seq1 = pF1KE2273.tfa, 1677 bp
seq2 = pF1KE2273/gi568815577f_36286137.tfa (gi568815577f:36286137_36516363), 230227 bp

>pF1KE2273 1677
>gi568815577f:36286137_36516363 (Chr21)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-259  (101462-101594)   100% ->
260-377  (105415-105532)   100% ->
378-481  (108411-108514)   100% ->
482-578  (111279-111375)   100% ->
579-663  (113385-113469)   100% ->
664-757  (116622-116715)   100% ->
758-827  (122625-122694)   100% ->
828-919  (123238-123329)   100% ->
920-1061  (125327-125468)   100% ->
1062-1493  (126748-127179)   99% ->
1494-1588  (129159-129253)   100% ->
1589-1677  (130139-130227)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGTCATCACTTGTGAAATAGCCTGGCACAACAAGGAGCCCGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGTCATCACTTGTGAAATAGCCTGGCACAACAAGGAGCCCGTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCCTGGACTTCCAGCATGGGACGGCTGGGAGGATCCACAGACTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCCTGGACTTCCAGCATGGGACGGCTGGGAGGATCCACAGACTGGCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCGGCGTGGACACCAATGTCAGG         ATCTGGAAGGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 CTGCCGGCGTGGACACCAATGTCAGGGTA...CAGATCTGGAAGGTAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGGACCAGATGGAAAAGCCATCGTGGAATTTTTGTCCAATCTTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101477 AAGGGACCAGATGGAAAAGCCATCGTGGAATTTTTGTCCAATCTTGCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCATACCAAAGCCGTCAATGTTGTGCGTTTTTCTCCAACTGGGGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101527 TCATACCAAAGCCGTCAATGTTGTGCGTTTTTCTCCAACTGGGGAAATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGCATCGGGAGGAGATG         ATGCTGTCATCCTATTGTGGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101577 TAGCATCGGGAGGAGATGGTG...CAGATGCTGTCATCCTATTGTGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGAATGATAACAAGGAGCCGGAGCAGATCGCTTTTCAGGATGAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105438 GTGAATGATAACAAGGAGCCGGAGCAGATCGCTTTTCAGGATGAGGACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCCAGCTGAACAAGGAGAACTGGACGGTTGTGAAGACTCTGCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105488 GGCCCAGCTGAACAAGGAGAACTGGACGGTTGTGAAGACTCTGCGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    378     GGGCCACTTAGAAGATGTGTATGATATTTGCTGGGCAACTGATGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105538 .TAGGGGCCACTTAGAAGATGTGTATGATATTTGCTGGGCAACTGATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATTTAATGGCTTCTGCCTCTGTGGATAACACAGCCATCATATGGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108457 AATTTAATGGCTTCTGCCTCTGTGGATAACACAGCCATCATATGGGATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGCAAAG         GACAAAAGATATCAATTTTTAATGAACATAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108507 CAGCAAAGGTA...TAGGACAAAAGATATCAATTTTTAATGAACATAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTTATGTCCAAGGAGTAACCTGGGACCCTTTGGGTCAATATGTTGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111312 GTTATGTCCAAGGAGTAACCTGGGACCCTTTGGGTCAATATGTTGCTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGAGCTGTGACAG         GGTGCTGCGAGTATACAGTATACAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111362 CTGAGCTGTGACAGGTA...CAGGGTGCTGCGAGTATACAGTATACAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAGCGTGTGGCTTTCAATGTTTCGAAGATGCTGTCTGGAATAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113412 GAAGCGTGTGGCTTTCAATGTTTCGAAGATGCTGTCTGGAATAGGGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGGAGAG         GCAAGAAGCTACCGGATGTTTCACGACGACAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 113462 AAGGAGAGGTA...CAGGCAAGAAGCTACCGGATGTTTCACGACGACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGAAGTCTTTCTTCCGTAGACTGAGTTTCACTCCCGACGGATCTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116655 ATGAAGTCTTTCTTCCGTAGACTGAGTTTCACTCCCGACGGATCTTTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTCACGCCAG         