seq1 = pF1KE2537.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KE2537/gi568815597r_85221455.tfa (gi568815597r:85221455_85565045), 343591 bp

>pF1KE2537 855
>gi568815597r:85221455_85565045 (Chr1)

(complement)

1-303  (100001-100303)   100% ->
304-403  (206199-206298)   100% ->
404-477  (213467-213540)   100% ->
478-597  (214512-214631)   100% ->
598-741  (240163-240306)   100% ->
742-855  (243478-243591)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGGCTCGGCCACCCCGCCGCCTTCGGCCGGGCCACCCACGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGGCTCGGCCACCCCGCCGCCTTCGGCCGGGCCACCCACGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGCGGGCGCTACCCGAGTCGCTCGGCCAGCACGCGCTGAGAAGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGCGGGCGCTACCCGAGTCGCTCGGCCAGCACGCGCTGAGAAGCGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCGAGGAGGTGGACGTCGCCCGCGCGGAACGGCAGCACCAGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCGAGGAGGTGGACGTCGCCCGCGCGGAACGGCAGCACCAGCTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGCGTGCTGGGCAGCAAGCTGGGGCTGCAGGTGGTGGAGCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGGCGTGCTGGGCAGCAAGCTGGGGCTGCAGGTGGTGGAGCTGCCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACGAGAGCCTTCCGGACTGCGTCTTCGTGGAGGACGTGGCCGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACGAGAGCCTTCCGGACTGCGTCTTCGTGGAGGACGTGGCCGTGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGAGGAGACGGCCCTCATCACCCGACCCGGGGCGCCGAGCCGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGAGGAGACGGCCCTCATCACCCGACCCGGGGCGCCGAGCCGGAGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAG         GTTGACATGATGAAAGAAGCATTAGAAAAACTTCAGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGTA...CAGGTTGACATGATGAAAGAAGCATTAGAAAAACTTCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAATATAGTAGAGATGAAAGATGAAAATGCAACTTTAGATGGCGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206237 CAATATAGTAGAGATGAAAGATGAAAATGCAACTTTAGATGGCGGAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTTATTCACAG         GCAGAGAATTTTTTGTGGGCCTTTCCAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 206287 TTTTATTCACAGGTA...CAGGCAGAGAATTTTTTGTGGGCCTTTCCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGGACAAATCAACGAGGTGCTGAAATCTTGGCTGATACTTTTAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 213496 AGGACAAATCAACGAGGTGCTGAAATCTTGGCTGATACTTTTAAGGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478     GACTATGCAGTCTCCACAGTGCCAGTGGCAGATGGGTTGCATTTGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213546 .TAGGACTATGCAGTCTCCACAGTGCCAGTGGCAGATGGGTTGCATTTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAGTTTCTGCAGCATGGCTGGGCCTAACCTGATCGCAATTGGGTCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214558 AGAGTTTCTGCAGCATGGCTGGGCCTAACCTGATCGCAATTGGGTCTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAATCTGCACAGAAGGCCCTTAAG         ATCATGCAACAGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 214608 GAATCTGCACAGAAGGCCCTTAAGGTA...TAGATCATGCAACAGATGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGACCACCGCTACGACAAACTCACTGTGCCTGATGACATAGCAGCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240180 TGACCACCGCTACGACAAACTCACTGTGCCTGATGACATAGCAGCAAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTATATATCTAAATATCCCCAACAAAGGGCACGTCTTGCTGCACCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240230 GTATATATCTAAATATCCCCAACAAAGGGCACGTCTTGCTGCACCGAACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCGGAAGAGTATCCAGAAAGTGCAAAG         GTTTATGAGAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 240280 CCGGAAGAGTATCCAGAAAGTGCAAAGGTA...TAGGTTTATGAGAAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGGACCATATGCTGATCCCCGTGAGCATGTCTGAACTGGAAAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243492 GAAGGACCATATGCTGATCCCCGTGAGCATGTCTGAACTGGAAAAGGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGGGCTGCTCACCTGCTGCTCAGTTTTAATTAACAAGAAAGTAGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243542 ATGGGCTGCTCACCTGCTGCTCAGTTTTAATTAACAAGAAAGTAGACTCC