seq1 = pF1KE2111.tfa, 2478 bp
seq2 = pF1KE2111/gi568815582r_188125.tfa (gi568815582r:188125_447025), 258901 bp

>pF1KE2111 2478
>gi568815582r:188125_447025 (Chr16)

(complement)

1-878  (100001-100878)   99% ->
879-1019  (132343-132483)   100% ->
1020-1116  (136957-137053)   100% ->
1117-1254  (142585-142722)   100% ->
1255-1784  (148775-149304)   99% ->
1785-1955  (149800-149970)   100% ->
1956-2186  (153308-153538)   99% ->
2187-2354  (157419-157586)   100% ->
2355-2478  (158778-158901)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATATCCAAGAGCAGGGTTTCCCCTTGGACCTCGGAGCAAGTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATATCCAAGAGCAGGGTTTCCCCTTGGACCTCGGAGCAAGTTTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAGATGCTCCCCGACCCCCAGTGCCTGGTGAGGAGGGAGAACTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAAGATGCTCCCCGACCCCCAGTGCCTGGTGAGGAGGGAGAACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACAGACCCGAGGCCCGCCAGCTACAGTTTCTGCTCCGGGAAAGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACAGACCCGAGGCCCGCCAGCTACAGTTTCTGCTCCGGGAAAGGTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCATTAAAGGTGAGACTTCGACGGCCACTCCGAGGCGCTCGGATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCATTAAAGGTGAGACTTCGACGGCCACTCCGAGGCGCTCGGATCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGGGTATGAGCCTGAGGGCAGTGCCTCCCCCACCCCACCATACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGGGTATGAGCCTGAGGGCAGTGCCTCCCCCACCCCACCATACTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTGGGCTGAGTCACTGCATTCCCTGCTGGATGACCAAGATGGGATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTGGGCTGAGTCACTGCATTCCCTGCTGGATGACCAAGATGGGATAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTTCAGGACTTTCCTGAAGCAGGAGGGCTGTGCCGACTTGCTGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTTCAGGACTTTCCTGAAGCAGGAGGGCTGTGCCGACTTGCTGGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGGTTTGCCTGCACTGGCTTCAGGAAGCTGGAGCCCTGTGACTCGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGGTTTGCCTGCACTGGCTTCAGGAAGCTGGAGCCCTGTGACTCGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAGAAGAGGCTGAAGCTGGCGAGAGCCATCTACCGAAAGTACATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGAAGAGGCTGAAGCTGGCGAGAGCCATCTACCGAAAGTACATTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATAACAATGGCATCGTGTCCCGGCAGACCAAGCCAGCCACCAAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATAACAATGGCATCGTGTCCCGGCAGACCAAGCCAGCCACCAAGAGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATAAAGGGCTGCATCATGAAGCAGCTGATCGATCCTGCCATGTTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATAAAGGGCTGCATCATGAAGCAGCTGATCGATCCTGCCATGTTTGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGCCCAGACCGAAATCCAGGCCACTATGGAGGAAAACACCTATCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGCCCAGACCGAAATCCAGGCCACTATGGAGGAAAACACCTATCCCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCTTAAGTCTGATATTTATTTGGAATATACGAGGACAGGCTCGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCTTAAGTCTGATATTTATTTGGAATATACGAGGACAGGCTCGGAGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCCAAAGTCTGTAGTGACCAGAGCTCTGGGTCAGGGACAGGGAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCCAAAGTCTGTAGTGACCAGAGCTCTGGGTCAGGGACAGGGAAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TATCTGGATACCTGCCGACCTTAAATGAAGATGAGGAATGGAAGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TATCTGGATACCTGCCGACCTTAAATGAAGATGAGGAATGGAAGTGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGGACATGGACGAGGACGATGGCAGAGACGCTGCTCCCCCCGGAAGACT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGGACATGGATGAGGACGATGGCAGAGACGCTGCTCCCCCCGGAAGACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCTCAGAAGCTGCTCCTGGAGACAGCTGCCCCGAGGGTCTCCTCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCTCAGAAGCTGCTCCTGGAGACAGCTGCCCCGAGGGTCTCCTCCAGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GACGGTACAGCGAAGGCAGAGAGTTCAG         GTATGGATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100851 GACGGTACAGCGAAGGCAGAGAGTTCAGGTG...CAGGTATGGATCCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGGGAGCCAGTCAACCCCTATTATGTCAATGCCGGCTATGCCCTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132356 CGGGAGCCAGTCAACCCCTATTATGTCAATGCCGGCTATGCCCTGGCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGCCACCAGTGCCAACGACAGCGAGCAGCAGAGCCTGTCCAGCGATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132406 AGCCACCAGTGCCAACGACAGCGAGCAGCAGAGCCTGTCCAGCGATGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACACCCTGTCCCTCACGGACAGCAGCGT         GGATGGGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 132456 ACACCCTGTCCCTCACGGACAGCAGCGTGTA...CAGGGATGGGATCCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CCATACAGGATCCGTAAGCAGCACCGCAGGGAGATGCAGGAGAGCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136970 