATCAAATCTTAATGAACTTCACCAGCTATTAAGTGACATAATGATT
800 . : . : . : . : . :
763 AGAAGATTAAAGACTGAAGTTTTAACCCAGCTACCCCCTAAAGTCAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289045 AGAAGATTAAAGACTGAAGTTTTAACCCAGCTACCCCCTAAAGTCAGACA
850 . : . : . : . : . :
813 GCGTATTCCATTTGATCTTCCATCAGCAGCTGCCAAG GAAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
289095 GCGTATTCCATTTGATCTTCCATCAGCAGCTGCCAAGGTG...TAGGAAT
900 . : . : . : . : . :
854 TGAATACCAGCTTTGAAGAGTGGGAAAAAATAATGAGAACTCCAAATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290889 TGAATACCAGCTTTGAAGAGTGGGAAAAAATAATGAGAACTCCAAATTCA
950 . : . : . : . : . :
904 GGTGCCATGGAGACAGTCATGGGGTTGATAACTCGCATGTTCAAACAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
290939 GGTGCCATGGAGACAGTCATGGGGTTGATAACTCGCATGTTTAAACAAAC
1000 . : . : . : . : . :
954 TGCTATTGCCAAG GCAGGTGCTGTAAAGGATTATATTAAGA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
290989 TGCTATTGCCAAGGTA...TAGGCAGGTGCTGTAAAGGATTATATTAAGA
1050 . : . : . : . : . :
995 TGATGCTTCAGAATGATTCGCTTAAATTTCTGGTTTTTGCTCACCATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
328763 TGATGCTTCAGAATGATTCGCTTAAATTTCTGGTTTTTGCTCACCATTTA
1100 . : . : . : . : . :
1045 AGCATGCTCCAAGCTTGCACAGAAGCAGTCATCGAAAATAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
328813 AGCATGCTCCAAGCTTGCACAGAAGCAGTCATCGAAAATAAGGTA...TA
1150 . : . : . : . : . :
1087 ACTCGTTACATTAGGATAGATGGAAGTGTTTCATCTTCAGAAAGAATAC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
332602 GACTCGTTACATTAGGATAGATGGAAGTGTTTCATCTTCAGAAAGAATAC
1200 . : . : . : . : . :
1136 ATCTGGTTAATCAGTTTCAAAAGGATCCTGACACTCGCGTGGCTATCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
332652 ATCTGGTTAATCAGTTTCAAAAGGATCCTGACACTCGCGTGGCTATCCTA
1250 . : . : . : . : . :
1186 AGCATTCAGGCTGCTGGCCAG GGATTAACATTTACTGCAGC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
332702 AGCATTCAGGCTGCTGGCCAGGTA...TAGGGATTAACATTTACTGCAGC
1300 . : . : . : . : . :
1227 AAGTCATGTTGTATTTGCTGAGTTGTACTGGGACCCTGGACATATAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
335369 AAGTCATGTTGTATTTGCTGAGTTGTACTGGGACCCTGGACATATAAAAC
1350 . : . : . : . : . :
1277 AAGCAGAAGACCGAGCTCACAGAATTGGCCAGTGCAGTTCTGTGAATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
335419 AAGCAGAAGACCGAGCTCACAGAATTGGCCAGTGCAGTTCTGTGAATATT
1400 . : . : . : . : . :
1327 CACTACCTTATTGCAAATGGAACCCTAGACACCCTTATGTGGGGAATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
335469 CACTACCTTATTGCAAATGGAACCCTAGACACCCTTATGTGGGGAATGTT
1450 . : . : . : . : . :
1377 GAATCGCAAG GCTCAAGTTACAGGGAGCACACTGAACGGTA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
335519 GAATCGCAAGGTA...TAGGCTCAAGTTACAGGGAGCACACTGAACGGTA
1500 . : . : . : . : . :
1418 GGAAAGAAAAAATTCAGGCTGAGGAAGGTGATAAGGAAAAATGGGATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
338835 GGAAAGAAAAAATTCAGGCTGAGGAAGGTGATAAGGAAAAATGGGATTTC
1550 . : . : . : . : . :
1468 CTGCAGTTTGCTGAAGCTTGGACTCCAAATGACAGTTCTGAAGAGTTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
338885 CTGCAGTTTGCTGAAGCTTGGACTCCAAATGACAGTTCTGAAGAGTTAAG
1600 . : . : . : . : . :
1518 GAAGGAAGCTTTGTTCACTCAC TTCGAAAAAGAAAAACAGC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
338935 GAAGGAAGCTTTGTTCACTCACGTA...TAGTTCGAAAAAGAAAAACAGC
1650 . : . : . : . : . :
