seq1 = pF1KE2332.tfa, 1653 bp
seq2 = pF1KE2332/gi568815596r_37007276.tfa (gi568815596r:37007276_37247806), 240531 bp

>pF1KE2332 1653
>gi568815596r:37007276_37247806 (Chr2)

(complement)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-240  (100834-100954)   100% ->
241-389  (106106-106254)   100% ->
390-516  (108050-108176)   100% ->
517-593  (109222-109298)   100% ->
594-687  (109444-109537)   98% ->
688-722  (110790-110824)   100% ->
723-785  (112261-112323)   100% ->
786-908  (121396-121518)   100% ->
909-1067  (125143-125301)   100% ->
1068-1248  (127668-127848)   100% ->
1249-1377  (132948-133076)   100% ->
1378-1479  (138512-138613)   100% ->
1480-1533  (140280-140333)   100% ->
1534-1653  (140412-140531)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGTGATCTTTCAGCAGGTTTCTTCATGGAGGAACTTAATACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGTGATCTTTCAGCAGGTTTCTTCATGGAGGAACTTAATACATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGTCAGAAGCAGGGAGTAGTACTTAAATATCAAGAACTGCCTAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGTCAGAAGCAGGGAGTAGTACTTAAATATCAAGAACTGCCTAATTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACCTCCACATGATAGGAG         GTTTACATTTCAAGTTATAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 GACCTCCACATGATAGGAGGTA...CAGGTTTACATTTCAAGTTATAATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGGAAGAGAATTTCCAGAAGGTGAAGGTAGATCAAAGAAGGAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 GATGGAAGAGAATTTCCAGAAGGTGAAGGTAGATCAAAGAAGGAAGCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATGCCGCAGCCAAATTAGCTGTTGAGATACTTAATAAGGAAAAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100906 AAATGCCGCAGCCAAATTAGCTGTTGAGATACTTAATAAGGAAAAGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GCAGTTAGTCCTTTATTATTGACAACAACGAATTCTTCAGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 TG...TAGGCAGTTAGTCCTTTATTATTGACAACAACGAATTCTTCAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGATTATCCATGGGGAATTACATAGGCCTTATCAATAGAATTGCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106148 GGATTATCCATGGGGAATTACATAGGCCTTATCAATAGAATTGCCCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAAAGACTAACTGTAAATTATGAACAGTGTGCATCGGGGGTGCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106198 GAAAAGACTAACTGTAAATTATGAACAGTGTGCATCGGGGGTGCATGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGAAGG         ATTTCATTATAAATGCAAAATGGGACAGAAAGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106248 CAGAAGGGTA...TAGATTTCATTATAAATGCAAAATGGGACAGAAAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATAGTATTGGTACAGGTTCTACTAAACAGGAAGCAAAACAATTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108084 TATAGTATTGGTACAGGTTCTACTAAACAGGAAGCAAAACAATTGGCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAAACTTGCATATCTTCAGATATTATCAGAAGAAACCTCAGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108134 TAAACTTGCATATCTTCAGATATTATCAGAAGAAACCTCAGTGGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    517   AAATCTGACTACCTGTCCTCTGGTTCTTTTGCTACTACGTGTGAGTCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109220 AGAAATCTGACTACCTGTCCTCTGGTTCTTTTGCTACTACGTGTGAGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAAAGCAACTCTTTAGTGACCAGCACACT         CGCTTCTGAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109270 CAAAGCAACTCTTTAGTGACCAGCACACTGTA...TAGCGCTTCTGAATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATCATCTGAAGGTGACTTCTCAGCAGATACATCAGAGATAAATTCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109456 ATCATCTGAAGGTGACTTCTCAGCAGATACATCAGAGATAAATTCTAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTGACAGTTTGAACAGTTCTTCGTTGCTTATG         AATGGTCTC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109506 GTGACAGTTTAAACAGTTCTTCGTTGCTTATGGTA...TAGAATGGTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGAAATAATCAAAGGAAGGCAAAAAG         ATCTTTGGCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 110799 AGAAATAATCAAAGGAAGGCAAAAAGGTG...TAGATCTTTGGCACCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ATTTGACCTTCCTGACATGAAAGAAACAAAGTATACTGTGGACAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112276 