seq1 = pF1KE2533.tfa, 1578 bp
seq2 = pF1KE2533/gi568815579r_42409112.tfa (gi568815579r:42409112_42628374), 219263 bp

>pF1KE2533 1578
>gi568815579r:42409112_42628374 (Chr19)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-424  (100975-101334)   100% ->
425-703  (106173-106451)   100% ->
704-958  (106854-107108)   100% ->
959-1246  (109140-109427)   100% ->
1247-1376  (115896-116025)   100% ->
1377-1429  (116747-116799)   100% ->
1430-1461  (117455-117486)   100% ->
1462-1578  (119147-119263)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCACCTCTCAGCCCCACTTCACAGAGTGCGTGTACCCTGGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCACCTCTCAGCCCCACTTCACAGAGTGCGTGTACCCTGGCAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTCTGCTCACAG         CCTCACTTCTAACCTTCTGGAACCCGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTCTGCTCACAGGTG...TAGCCTCACTTCTAACCTTCTGGAACCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCACCACTGCCCAGCTCACTACTGAATCCATGCCATTCAATGTTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 CCACCACTGCCCAGCTCACTACTGAATCCATGCCATTCAATGTTGCAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGGAGGTTCTTCTCCTTGTCCACAATCTGCCCCAGCAACTTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 GGGAAGGAGGTTCTTCTCCTTGTCCACAATCTGCCCCAGCAACTTTTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACAGCTGGTACAAAGGGGAAAGAGTGGATGGCAACCGTCAAATTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101102 CTACAGCTGGTACAAAGGGGAAAGAGTGGATGGCAACCGTCAAATTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATGCAATAGGAACTCAACAAGCTACCCCAGGGCCCGCAAACAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101152 GATATGCAATAGGAACTCAACAAGCTACCCCAGGGCCCGCAAACAGCGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGAGAGACAATATACCCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAACGTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101202 CGAGAGACAATATACCCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAACGTCACCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAATGACACAGGATTCTACACCCTACAAGTCATAAAGTCAGATCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101252 GAATGACACAGGATTCTACACCCTACAAGTCATAAAGTCAGATCTTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAAGAAGCAACTGGACAGTTCCATGTATACC         CGGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101302 ATGAAGAAGCAACTGGACAGTTCCATGTATACCGTG...TAGCGGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAACAACTCCAACCCTGTGGAGGACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106181 CCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAACAACTCCAACCCTGTGGAGGACAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCTGTGGCCTTCACCTGTGAACCTGAGACTCAGGACACAACCTACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106231 TGCTGTGGCCTTCACCTGTGAACCTGAGACTCAGGACACAACCTACCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGTGGATAAACAATCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGCTGCAGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106281 GGTGGATAAACAATCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGCTGCAGCTGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AATGGCAACAGGACCCTCACTCTACTCAGTGTCACAAGGAATGACACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106331 AATGGCAACAGGACCCTCACTCTACTCAGTGTCACAAGGAATGACACAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACCCTATGAGTGTGAAATACAGAACCCAGTGAGTGCGAACCGCAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106381 ACCCTATGAGTGTGAAATACAGAACCCAGTGAGTGCGAACCGCAGTGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CAGTCACCTTGAATGTCACCT         ATGGCCCGGACACCCCCACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106431 CAGTCACCTTGAATGTCACCTGTG...CAGATGGCCCGGACACCCCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATTTCCCCTTCAGACACCTATTACCGTCCAGGGGCAAACCTCAGCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106874 ATTTCCCCTTCAGACACCTATTACCGTCCAGGGGCAAACCTCAGCCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGCTATGCAGCCTCTAACCCACCTGCACAGTACTCCTGGCTTATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106924 CTGCTATGCAGCCTCTAACCCACCTGCACAGTACTCCTGGCTTATCAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GAACATTCCAGCAAAGCACACAAGAGCTCTTTATCCCTAACATCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106974 GAACATTCCAGCAAAGCACACAAGAGCTCTTTATCCCTAACATCACTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AATAATAGTGGATCCTATACCTGCCACGCCAATAACTCAGTCACTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107024 AATAATAGTGGATCCTATACCTGCCACGCCAATAACTCAGTCACTGGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAACAGGACCACAGTCAAGACGATCATAGTCACTG         AGCTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107074 CAACAGGACCACAGTCAAGACGATCATAGTCACTGGTA...CAGAGCTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GTCCAGTAGTAGCAAAGCCCCAAATCAAAGCCAGCAAGACCACAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109146 GTCCAGTAGTAGCAAAGCCCCAAATCAAAGCCAGCAAGACCACAGTCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGAGATAAGGACTCTGTGAACCTGACCTGCTCCACAAATGACACTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109196 GGAGATAAGGACTCTGTGAACCTGACCTGCTCCACAAATGACACTGGAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CTCCATCCGTTGGTTCTTCAAAAACCAGAGTCTCCCGTCCTCGGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109246 CTCCATCCGTTGGTTCTTCAAAAACCAGAGTCTCCCGTCCTCGGAGAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGAAGCTGTCCCAGGGCAACACCACCCTCAGCATAAACCCTGTCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109296 TGAAGCTGTCCCAGGGCAACACCACCCTCAGCATAAACCCTGTCAAGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GAGGATGCTGGGACGTATTGGTGTGAGGTCTTCAACCCAATCAGTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109346 GAGGATGCTGGGACGTATTGGTGTGAGGTCTTCAACCCAATCAGTAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCAAAGCGACCCCATCATGCTGAACGTAAACT         ATAATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109396 CCAAAGCGACCCCATCATGCTGAACGTAAACTGTA...CAGATAATGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TACCACAAGAAAATGGCCTCTCACCTGGGGCCATTGCTGGCATTGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115905 TACCACAAGAAAATGGCCTCTCACCTGGGGCCATTGCTGGCATTGTGATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GGAGTAGTGGCCCTGGTTGCTCTGATAGCAGTAGCCCTGGCATGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115955 GGAGTAGTGGCCCTGGTTGCTCTGATAGCAGTAGCCCTGGCATGTTTTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GCATTTCGGGAAGACCGGCAG         GGCAAGCGACCAGCGTGATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 116005 GCATTTCGGGAAGACCGGCAGGTA...TAGGGCAAGCGACCAGCGTGATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TCACAGAGCACAAACCCTCAGTCTCCAACCACA         CTCAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116767 TCACAGAGCACAAACCCTCAGTCTCCAACCACAGTA...CAGCTCAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CACTCCAATGACCCACCTAACAAG         ATGAATGAAGTTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 117463 CACTCCAATGACCCACCTAACAAGGTA...CAGATGAATGAAGTTACTTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TTCTACCCTGAACTTTGAAGCCCAGCAACCCACACAACCAACTTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119164 TTCTACCCTGAACTTTGAAGCCCAGCAACCCACACAACCAACTTCAGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCCCATCCCTAACAGCCACAGAAATAATTTATTCAGAAGTAAAAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119214 CCCCATCCCTAACAGCCACAGAAATAATTTATTCAGAAGTAAAAAAGCAG