seq1 = pF1KE2502.tfa, 2172 bp
seq2 = pF1KE2502/gi568815583r_78071447.tfa (gi568815583r:78071447_78334501), 263055 bp

>pF1KE2502 2172
>gi568815583r:78071447_78334501 (Chr15)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-232  (126400-126500)   100% ->
233-453  (139776-139996)   100% ->
454-542  (140482-140570)   100% ->
543-663  (140876-140996)   100% ->
664-744  (151717-151797)   100% ->
745-894  (151887-152036)   100% ->
895-1071  (152357-152533)   100% ->
1072-1253  (153566-153747)   100% ->
1254-1484  (154722-154952)   100% ->
1485-1702  (155671-155888)   100% ->
1703-1842  (159978-160117)   100% ->
1843-2089  (160663-160909)   99% ->
2090-2172  (162973-163055)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCACGCAATTCTGGAGCTGGATACGGCTGCCCACACGGGGACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCACGCAATTCTGGAGCTGGATACGGCTGCCCACACGGGGACCCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGCTGGACAGCAGAGAGACCCCACAGGAGAGCCGGCAGGACATGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGCTGGACAGCAGAGAGACCCCACAGGAGAGCCGGCAGGACATGATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAGGACCACCCAAGAAAAATTGAAAACCAG         CTCACTGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 TGAGGACCACCCAAGAAAAATTGAAAACCAGGTA...CAGCTCACTGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACAGGCAGCCACTCTCCAAAGAGTCCCTGAACCATGCTCTCGAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126410 GACAGGCAGCCACTCTCCAAAGAGTCCCTGAACCATGCTCTCGAGCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGCCAGAGAAGGTGAATAATGCCCAGTGGGATGCTCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 126460 AGTGCCAGAGAAGGTGAATAATGCCCAGTGGGATGCTCCAGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGAGGCGCTGTGGACGACTCGGGCCGATGGGCGGGTGCGCCTGCGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139776 AGGAGGCGCTGTGGACGACTCGGGCCGATGGGCGGGTGCGCCTGCGCATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCCCAGCTGCCCACAGCTTCCCTACACTGTGCATCGGATGTTCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139826 GACCCCAGCTGCCCACAGCTTCCCTACACTGTGCATCGGATGTTCTACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCCTGGATAAGTATGGGGACCTCATCGCTTTGGGCTTCAAGCGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139876 GGCCCTGGATAAGTATGGGGACCTCATCGCTTTGGGCTTCAAGCGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAGTGGGAACACATCTCCTACTCCCAATACTACCTGCTCGCCCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139926 ACAAGTGGGAACACATCTCCTACTCCCAATACTACCTGCTCGCCCGCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCGCCAAGGGCTTCCTGAAG         CTCGGCCTGAAGCAGGCCCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 139976 GCCGCCAAGGGCTTCCTGAAGGTA...GAGCTCGGCCTGAAGCAGGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTGTGGCCATCCTCGGCTTCAACTCCCCGGAGTGGTTCTTCTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140502 CAGTGTGGCCATCCTCGGCTTCAACTCCCCGGAGTGGTTCTTCTCGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGGCACAGTATTTGCAGG         TGGCATCGTCACTGGCATCTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 140552 TGGGCACAGTATTTGCAGGGTG...CAGTGGCATCGTCACTGGCATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCACCAGCTCCCCAGAGGCCTGCCAGTACATCGCTTATGACTGCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140898 ACCACCAGCTCCCCAGAGGCCTGCCAGTACATCGCTTATGACTGCTGCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAATGTCATCATGGTCGACACGCAGAAGCAGCTGGAAAAGATCCTGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 140948 CAATGTCATCATGGTCGACACGCAGAAGCAGCTGGAAAAGATCCTGAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664         ATCTGGAAACAGTTGCCACATCTAAAGGCAGTCGTGATATAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140998 TT...CAGATCTGGAAACAGTTGCCACATCTAAAGGCAGTCGTGATATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAGAACCTCCTCCAAACAAGATGGCCAATGTGTACACG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 151759 AAAGAACCTCCTCCAAACAAGATGGCCAATGTGTACACGGTA...CAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAGGAATTCATGGAGCTGGGGAATGAAGTGCCTGAGGAAGCCCTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151889 GGAGGAATTCATGGAGCTGGGGAATGAAGTGCCTGAGGAAGCCCTGGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATCATTGACACCCAGCAGCCCAACCAGTGCTGTGTGCTAGTCTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151939 CCATCATTGACACCCAGCAGCCCAACCAGTGCTGTGTGCTAGTCTACACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCGGCACCACTGGGAACCCCAAGGGCGTGATGCTGAGTCAAGACAAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 151989 TCCGGCACCACTGGGAACCCCAAGGGCGTGATGCTGAGTCAAGACAATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895        ATCACGTGGACGGCACGGTACGGCAGCCAGGCCGGTGACATCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152039 A...CAGATCACGTGGACGGCACGGTACGGCAGCCAGGCCGGTGACATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGCCGGCAGAAGTCCAGCAGGAGGTGGTAGTCAGCTACCTGCCCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152400 GGCCGGCAGAAGTCCAGCAGGAGGTGGTAGTCAGCTACCTGCCCCTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CATATTGCCGCCCAGATCTACGACCTGTGGACAGGCATCCAGTGGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152450 