1559 ATGATATTCGATCATTTTTTGTACCACAACCTAAAAAAAGACAGTTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373582 ATGATATTCGATCATTTTTTGTACCACAACCTAAAAAAAGACAGTTGATG
1700 . : . : . : . : . :
1609 ACCTCCTGTGACGAATCAAAGAGATTCCGGGAGGAAAATACTGTAGTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373632 ACCTCCTGTGACGAATCAAAGAGATTCCGGGAGGAAAATACTGTAGTGTC
1750 . : . : . : . : . :
1659 ATCAGACCCTACAAAAACAGCTGCAAGAGATATCATCGATTATGAAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373682 ATCAGACCCTACAAAAACAGCTGCAAGAGATATCATCGATTATGAAAGTG
1800 . : . : . : . : . :
1709 ATGTTGAACCTGAAACGAAAAGATTGAAATTGGCTGCCTCGGAAGACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373732 ATGTTGAACCTGAAACGAAAAGATTGAAATTGGCTGCCTCGGAAGACCAC
1850 . : . : . : . : . :
1759 TGCAGTCCGTCGGAAGAGACACCATCCCAGTCCAAGCAAATCCGAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373782 TGCAGTCCGTCGGAAGAGACACCATCCCAGTCCAAGCAAATCCGAACTCC
1900 . : . : . : . : . :
1809 ACTCGTGGAAAGTGTACAGGAGGCCAAGGCCCAGTTAACCACCCCAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373832 ACTCGTGGAAAGTGTACAGGAGGCCAAGGCCCAGTTAACCACCCCAGCCT
1950 . : . : . : . : . :
1859 TTCCTGTAGAGGGCTGGCAATGTAGTCTCTGCACCTATATCAATAATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373882 TTCCTGTAGAGGGCTGGCAATGTAGTCTCTGCACCTATATCAATAATTCA
2000 . : . : . : . : . :
1909 GAGTTACCTTATTGTGAAATGTGTGAGACTCCTCAAGGCAGTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
373932 GAGTTACCTTATTGTGAAATGTGTGAGACTCCTCAAGGCAGTGCTGGTG.
2050 . : . : . : . : . :
1955 TTATGCAAATAGATAGCCTCAACCATATCCAGGATAAAAACGAGA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373982 ..TAGTTATGCAAATAGATAGCCTCAACCATATCCAGGATAAAAACGAGA
2100 . : . : . : . : . :
2000 AGGATGATTCTCAGAAAGACACCTCCAAAAAGGTTCAAACTATCTCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376520 AGGATGATTCTCAGAAAGACACCTCCAAAAAGGTTCAAACTATCTCAGAC
2150 . : . : . : . : . :
2050 TGTGAAAAACAAGCCCTTGCACAGTCAGAACCTGGCCAGTTGGCTGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376570 TGTGAAAAACAAGCCCTTGCACAGTCAGAACCTGGCCAGTTGGCTGACAG
2200 . : . : . : . : . :
2100 CAAGGAAGAAACACCAAAAATTGAGAAAGAAGACGGACTTACATCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376620 CAAGGAAGAAACACCAAAAATTGAGAAAGAAGACGGACTTACATCCCAGC
2250 . : . : . : . : . :
2150 CAG AACAGTGGAAGAGTTCAGACACTTTGCCAGTGTATGAC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376670 CAGGTA...TAGAACAGTGGAAGAGTTCAGACACTTTGCCAGTGTATGAC
2300 . : . : . : . : . :
2191 ACCTTAATGTTCTGTGCAAGTAGGAATACTGACCGGATTCACATCTATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
380011 ACCTTAATGTTCTGTGCAAGTAGGAATACTGACCGGATTCACATCTATAC
2350 . : . : . : . : . :
2241 TAAG GATGGAAAACAGATGAGCTGTAATTTCATTCCTCTGG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
380061 TAAGGTA...CAGGATGGAAAACAGATGAGCTGTAATTTCATTCCTCTGG
2400 . : . : . : . : . :
2282 ATATAAAATTAGACCTTTGGGAAGATTTACCAGCAAGCTTTCAGCTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385349 ATATAAAATTAGACCTTTGGGAAGATTTACCAGCAAGCTTTCAGCTGAAA
2450 . : . : . : . : . :
2332 CAATATCGCTCACTG ATTTTGAGATTTGTTCGAGAATGGAG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
385399 CAATATCGCTCACTGGTA...CAGATTTTGAGATTTGTTCGAGAATGGAG
2500 . : . : . : . : . :
2373 TAGTCTAACTGCCATGAAGCAAAGGATAATCAGGAAAAGTGGACAGCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386909 TAGTCTAACTGCCATGAAGCAAAGGATAATCAGGAAAAGTGGACAGCTAT
