seq1 = pF1KE2317.tfa, 3153 bp
seq2 = pF1KE2317/gi568815581f_49956440.tfa (gi568815581f:49956440_50188332), 231893 bp

>pF1KE2317 3153
>gi568815581f:49956440_50188332 (Chr17)

1-206  (100001-100206)   100% ->
207-334  (107638-107765)   100% ->
335-414  (108089-108168)   100% ->
415-664  (111617-111866)   100% ->
665-751  (114405-114491)   100% ->
752-959  (114872-115079)   100% ->
960-1156  (115547-115743)   99% ->
1157-1245  (117477-117565)   98% ->
1246-1382  (117705-117841)   100% ->
1383-1469  (118009-118095)   100% ->
1470-1537  (119020-119087)   100% ->
1538-1674  (119160-119296)   100% ->
1675-1824  (119887-120036)   100% ->
1825-1922  (120145-120242)   100% ->
1923-2070  (120535-120682)   100% ->
2071-2139  (120940-121008)   100% ->
2140-2219  (121607-121686)   98% ->
2220-2297  (121768-121845)   100% ->
2298-2400  (122385-122487)   100% ->
2401-2583  (122637-122819)   100% ->
2584-2706  (122996-123118)   100% ->
2707-2820  (123823-123936)   100% ->
2821-2919  (124871-124969)   100% ->
2920-3045  (131305-131430)   100% ->
3046-3153  (131786-131893)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCCGGCCCCAGCCGCGCGCCCCGCGCCCCACGCCTGATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCCCGGCCCCAGCCGCGCGCCCCGCGCCCCACGCCTGATGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGCTCGCCTTGATGGTGGCGGCCGGCGGCTGCGTCGTCTCCGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCGCTCGCCTTGATGGTGGCGGCCGGCGGCTGCGTCGTCTCCGCCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGGATACCCGATTCCTGGTAGTGAAGGAGGCCGGGAACCCGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGGATACCCGATTCCTGGTAGTGAAGGAGGCCGGGAACCCGGGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTCGGCTACTCGGTCGCCCTCCATCGGCAGACAGAGCGGCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTTCGGCTACTCGGTCGCCCTCCATCGGCAGACAGAGCGGCAGCAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACCT         GCTCCTGGCTGGTGCCCCCCGGGAGCTCGCTGTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACCTGTA...CAGGCTCCTGGCTGGTGCCCCCCGGGAGCTCGCTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGATGGCTACACCAACCGGACTGGTGCTGTGTACCTGTGCCCACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107673 CCGATGGCTACACCAACCGGACTGGTGCTGTGTACCTGTGCCCACTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCCACAAGGATGACTGTGAGCGGATGAACATCACAGTGAAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107723 GCCCACAAGGATGACTGTGAGCGGATGAACATCACAGTGAAAAGTG...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335   ATGACCCTGGCCATCACATTATTGAGGACATGTGGCTTGGAGTGACTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108087 AGATGACCCTGGCCATCACATTATTGAGGACATGTGGCTTGGAGTGACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCCAGCCAGGGCCCTGCAGGCAGAGTTCTG         GTCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108137 TGGCCAGCCAGGGCCCTGCAGGCAGAGTTCTGGTA...CAGGTCTGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACCGCTACACCCAGGTGCTGTGGTCAGGGTCAGAAGACCAGCGGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111626 CACCGCTACACCCAGGTGCTGTGGTCAGGGTCAGAAGACCAGCGGCGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTGGGCAAGTGCTACGTGCGAGGCAATGACCTAGAGCTGGACTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111676 GGTGGGCAAGTGCTACGTGCGAGGCAATGACCTAGAGCTGGACTCCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGACTGGCAGACCTACCACAACGAGATGTGCAATAGCAACACAGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111726 ATGACTGGCAGACCTACCACAACGAGATGTGCAATAGCAACACAGACTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGAGACGGGCATGTGCCAGCTGGGCACCAGCGGTGGCTTCACCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111776 CTGGAGACGGGCATGTGCCAGCTGGGCACCAGCGGTGGCTTCACCCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACTGTGTACTTCGGCGCCCCCGGTGCCTACAACTGGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111826 