seq1 = pF1KE2534.tfa, 1032 bp
seq2 = pF1KE2534/gi568815579f_41655639.tfa (gi568815579f:41655639_41866256), 210618 bp

>pF1KE2534 1032
>gi568815579f:41655639_41866256 (Chr19)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-424  (100962-101321)   100% ->
425-703  (105611-105889)   100% ->
704-958  (106331-106585)   100% ->
959-1032  (110545-110618)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACCCCCCTCAGCCCCTCCCTGCAGATTGCATGTCCCCTGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACCCCCCTCAGCCCCTCCCTGCAGATTGCATGTCCCCTGGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCCTGCTCACAG         CCTCACTTCTAACCTTCTGGAACCCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCCTGCTCACAGGTG...TAGCCTCACTTCTAACCTTCTGGAACCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCACCACTGCCAAGCTCACTATTGAATCCACGCCGTTCAATGTCGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100989 CCACCACTGCCAAGCTCACTATTGAATCCACGCCGTTCAATGTCGCAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGGAGGTTCTTCTACTCGCCCACAACCTGCCCCAGAATCGTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101039 GGGAAGGAGGTTCTTCTACTCGCCCACAACCTGCCCCAGAATCGTATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTACAGCTGGTACAAAGGCGAAAGAGTGGATGGCAACAGTCTAATTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101089 TTACAGCTGGTACAAAGGCGAAAGAGTGGATGGCAACAGTCTAATTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATGTAATAGGAACTCAACAAGCTACCCCAGGGCCCGCATACAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101139 GATATGTAATAGGAACTCAACAAGCTACCCCAGGGCCCGCATACAGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGAGAGACAATATACCCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAACGTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101189 CGAGAGACAATATACCCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAACGTCACCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAATGACACAGGATTCTATACCCTACAAGTCATAAAGTCAGATCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101239 GAATGACACAGGATTCTATACCCTACAAGTCATAAAGTCAGATCTTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAAGAAGCAACCGGACAGTTCCATGTATACC         CGGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101289 ATGAAGAAGCAACCGGACAGTTCCATGTATACCGTG...CAGCGGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAACAACTCCAACCCCGTGGAGGACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105619 CCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAACAACTCCAACCCCGTGGAGGACAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCTGTGGCCTTCACCTGTGAACCTGAGGTTCAGAACACAACCTACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105669 TGCTGTGGCCTTCACCTGTGAACCTGAGGTTCAGAACACAACCTACCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGTGGGTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGCTGCAGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105719 GGTGGGTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGCTGCAGCTGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AATGGCAACATGACCCTCACTCTACTCAGCGTCAAAAGGAACGATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105769 AATGGCAACATGACCCTCACTCTACTCAGCGTCAAAAGGAACGATGCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ATCCTATGAATGTGAAATACAGAACCCAGCGAGTGCCAACCGCAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105819 ATCCTATGAATGTGAAATACAGAACCCAGCGAGTGCCAACCGCAGTGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CAGTCACCCTGAATGTCCTCT         ATGGCCCAGATGTCCCCACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105869 CAGTCACCCTGAATGTCCTCTGTG...CAGATGGCCCAGATGTCCCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATTTCCCCCTCAAAGGCCAATTACCGTCCAGGGGAAAATCTGAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106351 ATTTCCCCCTCAAAGGCCAATTACCGTCCAGGGGAAAATCTGAACCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGCCACGCAGCCTCTAACCCACCTGCACAGTACTCTTGGTTTATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106401 CTGCCACGCAGCCTCTAACCCACCTGCACAGTACTCTTGGTTTATCAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGACGTTCCAGCAATCCACACAAGAGCTCTTTATCCCCAACATCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106451 GGACGTTCCAGCAATCCACACAAGAGCTCTTTATCCCCAACATCACTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AATAATAGCGGATCCTATATGTGCCAAGCCCATAACTCAGCCACTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106501 AATAATAGCGGATCCTATATGTGCCAAGCCCATAACTCAGCCACTGGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAATAGGACCACAGTCACGATGATCACAGTCTCTG         GAAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106551 CAATAGGACCACAGTCACGATGATCACAGTCTCTGGTA...AAGGAAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTCCTGTCCTCTCAGCTGTGGCCACCGTCGGCATCACGATTGGAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110551 CTCCTGTCCTCTCAGCTGTGGCCACCGTCGGCATCACGATTGGAGTGCTG

   1050     .    :    .
   1015 GCCAGGGTGGCTCTGATA
        ||||||||||||||||||
 110601 GCCAGGGTGGCTCTGATA