2550 . : . : . : . : . :
2423 TCTGTAGCCCAATTCTTGCTTTGGAAGAGATCACAAAGCAACAAACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386959 TCTGTAGCCCAATTCTTGCTTTGGAAGAGATCACAAAGCAACAAACCAAA
2600 . : . : . : . : . :
2473 CAAAATTGCACCAAAAG ATACATAACCAAAGAAGATGTTGC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
387009 CAAAATTGCACCAAAAGGTA...TAGATACATAACCAAAGAAGATGTTGC
2650 . : . : . : . : . :
2514 CGTAGCCTCAATGGACAAAGTGAAGAATGTTGGGGGCCATGTCCGTCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
395536 CGTAGCCTCAATGGACAAAGTGAAGAATGTTGGGGGCCATGTCCGTCTGA
2700 . : . : . : . : . :
2564 TCACAAAGGAGTCCAGGCCACGGGATCCTTTCACAAA AAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
395586 TCACAAAGGAGTCCAGGCCACGGGATCCTTTCACAAAGTA...TAGAAAA
2750 . : . : . : . : . :
2605 CTTCTTGAAGATGGAGCCTGTGTCCCATTTCTAAATCCATACACAGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396658 CTTCTTGAAGATGGAGCCTGTGTCCCATTTCTAAATCCATACACAGTCCA
2800 . : . : . : . : . :
2655 GGCAGATCTCACTGTGAAGCCCTCTACATCCAAAGGCTATTTGCAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396708 GGCAGATCTCACTGTGAAGCCCTCTACATCCAAAGGCTATTTGCAAGCTG
2850 . : . : . : . : . :
2705 TGGATAATGAAGGAAATCCACTTTGCCTTCGCTGTCAGCAACCCACTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396758 TGGATAATGAAGGAAATCCACTTTGCCTTCGCTGTCAGCAACCCACTTGC
2900 . : . : . : . : . :
2755 CAGACTAAGCAAGCATGTAAAGCGAACTCTTGGGATTCACGGTTTTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396808 CAGACTAAGCAAGCATGTAAAGCGAACTCTTGGGATTCACGGTTTTGCTC
2950 . : . : . : . : . :
2805 TCTGAAATGTCAGGAAGAGTTTTGGATTCGATCTAATAACAGTTACCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396858 TCTGAAATGTCAGGAAGAGTTTTGGATTCGATCTAATAACAGTTACCTGA
3000 . : . : . : . : . :
2855 GAGCCAAAGTATTTGAAACTGAACATGGTGTGTGTCAGCTCTGTAATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396908 GAGCCAAAGTATTTGAAACTGAACATGGTGTGTGTCAGCTCTGTAATGTG
3050 . : . : . : . : . :
2905 AACGCACAGGAACTCTTTTTACGTCTGAGAGATGCCCCTAAAAGTCAGAG
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396958 AACGCACAAGAACTCTTTTTACGTCTGAGAGATGCCCCTAAAAGTCAGAG
3100 . : . : . : . : . :
2955 GAAGAATCTTCTGTATGCTACCTGGACTTCAAAGCTCCCATTAGAACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
397008 GAAGAATCTTCTGTATGCTACCTGGACTTCAAAGCTCCCATTAGAACAGG
3150 . : . : . : . : . :
3004 CTAAATGAAATGATAAGAAACCCAGGGGAAGGACATTTCTGG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
397058 TA...CAGCTAAATGAAATGATAAGAAACCCAGGGGAAGGACATTTCTGG
3200 . : . : . : . : . :
3046 CAGGTGGATCACATCAAGCCAGTGTATGGGGGAGGAGGACAGTGTTCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
401569 CAGGTGGATCACATCAAGCCAGTGTATGGGGGAGGAGGACAGTGTTCCCT
3250 . : . : . : . : . :
3096 GGACAACCTGCAGACTCTCTGCACAGTCTGTCACAAAGAG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
401619 GGACAACCTGCAGACTCTCTGCACAGTCTGTCACAAAGAGGTC...TAGA
3300 . : . : . : . : . :
3137 GAACTGCCAGACAAGCTAAGGAAAGAAGCCAGGTGAGAAGACAATCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404051 GAACTGCCAGACAAGCTAAGGAAAGAAGCCAGGTGAGAAGACAATCTCTA
3350 . : . : . : . : .
3187 GCATCAAAGCATGGATCAGACATCACACGATTTTTGGTAAAGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404101 GCATCAAAGCATGGATCAGACATCACACGATTTTTGGTAAAGAAG