CTGGATGTGTGGAATCTGGTGAAAATGTAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116705 TCTCACGCCAGGTG...CAGCTGGATGTGTGGAATCTGGTGAAAATGTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGAATACCACTTATGTTTTCTCCAGGAAGAATCTTAAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 122655 TGAATACCACTTATGTTTTCTCCAGGAAGAATCTTAAAAGGTA...TAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCCATCGCTCATCTTCCATGTCCTGGAAAAGCCACTCTTGCTGTTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123239 CCCATCGCTCATCTTCCATGTCCTGGAAAAGCCACTCTTGCTGTTCGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CTGTCCGGTCTACTTTGAACTGAGGCCAGTGGTGGAAACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123289 CTGTCCGGTCTACTTTGAACTGAGGCCAGTGGTGGAAACAGGTA...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GTGTGGAGCTGATGAGTCTGCCCTACCGCCTGGTGTTTGCTGTGGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125327 GTGTGGAGCTGATGAGTCTGCCCTACCGCCTGGTGTTTGCTGTGGCCTCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGGATTCCGTGCTTCTGTATGACACCCAGCAGTCCTTCCCTTTTGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125377 GAGGATTCCGTGCTTCTGTATGACACCCAGCAGTCCTTCCCTTTTGGTTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CGTGTCTAATATACATTACCACACCCTCAGTGACATTTCATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 125427 CGTGTCTAATATACATTACCACACCCTCAGTGACATTTCATGGTG...AA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1062  GTCCAGCGATGGTGCCTTCCTGGCCATTTCTTCCACGGACGGTTACTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126747 GGTCCAGCGATGGTGCCTTCCTGGCCATTTCTTCCACGGACGGTTACTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCATTTGTGACATTTGAGAAAGATGAACTTGGAATTCCTTTGAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126797 TCATTTGTGACATTTGAGAAAGATGAACTTGGAATTCCTTTGAAAGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCCAGTTTTGAACATGAGAACTCCTGATACAGCAAAGAAAACCAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126847 GCCAGTTTTGAACATGAGAACTCCTGATACAGCAAAGAAAACCAAGAGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGACACATCGAGGGTCTTCGCCAGGACCCAGACTGGTAGAGGGAACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 126897 AGACACATCGAGGGTCTTCGCCAGGACCCAGACCGGTAGAGGGAACCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCCAGCAGAACCCAAGACCCCAGCAGCCCCGGCACGACTCCCCCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126947 GCCAGCAGAACCCAAGACCCCAGCAGCCCCGGCACGACTCCCCCTCAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGACAGGCCCCAGCCCCAACAGTCATCAGGGACCCTCCCTCCATCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126997 CAGACAGGCCCCAGCCCCAACAGTCATCAGGGACCCTCCCTCCATCACTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTGCTGTCAAAAGCCCCTTGCCGGGGCCTTCGGAGGAGAAGACCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127047 CTGCTGTCAAAAGCCCCTTGCCGGGGCCTTCGGAGGAGAAGACCCTGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CCCAGTAGTCAAAACACAAAAGCCCACCCATCCCGGAGGGTCACTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127097 CCCAGTAGTCAAAACACAAAAGCCCACCCATCCCGGAGGGTCACTCTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CACACTGCAAGCCTGGAGCAAGACAACACCCCG         GAGAATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 127147 CACACTGCAAGCCTGGAGCAAGACAACACCCCGGTA...AAGGAGAATAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACTTAACACCCTTAAAGACGGACACTCCACCAAGTTCTGTACCAACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129167 ACTTAACACCCTTAAAGACGGACACTCCACCAAGTTCTGTACCAACCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GTGATTTCCACCCCTTCTACAGAAGAAATTCAGTCAG         AGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 129217 GTGATTTCCACCCCTTCTACAGAAGAAATTCAGTCAGGTA...CAGAGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCCTGGAGACGCTCAGGGCAGTCCCCCAGAGCTAAAGCGGCCCAGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130143 GCCTGGAGACGCTCAGGGCAGTCCCCCAGAGCTAAAGCGGCCCAGACTCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .
   1643 ATGAAAACAAAGGAGGCACGGAAAGTCTGGACCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130193 ATGAAAACAAAGGAGGCACGGAAAGTCTGGACCCT