seq1 = pF1KE2315.tfa, 3303 bp
seq2 = pF1KE2315/gi568815594r_83307456.tfa (gi568815594r:83307456_83555693), 248238 bp

>pF1KE2315 3303
>gi568815594r:83307456_83555693 (Chr4)

(complement)

1-297  (100001-100297)   99% ->
298-1012  (101749-102463)   100% ->
1013-1191  (106733-106911)   100% ->
1192-1392  (108659-108859)   100% ->
1393-1465  (109608-109680)   100% ->
1466-1563  (112080-112177)   100% ->
1564-1662  (114291-114389)   100% ->
1663-1808  (115686-115831)   100% ->
1809-2048  (118597-118836)   100% ->
2049-2190  (123427-123568)   100% ->
2191-2295  (123926-124030)   100% ->
2296-2518  (125948-126170)   100% ->
2519-2676  (127974-128131)   100% ->
2677-2775  (129602-129700)   100% ->
2776-2949  (133958-134131)   100% ->
2950-3063  (137488-137601)   100% ->
3064-3198  (138829-138963)   100% ->
3199-3303  (148134-148238)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAATGTGGTTCCCGCATCCGCCGGCGGGTGTCTCTCCCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAATGTGGTTCCCGCATCCGCCGGCGGGTGTCTCTCCCCAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCGTCCAAGCTTGGGGTGTATTTTTGGCGCTCCCACCGCGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACCGTCCAAGCTTGGGGTGTATTTTTGGCGCTCCCACCGCGGCCGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGAGCCCGGAGATGAGGGGAAAGAGGAGGAGGAAATGGTGGCTGAGAAC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGTGCCCGGAGATGAGGGGAAAGAGGAGGAGGAAATGGTGGCTGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGAGGCGGAAAACCGCGGGCGTACTGCCGGTTGAGGTACAGCCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGAGGCGGAAAACCGCGGGCGTACTGCCGGTTGAGGTACAGCCCCTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTCTCAGATTCCCCGGAATGTCTCGTCCTTGGAGGTGGTGATACAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTCTCAGATTCCCCGGAATGTCTCGTCCTTGGAGGTGGTGATACAAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGACCTCCTACGTCACATGCCCACTGACAGAGGGGTGGGAGACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100251 CGGACCTCCTACGTCACATGCCCACTGACAGAGGGGTGGGAGACCAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298       CCTAATGACAGTGAAGTGGACATGTTTGGTGACTATGATAGCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ...CAGCCTAATGACAGTGAAGTGGACATGTTTGGTGACTATGATAGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TACTGAAAACTCCTTTATAGCTCAAGTTGACGACCTGGAACAAAAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101793 TACTGAAAACTCCTTTATAGCTCAAGTTGACGACCTGGAACAAAAATATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCAACTCCCTGAACATAAGAAACATGCTACAGACTTTGCCACTGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101843 TGCAACTCCCTGAACATAAGAAACATGCTACAGACTTTGCCACTGAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTTTGCTCGGAAAGTATCAAAAACAAACTCAGCATTACTACCATAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101893 CTTTGCTCGGAAAGTATCAAAAACAAACTCAGCATTACTACCATAGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCTTACTGAATTACAAACTGATAAGCACACAGAGAACCAGAGTGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101943 CCTTACTGAATTACAAACTGATAAGCACACAGAGAACCAGAGTGGATATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGGTGTCACTATTGAACCTGGAGCTGATCTTTTGTATGATGTACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101993 AAGGTGTCACTATTGAACCTGGAGCTGATCTTTTGTATGATGTACCTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCACAGGCTATATACTTTGAAAATTTGCAGAACTCTTCAAATGATTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102043 TCACAGGCTATATACTTTGAAAATTTGCAGAACTCTTCAAATGATTTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGATCATTCTATGAAAGAAAGGGATTGGAAGTCATCCTCTCACAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102093 TGATCATTCTATGAAAGAAAGGGATTGGAAGTCATCCTCTCACAACACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGAATGAGGAACTGCCCCATAATTGCATAGAGCAACCCCAGCAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 