CACTGTGTACTTCGGCGCCCCCGGTGCCTACAACTGGAAAGGTG...AAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAAACAGCTACATGATTCAGCGCAAGGAGTGGGACTTATCTGAGTATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114405 GAAACAGCTACATGATTCAGCGCAAGGAGTGGGACTTATCTGAGTATAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACAAGGACCCAGAGGACCAAGGAAACCTCTATATTG         GGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114455 TACAAGGACCCAGAGGACCAAGGAAACCTCTATATTGGTG...CAGGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACGATGCAGGTAGGCAGCTTCATCCTGCACCCCAAAAACATCACCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114876 CACGATGCAGGTAGGCAGCTTCATCCTGCACCCCAAAAACATCACCATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGACAGGTGCCCCACGGCACCGACATATGGGCGCGGTGTTCTTGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114926 TGACAGGTGCCCCACGGCACCGACATATGGGCGCGGTGTTCTTGCTGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGGAGGCAGGCGGAGACCTGCGGAGGAGGCAGGTGCTGGAGGGCTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114976 CAGGAGGCAGGCGGAGACCTGCGGAGGAGGCAGGTGCTGGAGGGCTCGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGTGGGCGCCTATTTTGGCAGCGCCATTGCCCTGGCAGACCTGAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115026 GGTGGGCGCCTATTTTGGCAGCGCCATTGCCCTGGCAGACCTGAACAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATGG         GTGGCAGGACCTCCTGGTGGGCGCCCCCTACTACTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 115076 ATGGGTG...TAGGTGGCAGGACCTCCTGGTGGGCGCCCCCTACTACTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGAGGAAAGAGGAAGTAGGGGGTGCCATCTATGTCTTCATGAACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115584 GAGAGGAAAGAGGAAGTAGGGGGTGCCATCTATGTCTTCATGAACCAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGGAACCTCCTTCCCTGCTCACCCCTCACTCCTTCTTCATGGCCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115634 GGGAACCTCCTTCCCTGCTCACCCCTCACTCCTTCTTCATGGCCCCAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCTCTGCCTTTGGTTTATCTGTGGCCAGCATTGGTGACATCAACCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115684 GCTCTGCCTTTGGTTTATCTGTGGCCAGCATTGGTGACATCAACCAGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGATTTCAGG         ATATTGCTGTGGGAGCTCCGTTTGAAGGCTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 115734 GGATTTCAGGGTA...CAGATATTGCTGTGGGAGCTCCGTTTGAAGGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGGCAAAGTGTACATCTATCACAGTAGCTCTAAGGGGCTCCTCAGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 117508 GGGCAAAGTGTACATCTATCACAGTAGCTCTAAGGGGCTCCTTAGACAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCCAGCAG         GTAATCCATGGAGAGAAGCTGGGACTGCCTGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 117558 CCCAGCAGGTA...CAGGTAATCCATGGAGAGAAGCTGGGACTGCCTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTGGCCACCTTCGGCTATTCCCTCAGTGGGCAGATGGATGTGGATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117738 TTGGCCACCTTCGGCTATTCCCTCAGTGGGCAGATGGATGTGGATGAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CTTCTACCCAGACCTTCTAGTGGGAAGCCTGTCAGACCACATTGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117788 CTTCTACCCAGACCTTCTAGTGGGAAGCCTGTCAGACCACATTGTGCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGCG         GGCCCGGCCCGTCATCAACATCGTCCACAAGACCTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117838 TGCGGTG...CAGGGCCCGGCCCGTCATCAACATCGTCCACAAGACCTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GTGCCCAGGCCAGCTGTGCTGGACCCTGCACTTTGCACGGCCACCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118046 GTGCCCAGGCCAGCTGTGCTGGACCCTGCACTTTGCACGGCCACCTCTTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470          TGTGCAAGTGGAGCTGTGCTTTGCTTACAACCAGAGTGCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118096 