seq1 = pF1KE2370.tfa, 519 bp
seq2 = pF1KE2370/gi568815577f_43069100.tfa (gi568815577f:43069100_43272277), 203178 bp

>pF1KE2370 519
>gi568815577f:43069100_43272277 (Chr21)

1-189  (100001-100189)   100% ->
190-312  (101418-101540)   100% ->
313-519  (102972-103178)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGACCATCCAGCACCCCTGGTTCAAGCGCACCCTGGGGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTGACCATCCAGCACCCCTGGTTCAAGCGCACCCTGGGGCCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCCAGCCGGCTGTTCGACCAGTTTTTCGGCGAGGGCCTTTTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCCCAGCCGGCTGTTCGACCAGTTTTTCGGCGAGGGCCTTTTTGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGACCTGCTGCCCTTCCTGTCGTCCACCATCAGCCCCTACTACCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGACCTGCTGCCCTTCCTGTCGTCCACCATCAGCCCCTACTACCGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTCTTCCGCACCGTGCTGGACTCCGGCATCTCTGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 TCCCTCTTCCGCACCGTGCTGGACTCCGGCATCTCTGAGGTA...CAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCGATCCGACCGGGACAAGTTCGTCATCTTCCTCGATGTGAAGCACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101420 TCGATCCGACCGGGACAAGTTCGTCATCTTCCTCGATGTGAAGCACTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCGGAGGACCTCACCGTGAAGGTGCAGGACGACTTTGTGGAGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101470 CCCCGGAGGACCTCACCGTGAAGGTGCAGGACGACTTTGTGGAGATCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAAAGCACAACGAGCGCCAG         GACGACCACGGCTACATTTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101520 GGAAAGCACAACGAGCGCCAGGTG...CAGGACGACCACGGCTACATTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGTGAGTTCCACCGCCGCTACCGCCTGCCGTCCAACGTGGACCAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102992 CCGTGAGTTCCACCGCCGCTACCGCCTGCCGTCCAACGTGGACCAGTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTCTCTTGCTCCCTGTCTGCCGATGGCATGCTGACCTTCTGTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103042 CCCTCTCTTGCTCCCTGTCTGCCGATGGCATGCTGACCTTCTGTGGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGATCCAGACTGGCCTGGATGCCACCCACGCCGAGCGAGCCATCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103092 AAGATCCAGACTGGCCTGGATGCCACCCACGCCGAGCGAGCCATCCCCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .
    483 GTCGCGGGAGGAGAAGCCCACCTCGGCTCCCTCGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103142 GTCGCGGGAGGAGAAGCCCACCTCGGCTCCCTCGTCC