seq1 = pF1KE2258.tfa, 351 bp
seq2 = pF1KE2258/gi568815581r_7140857.tfa (gi568815581r:7140857_7342330), 201474 bp

>pF1KE2258 351
>gi568815581r:7140857_7342330 (Chr17)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-169  (100652-100730)   100% ->
170-288  (100871-100989)   100% ->
289-351  (101412-101474)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTCGTGTACAAAGAAGAGCATCCGTTCGAGAAGCGCCGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTTCGTGTACAAAGAAGAGCATCCGTTCGAGAAGCGCCGCTCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGAGAAGATCCGAAAGAAATACCCGGACCGGGTGCCG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GGGCGAGAAGATCCGAAAGAAATACCCGGACCGGGTGCCGGTG...CAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGATAGTAGAAAAGGCTCCCAAAGCTCGGATAGGAGACCTGGACAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100653 TGATAGTAGAAAAGGCTCCCAAAGCTCGGATAGGAGACCTGGACAAAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATACCTGGTGCCTTCTGATCTCACAG         TTGGTCAGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100703 AAATACCTGGTGCCTTCTGATCTCACAGGTG...CAGTTGGTCAGTTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCTTGATCCGGAAGCGAATTCATCTCCGAGCTGAGGATGCCTTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 CTTCTTGATCCGGAAGCGAATTCATCTCCGAGCTGAGGATGCCTTGTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTTTGTCAACAATGTCATTCCACCCACCAGTGCCACAATGGGTCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100934 TCTTTGTCAACAATGTCATTCCACCCACCAGTGCCACAATGGGTCAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACCAG         GAACACCATGAAGAAGACTTCTTTCTCTACATTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100984 TACCAGGTA...CAGGAACACCATGAAGAAGACTTCTTTCTCTACATTGC

    350     .    :    .    :    .
    324 CTACAGTGACGAAAGTGTCTACGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101447 CTACAGTGACGAAAGTGTCTACGGTCTG