GTG...CAGTGTGCAAGTGGAGCTGTGCTTTGCTTACAACCAGAGTGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GGAACCCCAACTACAGGCGAAACATCA         CCCTGGCCTACACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119061 GGAACCCCAACTACAGGCGAAACATCAGTG...TAGCCCTGGCCTACACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGGAGGCTGACAGGGACCGCCGGCCGCCCCGGCTCCGCTTTGCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119174 CTGGAGGCTGACAGGGACCGCCGGCCGCCCCGGCTCCGCTTTGCCGGCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TGAGTCCGCTGTCTTCCACGGCTTCTTCTCCATGCCCGAGATGCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119224 TGAGTCCGCTGTCTTCCACGGCTTCTTCTCCATGCCCGAGATGCGCTGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGAAGCTGGAGCTGCTCCTGATG         GACAACCTCCGTGACAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 119274 AGAAGCTGGAGCTGCTCCTGATGGTG...CAGGACAACCTCCGTGACAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CTCCGCCCCATCATCATCTCCATGAACTACTCTTTACCTTTGCGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119905 CTCCGCCCCATCATCATCTCCATGAACTACTCTTTACCTTTGCGGATGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CGATCGCCCCCGGCTGGGGCTGCGGTCCCTGGACGCCTACCCGATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119955 CGATCGCCCCCGGCTGGGGCTGCGGTCCCTGGACGCCTACCCGATCCTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACCAGGCACAGGCTCTGGAGAACCACACTGAG         GTCCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 120005 ACCAGGCACAGGCTCTGGAGAACCACACTGAGGTG...CAGGTCCAGTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CAGAAGGAGTGCGGGCCTGACAACAAGTGTGAGAGCAACTTGCAGATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120154 CAGAAGGAGTGCGGGCCTGACAACAAGTGTGAGAGCAACTTGCAGATGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGCAGCCTTCGTGTCAGAGCAGCAGCAGAAGCTGAGCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 120204 GGCAGCCTTCGTGTCAGAGCAGCAGCAGAAGCTGAGCAGGTG...CAGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TCCAGTACAGCAGAGACGTCCGGAAATTGCTCCTGAGCATCAACGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120537 TCCAGTACAGCAGAGACGTCCGGAAATTGCTCCTGAGCATCAACGTGACG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AACACCCGGACCTCGGAGCGCTCCGGGGAGGACGCCCACGAGGCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120587 AACACCCGGACCTCGGAGCGCTCCGGGGAGGACGCCCACGAGGCGCTGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CACCCTGGTGGTGCCTCCCGCCCTGCTGCTGTCCTCAGTGCGCCCC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 120637 CACCCTGGTGGTGCCTCCCGCCCTGCTGCTGTCCTCAGTGCGCCCCGTG.

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071      CCCGGGGCCTGCCAAGCTAATGAGACCATCTTTTGCGAGCTGGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120687 ..CAGCCCGGGGCCTGCCAAGCTAATGAGACCATCTTTTGCGAGCTGGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AACCCCTTCAAACGGAACCAGAGG         ATGGAGCTGCTCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| |
 120985 AACCCCTTCAAACGGAACCAGAGGGTG...CAGATGGAGCTGCTCATCGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CTTTGAGGTCATCGGGGTGACCCTGCACACAAGGGACCTTCAGGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121624 CTTTGAGGTCATCGGGGTGACCCTGCACACAAGGGACCTTCAGGTGCAGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TGCAGCTCTCCAC         GTCGAGTCACCAGGACAACCTGTGGCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 121674 TGCAGCTCTCCACGTG...AAGGTCGAGTCACCAGGACAACCTGTGGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ATGATCCTCACTCTGCTGGTGGACTATACACTCCAGACCTCGCTTAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121796 ATGATCCTCACTCTGCTGGTGGACTATACACTCCAGACCTCGCTTAGCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298          GGTAAATCACCGGCTACAAAGCTTCTTTGGGGGGACAGTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121846 