TGAATGAGGAACTGCCCCATAATTGCATAGAGCAACCCCAGCAAAATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGTCCTCTTCCAAAGTCAGAACTAGTTCAGATATGAACAGGAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102193 GAGTCCTCTTCCAAAGTCAGAACTAGTTCAGATATGAACAGGAGAAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TATTAAAGATCATCTAAAAAATGCCATGACTGGAAATGCGAAGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102243 TATTAAAGATCATCTAAAAAATGCCATGACTGGAAATGCGAAGGCCCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CACCAATATTTTCTAGAAGTAAACAGCTCAAAGACACTCTCCTATCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102293 CACCAATATTTTCTAGAAGTAAACAGCTCAAAGACACTCTCCTATCTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAAATTAATGTTGCTAAGAAAACAGTTGAGTCATCATCAAATGACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102343 GAAATTAATGTTGCTAAGAAAACAGTTGAGTCATCATCAAATGACCTTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCCTTTTTATTCATTACCCAGCAAAGTGAGAGACCTTTATGCCCAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102393 TCCTTTTTATTCATTACCCAGCAAAGTGAGAGACCTTTATGCCCAATTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGGGAATTGAAAAATTATATG         AATGGCAACATACTTGTTTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102443 AGGGAATTGAAAAATTATATGGTA...CAGAATGGCAACATACTTGTTTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ACATTGAATTCTGTGCAAGAAAGAAAAAATTTAATATATTCCTTGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106753 ACATTGAATTCTGTGCAAGAAAGAAAAAATTTAATATATTCCTTGCCAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AAGTGGTGGAAAAACCCTCGTGGCTGAGATTTTAATGCTGCAAGAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106803 AAGTGGTGGAAAAACCCTCGTGGCTGAGATTTTAATGCTGCAAGAACTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TTTGCTGTCGGAAAGATGTTTTAATGATTCTTCCATATGTGGCAATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106853 TTTGCTGTCGGAAAGATGTTTTAATGATTCTTCCATATGTGGCAATTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CAAGAAAAG         ATTTCAGGTTTGTCAAGTTTTGGTATAGAACT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106903 CAAGAAAAGGTG...TAGATTTCAGGTTTGTCAAGTTTTGGTATAGAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CGGTTTCTTTGTTGAAGAATATGCTGGAAGCAAAGGAAGATTTCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108691 CGGTTTCTTTGTTGAAGAATATGCTGGAAGCAAAGGAAGATTTCCTCCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CTAAAAGAAGGGAAAAGAAATCACTCTATATTGCCACTATTGAAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108741 CTAAAAGAAGGGAAAAGAAATCACTCTATATTGCCACTATTGAAAAAGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CATAGCTTGGTGAACTCCTTGATTGAAACTGGAAGAATTGACAGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108791 CATAGCTTGGTGAACTCCTTGATTGAAACTGGAAGAATTGACAGTCTGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TCTGGTTGTTGTAGACGAG         TTGCACATGATTGGTGAAGGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108841 TCTGGTTGTTGTAGACGAGGTT...AAGTTGCACATGATTGGTGAAGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GCCGTGGAGCTACACTGGAAATGACCCTAGCAAAAATCCTCTACACTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109630 GCCGTGGAGCTACACTGGAAATGACCCTAGCAAAAATCCTCTACACTAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 A         AAACGACTCAAATTATTGGTATGAGTGCAACATTAAACAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109680 AGTA...TAGAAACGACTCAAATTATTGGTATGAGTGCAACATTAAACAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TGTTGAAGACCTACAAAAGTTTCTTCAAGCAGAATATTATACCAGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112120 TGTTGAAGACCTACAAAAGTTTCTTCAAGCAGAATATTATACCAGTCAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TTAGACCA         GTTGAGTTAAAAGAATATCTGAAAATAAATGAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112170 TTAGACCAGTA...AAGGTTGAGTTAAAAGAATATCTGAAAATAAATGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 