CATATTGCCGCCCAGATCTACGACCTGTGGACAGGCATCCAGTGGGGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCAGGTTTGCTTTGCCGAACCCGACGCCCTGAAG         GGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 152500 CCAGGTTTGCTTTGCCGAACCCGACGCCCTGAAGGTC...CAGGGGAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGTGAACACGCTGCGGGAGGTGGAGCCCACATCACACATGGGGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153573 TGGTGAACACGCTGCGGGAGGTGGAGCCCACATCACACATGGGGGTGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGGGTATGGGAGAAGATCATGGAGCGCATCCAGGAGGTGGCGGCTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153623 CGGGTATGGGAGAAGATCATGGAGCGCATCCAGGAGGTGGCGGCTCAGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGGCTTCATCCGGCGAAAGATGCTGCTGTGGGCCATGTCGGTGACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153673 TGGCTTCATCCGGCGAAAGATGCTGCTGTGGGCCATGTCGGTGACCTTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGCAGAACCTCACCTGCCCCGGCAG         CGACCTGAAGCCCTTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 153723 AGCAGAACCTCACCTGCCCCGGCAGGTA...CAGCGACCTGAAGCCCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACAACCAGACTGGCAGATTACCTGGTGCTAGCCAAGGTTCGCCAGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154738 ACAACCAGACTGGCAGATTACCTGGTGCTAGCCAAGGTTCGCCAGGCACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGGATTTGCCAAGTGTCAAAAGAACTTCTATGGAGCGGCCCCCATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154788 GGGATTTGCCAAGTGTCAAAAGAACTTCTATGGAGCGGCCCCCATGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAGAGACACAGCACTTCTTCCTGGGTCTCAACATCCGCTTGTATGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154838 CAGAGACACAGCACTTCTTCCTGGGTCTCAACATCCGCTTGTATGCGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TACGGCCTCAGTGAGACCTCAGGCCCCCACTTCATGTCCAGTCCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154888 TACGGCCTCAGTGAGACCTCAGGCCCCCACTTCATGTCCAGTCCCTACAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTACCGGCTGTACAG         CTCAGGCAAGTTGGTGCCCGGCTGTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 154938 CTACCGGCTGTACAGGTG...CAGCTCAGGCAAGTTGGTGCCCGGCTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GGGTGAAGCTGGTGAACCAGGACGCAGAGGGCATTGGCGAGATCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155697 GGGTGAAGCTGGTGAACCAGGACGCAGAGGGCATTGGCGAGATCTGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TGGGGCCGCACCATATTCATGGGCTACCTGAACATGGAGGACAAGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155747 TGGGGCCGCACCATATTCATGGGCTACCTGAACATGGAGGACAAGACTTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TGAGGCCATCGACGAGGAAGGCTGGCTGCACACGGGTGATGCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155797 TGAGGCCATCGACGAGGAAGGCTGGCTGCACACGGGTGATGCTGGCCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGGACGCCGATGGCTTCCTCTACATCACTGGGCGCCTCAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 155847 TGGACGCCGATGGCTTCCTCTACATCACTGGGCGCCTCAAAGGTG...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1703  AATTAATCATCACAGCTGGTGGGGAGAATGTGCCCCCTGTGCCCATCGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159977 GAATTAATCATCACAGCTGGTGGGGAGAATGTGCCCCCTGTGCCCATCGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGAGGCCGTGAAGATGGAGCTGCCCATCATCAGCAACGCCATGCTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160027 GGAGGCCGTGAAGATGGAGCTGCCCATCATCAGCAACGCCATGCTCATTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GGGACCAGAGGAAGTTCCTGTCCATGCTGCTCACCTTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 160077 GGGACCAGAGGAAGTTCCTGTCCATGCTGCTCACCTTGAAGGTG...CAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TGCACTCTGGACCCAGACACCTCTGACCAGACTGATAATCTGACTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160663 TGCACTCTGGACCCAGACACCTCTGACCAGACTGATAATCTGACTGAACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 AGCTGTGGAGTTCTGCCAGAGGGTGGGCAGCAGAGCCACCACAGTGTCCG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160713 AGCTATGGAGTTCTGCCAGAGGGTGGGCAGCAGAGCCACCACAGTGTCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGATCATAGAGAAGAAGGATGAGGCCGTGTACCAGGCCATCGAAGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160763 AGATCATAGAGAAGAAGGATGAGGCCGTGTACCAGGCCATCGAAGAGGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ATCCGGAGGGTCAACATGAACGCGGCGGCCCGGCCCTACCACATCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160813 ATCCGGAGGGTCAACATGAACGCGGCGGCCCGGCCCTACCACATCCAGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GTGGGCCATTCTCGAGAGAGACTTCTCCATTTCGGGTGGAGAGTTGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 160863 GTGGGCCATTCTCGAGAGAGACTTCTCCATTTCGGGTGGAGAGTTGGGTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2090       GTCCCACGATGAAACTGAAACGGCTCACAGTTTTGGAGAAGTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160913 ...TAGGTCCCACGATGAAACTGAAACGGCTCACAGTTTTGGAGAAGTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .
   2134 AAAGGTATCATTGACTCCTTTTACCAAGAGCAAAAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163017 AAAGGTATCATTGACTCCTTTTACCAAGAGCAAAAAATG