GTG...TAGGGTAAATCACCGGCTACAAAGCTTCTTTGGGGGGACAGTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TGGGTGAGTCTGGCATGAAAACTGTGGAGGATGTAGGAAGCCCCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122426 TGGGTGAGTCTGGCATGAAAACTGTGGAGGATGTAGGAAGCCCCCTCAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TATGAATTCCAG         GTGGGCCCAATGGGGGAGGGGCTGGTGGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122476 TATGAATTCCAGGTA...CAGGTGGGCCCAATGGGGGAGGGGCTGGTGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 CCTGGGGACCCTGGTCCTAGGTCTGGAGTGGCCCTACGAAGTCAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122666 CCTGGGGACCCTGGTCCTAGGTCTGGAGTGGCCCTACGAAGTCAGCAATG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GCAAGTGGCTGCTGTATCCCACGGAGATCACCGTCCATGGCAATGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122716 GCAAGTGGCTGCTGTATCCCACGGAGATCACCGTCCATGGCAATGGGTCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 TGGCCCTGCCGACCACCTGGAGACCTTATCAACCCTCTCAACCTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122766 TGGCCCTGCCGACCACCTGGAGACCTTATCAACCCTCTCAACCTCACTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TTCT         GACCCTGGGGACAGGCCATCATCCCCACAGCGCAGGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122816 TTCTGTA...CAGGACCCTGGGGACAGGCCATCATCCCCACAGCGCAGGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 GGCGACAGCTGGATCCAGGGGGAGGCCAGGGCCCCCCACCTGTCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123033 GGCGACAGCTGGATCCAGGGGGAGGCCAGGGCCCCCCACCTGTCACTCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GCTGCTGCCAAAAAAGCCAAGTCTGAGACTGTGCTG         ACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123083 GCTGCTGCCAAAAAAGCCAAGTCTGAGACTGTGCTGGTG...CAGACCTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 TGCCACAGGGCGTGCCCACTGTGTGTGGCTAGAGTGCCCCATCCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123828 TGCCACAGGGCGTGCCCACTGTGTGTGGCTAGAGTGCCCCATCCCTGATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 CCCCCGTTGTCACCAACGTGACTGTGAAGGCACGAGTGTGGAACAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123878 CCCCCGTTGTCACCAACGTGACTGTGAAGGCACGAGTGTGGAACAGCACC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 TTCATCGAG         GATTACAGAGACTTTGACCGAGTCCGGGTAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 123928 TTCATCGAGGTC...CAGGATTACAGAGACTTTGACCGAGTCCGGGTAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 TGGCTGGGCTACCCTATTCCTCCGAACCAGCATCCCCACCATCAACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124903 TGGCTGGGCTACCCTATTCCTCCGAACCAGCATCCCCACCATCAACATGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 AGAACAAGACCACGTGG         TTCTCTGTGGACATTGACTCGGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 124953 AGAACAAGACCACGTGGGTG...CAGTTCTCTGTGGACATTGACTCGGAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 CTGGTGGAGGAGCTGCCGGCCGAAATCGAGCTGTGGCTGGTGCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131329 CTGGTGGAGGAGCTGCCGGCCGAAATCGAGCTGTGGCTGGTGCTGGTGGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 CGTGGGTGCAGGGCTGCTGCTGCTGGGGCTGATCATCCTCCTGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131379 CGTGGGTGCAGGGCTGCTGCTGCTGGGGCTGATCATCCTCCTGCTGTGGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 AG         TGCGGCTTCTTCAAGCGAGCCCGCACTCGCGCCCTGTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131429 AGGTT...CAGTGCGGCTTCTTCAAGCGAGCCCGCACTCGCGCCCTGTAT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3085 GAAGCTAAGAGGCAGAAGGCGGAGATGAAGAGCCAGCCGTCAGAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131825 GAAGCTAAGAGGCAGAAGGCGGAGATGAAGAGCCAGCCGTCAGAGACAGA

   3350     .    :    .
   3135 GAGGCTGACCGACGACTAC
        |||||||||||||||||||
 131875 GAGGCTGACCGACGACTAC