ACAATATATGAAGTTGACAGCAAAGCTGAGAATGGCATGACTTTTTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114324 ACAATATATGAAGTTGACAGCAAAGCTGAGAATGGCATGACTTTTTCACG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TCTTCTTAATTATAAG         TATTCTGATACCCTAAAAAAGATGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114374 TCTTCTTAATTATAAGGTA...CAGTATTCTGATACCCTAAAAAAGATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ATCCTGATCACTTGGTAGCATTGGTGACAGAAGTTATTCCCAATTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115711 ATCCTGATCACTTGGTAGCATTGGTGACAGAAGTTATTCCCAATTATTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TGCTTAGTTTTTTGTCCTAGTAAGAAGAACTGTGAAAATGTAGCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115761 TGCTTAGTTTTTTGTCCTAGTAAGAAGAACTGTGAAAATGTAGCAGAAAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GATATGCAAATTTTTAAGCAA         GGAATATCTGAAACATAAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 115811 GATATGCAAATTTTTAAGCAAGTA...TAGGGAATATCTGAAACATAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AGAAAGAAAAATGTGAGGTGATTAAGAACTTGAAGAATATTGGCAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118617 AGAAAGAAAAATGTGAGGTGATTAAGAACTTGAAGAATATTGGCAATGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 AACCTGTGTCCTGTTTTAAAGCGCACTATCCCATTTGGAGTTGCCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118667 AACCTGTGTCCTGTTTTAAAGCGCACTATCCCATTTGGAGTTGCCTATCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CCACAGTGGCTTAACAAGTGATGAAAGGAAACTCTTGGAGGAGGCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118717 CCACAGTGGCTTAACAAGTGATGAAAGGAAACTCTTGGAGGAGGCCTACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CCACAGGAGTGCTCTGTCTTTTTACCTGCACATCTACCCTAGCGGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118767 CCACAGGAGTGCTCTGTCTTTTTACCTGCACATCTACCCTAGCGGCAGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 GTCAACCTACCAGCTCGAAG         AGTTATTTTAAGAGCTCCCTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118817 GTCAACCTACCAGCTCGAAGGTA...CAGAGTTATTTTAAGAGCTCCCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TGTTGCTAAGGAATTTTTAAAGAGGAATCAATATAAACAGATGATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123448 TGTTGCTAAGGAATTTTTAAAGAGGAATCAATATAAACAGATGATTGGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 GAGCTGGTCGTGCTGGAATAGATACTATTGGGGAGAGTATCCTCATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123498 GAGCTGGTCGTGCTGGAATAGATACTATTGGGGAGAGTATCCTCATATTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 CAAGAAAAAGACAAACAACAG         GTATTGGAGTTAATAACTAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 123548 CAAGAAAAAGACAAACAACAGGTA...TAGGTATTGGAGTTAATAACTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 ACCATTGGAAAACTGTTACAGCCATCTTGTTCAGGAATTCACCAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123946 ACCATTGGAAAACTGTTACAGCCATCTTGTTCAGGAATTCACCAAGGGAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 TCCAAACATTATTTCTCTCTTTGATTGGTTTGAAG         ATTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123996 TCCAAACATTATTTCTCTCTTTGATTGGTTTGAAGGTA...CAGATTGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2302 ACGAATCTTGATGACATCTATCATTTCATGAATGGTACATTTTTTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125954 ACGAATCTTGATGACATCTATCATTTCATGAATGGTACATTTTTTGGTGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 TCAGCAAAAGGTTTTATTGAAAGAAAAAAGTCTCTGGGAAATAACTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126004 TCAGCAAAAGGTTTTATTGAAAGAAAAAAGTCTCTGGGAAATAACTGTTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 AATCACTTAGATACCTGACAGAAAAAGGACTCCTACAAAAAGACACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126054 AATCACTTAGATACCTGACAGAAAAAGGACTCCTACAAAAAGACACTATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 