ATTTGACCTTCCTGACATGAAAGAAACAAAGTATACTGTGGACAAGAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    786        GTTTGGCATGGATTTTAAAGAAATAGAATTAATTGGCTCAGGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112326 A...AAGGTTTGGCATGGATTTTAAAGAAATAGAATTAATTGGCTCAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGATTTGGCCAAGTTTTCAAAGCAAAACACAGAATTGACGGAAAGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121439 GGATTTGGCCAAGTTTTCAAAGCAAAACACAGAATTGACGGAAAGACTTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CGTTATTAAACGTGTTAAATATAATAACGA         GAAGGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121489 CGTTATTAAACGTGTTAAATATAATAACGAGTA...TAGGAAGGCGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GTGAAGTAAAAGCATTGGCAAAACTTGATCATGTAAATATTGTTCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125154 GTGAAGTAAAAGCATTGGCAAAACTTGATCATGTAAATATTGTTCACTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AATGGCTGTTGGGATGGATTTGATTATGATCCTGAGACCAGTGATGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125204 AATGGCTGTTGGGATGGATTTGATTATGATCCTGAGACCAGTGATGATTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCTTGAGAGCAGTGATTATGATCCTGAGAACAGCAAAAATAGTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 125254 TCTTGAGAGCAGTGATTATGATCCTGAGAACAGCAAAAATAGTTCAAGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1068        GTCAAAGACTAAGTGCCTTTTCATCCAAATGGAATTCTGTGAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125304 A...CAGGTCAAAGACTAAGTGCCTTTTCATCCAAATGGAATTCTGTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AAAGGGACCTTGGAACAATGGATTGAAAAAAGAAGAGGCGAGAAACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127711 AAAGGGACCTTGGAACAATGGATTGAAAAAAGAAGAGGCGAGAAACTAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAAAGTTTTGGCTTTGGAACTCTTTGAACAAATAACAAAAGGGGTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127761 CAAAGTTTTGGCTTTGGAACTCTTTGAACAAATAACAAAAGGGGTGGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATATACATTCAAAAAAATTAATTCATAGAGATCTTAAG         CCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127811 ATATACATTCAAAAAAATTAATTCATAGAGATCTTAAGGTA...TAGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AGTAATATATTCTTAGTAGATACAAAACAAGTAAAGATTGGAGACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132951 AGTAATATATTCTTAGTAGATACAAAACAAGTAAAGATTGGAGACTTTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 ACTTGTAACATCTCTGAAAAATGATGGAAAGCGAACAAGGAGTAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133001 ACTTGTAACATCTCTGAAAAATGATGGAAAGCGAACAAGGAGTAAGGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTTTGCGATACATGAGCCCAGAACAG         ATTTCTTCGCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 133051 CTTTGCGATACATGAGCCCAGAACAGGTA...TAGATTTCTTCGCAAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TATGGAAAGGAAGTGGACCTCTACGCTTTGGGGCTAATTCTTGCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138527 TATGGAAAGGAAGTGGACCTCTACGCTTTGGGGCTAATTCTTGCTGAACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCTTCATGTATGTGACACTGCTTTTGAAACATCAAAG         TTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 138577 TCTTCATGTATGTGACACTGCTTTTGAAACATCAAAGGTA...CAGTTTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCACAGACCTACGGGATGGCATCATCTCAGATATATTTGATAAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140284 TCACAGACCTACGGGATGGCATCATCTCAGATATATTTGATAAAAAAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534          AAAACTCTTCTACAGAAATTACTCTCAAAGAAACCTGAGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140334 GTA...CAGAAAACTCTTCTACAGAAATTACTCTCAAAGAAACCTGAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TCGACCTAACACATCTGAAATACTAAGGACCTTGACTGTGTGGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140453 TCGACCTAACACATCTGAAATACTAAGGACCTTGACTGTGTGGAAGAAAA

   1750     .    :    .    :    .
   1625 GCCCAGAGAAAAATGAACGACACACATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 140503 GCCCAGAGAAAAATGAACGACACACATGT