TATAAGTCTGAAGAAGAGGTCCAATATAATTTTCATATTACAAAGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126104 TATAAGTCTGAAGAAGAGGTCCAATATAATTTTCATATTACAAAGTTGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 ACGTGCTTCATTTAAGG         GAACTATAGATTTAGCTTATTGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 126154 ACGTGCTTCATTTAAGGGTA...TAGGAACTATAGATTTAGCTTATTGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2543 ACATTCTGTACAGAGACTTGAAGAAAGGTCTTGAAGGACTTGTGCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127998 ACATTCTGTACAGAGACTTGAAGAAAGGTCTTGAAGGACTTGTGCTTGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2593 AGCCTTCTTCATCTAATCTACCTAACAACCCCCTATGATCTGGTTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128048 AGCCTTCTTCATCTAATCTACCTAACAACCCCCTATGATCTGGTTTCACA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643 GTGTAACCCTGATTGGATGATATACTTCAGGCAG         TTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 128098 GTGTAACCCTGATTGGATGATATACTTCAGGCAGGTG...TAGTTTAGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2684 AACTCAGTCCAGCAGAACAAAATGTAGCTGCCATTCTTGGAGTCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129609 AACTCAGTCCAGCAGAACAAAATGTAGCTGCCATTCTTGGAGTCTCTGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2734 AGCTTTATTGGGAAGAAAGCATCAGGCCAAGCCATCGGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 129659 AGCTTTATTGGGAAGAAAGCATCAGGCCAAGCCATCGGAAAGGTA...TA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2776  AAGGTGGACAAGAACGTTGTCAACAGGCTATATCTGTCTTTTGTTCTTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133957 GAAGGTGGACAAGAACGTTGTCAACAGGCTATATCTGTCTTTTGTTCTTT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2825 ATACCTTGCTCAAAGAGACCAACATTTGGACTGTATCTGAAAAATTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134007 ATACCTTGCTCAAAGAGACCAACATTTGGACTGTATCTGAAAAATTTAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2875 ATGCCTCGAGGATATATACAAAATCTTCTCACTGGAACTGCCTCATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134057 ATGCCTCGAGGATATATACAAAATCTTCTCACTGGAACTGCCTCATTCTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2925 ATCTTGTGTGTTACATTTCTGTGAG         GAGCTTGAGGAGTTTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 134107 ATCTTGTGTGTTACATTTCTGTGAGGTA...CAGGAGCTTGAGGAGTTTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2966 GGGTTTACAGAGCCCTTTTGGTAGAACTTACCAAGAAGCTGACTTACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137504 GGGTTTACAGAGCCCTTTTGGTAGAACTTACCAAGAAGCTGACTTACTGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3016 GTAAAGGCAGAATTAATCCCTCTCATGGAAGTTACTGGAGTTTTAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137554 GTAAAGGCAGAATTAATCCCTCTCATGGAAGTTACTGGAGTTTTAGAGGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3064        GGTCGAGCAAAACAGTTATACAGTGCAGGTTACAAAAGTCTAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137604 C...CAGGGTCGAGCAAAACAGTTATACAGTGCAGGTTACAAAAGTCTAA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3107 TGCACTTAGCTAATGCAAATCCTGAAGTGCTCGTAAGGACAATTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138872 TGCACTTAGCTAATGCAAATCCTGAAGTGCTCGTAAGGACAATTGATCAT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3157 TTATCAAGACGCCAAGCCAAGCAAATTGTTTCATCAGCAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 138922 TTATCAAGACGCCAAGCCAAGCAAATTGTTTCATCAGCAAAGGTA...TA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3199  ATGCTGTTGCATGAAAAAGCAGAAGCCCTGCAAGAAGAGGTAGAAGAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148133 GATGCTGTTGCATGAAAAAGCAGAAGCCCTGCAAGAAGAGGTAGAAGAGT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 TACTAAGATTGCCTTCTGATTTCCCTGGTGCTGTGGCTTCTTCCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148183 TACTAAGATTGCCTTCTGATTTCCCTGGTGCTGTGGCTTCTTCCACTGAC

   3450     .
   3298 AAAGCA
        ||||||
 148233 AAAGCA