CCATACAGGATCCGTAAGCAGCACCGCAGGGAGATGCAGGAGAGCGTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGTCAATGGGCGGGTGCCCCTACCTCACATTCCC         CGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 137020 GGTCAATGGGCGGGTGCCCCTACCTCACATTCCCGTA...CAGCGCACGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACCGGGTGCCGAAGGAGGTCCGCGTGGAGCCTCAGAAGTTCGCGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142592 ACCGGGTGCCGAAGGAGGTCCGCGTGGAGCCTCAGAAGTTCGCGGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CTCATCCACCGCCTGGAGGCTGTGCAGCGCACGCGGGAGGCCGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142642 CTCATCCACCGCCTGGAGGCTGTGCAGCGCACGCGGGAGGCCGAGGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GCTGGAGGAGCGGCTGAAGCGCGTGCGCATG         GAGGAGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 142692 GCTGGAGGAGCGGCTGAAGCGCGTGCGCATGGTG...CAGGAGGAGGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GTGAGGACAGCGATCCATCGTCAGGGCCCCCAGGGCCGTGTCACAAGCTG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148785 GTGAGGACGGCGATCCATCGTCAGGGCCCCCAGGGCCGTGTCACAAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CCTCCCGCCCCCGCTTGGCACCACTTCCCGCCCCGCTGTGTGGACATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148835 CCTCCCGCCCCCGCTTGGCACCACTTCCCGCCCCGCTGTGTGGACATGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTGTGCCGGGCTCCGGGATGCACACGAGGAGAACCCTGAGAGCATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148885 CTGTGCCGGGCTCCGGGATGCACACGAGGAGAACCCTGAGAGCATCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ACGAGCACGTACAGCGTGTGCTGAGGACACCTGGCCGCCAGTCGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148935 ACGAGCACGTACAGCGTGTGCTGAGGACACCTGGCCGCCAGTCGCCTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CCTGGCCATCGCTCCCCGGACAGTGGGCACGTGGCCAAGATGCCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148985 CCTGGCCATCGCTCCCCGGACAGTGGGCACGTGGCCAAGATGCCAGTGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 ACTGGGGGGTGCCGCCTCGGGGCACGGGAAGCACGTACCCAAGTCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149035 ACTGGGGGGTGCCGCCTCGGGGCACGGGAAGCACGTACCCAAGTCAGGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CGAAGCTGGACGCGGCCGGCCTGCACCACCACCGACACGTCCACCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149085 CGAAGCTGGACGCGGCCGGCCTGCACCACCACCGACACGTCCACCACCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GTCCACCACAGCACAGCCCGGCCCAAGGAGCAGGTGGAGGCCGAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149135 GTCCACCACAGCACAGCCCGGCCCAAGGAGCAGGTGGAGGCCGAGGCCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CCGCAGGGCCCAGAGCAGCTTCGCCTGGGGCCTGGAACCACACAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149185 CCGCAGGGCCCAGAGCAGCTTCGCCTGGGGCCTGGAACCACACAGCCATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 GGGCAAGGTCCCGAGGCTACTCAGAGAGTGTTGGCGCTGCCCCCAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149235 GGGCAAGGTCCCGAGGCTACTCAGAGAGTGTTGGCGCTGCCCCCAACGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 AGTGATGGCCTCGCCCACAG         TGGGAAGGTGGGCGTGGCGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 149285 AGTGATGGCCTCGCCCACAGGTG...CAGTGGGAAGGTGGGCGTGGCGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CAAAAGAAATGCCAAGAAGGCTGAGTCGGGGAAGAGCGCCAGCACCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149821 CAAAAGAAATGCCAAGAAGGCTGAGTCGGGGAAGAGCGCCAGCACCGAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TGCCAGGTGCCTCGGAGGATGCGGAGAAGAACCAGAAAATCATGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149871 TGCCAGGTGCCTCGGAGGATGCGGAGAAGAACCAGAAAATCATGCAGTGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ATCATTGAGGGGGAAAAGGAGATCAGCAGGCACCGCAGGACCGGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149921 ATCATTGAGGGGGAAAAGGAGATCAGCAGGCACCGCAGGACCGGCCACGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956          GTCTTCGGGGACGAGGAAGCCACAGCCTCATGAGAACTCCA
        >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 149971 GTG...AAGGTCTTCGGGGACGAGGAAGCCACAGCCCCATGAGAACTCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 GACCCTTGTCCCTTGAGCACCCCTGGGCCGGCCCTCAGCTCCGGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153349 GACCCTTGTCCCTTGAGCACCCCTGGGCCGGCCCTCAGCTCCGGACCTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GTGCAGCCCTCCCACCTCTTCATCCAAGACCCCACCATGCCACCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153399 GTGCAGCCCTCCCACCTCTTCATCCAAGACCCCACCATGCCACCCCACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 AGCTCCCAACCCCCTAACCCAGCTGGAGGAGGCGCGCCGACGTCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153449 AGCTCCCAACCCCCTAACCCAGCTGGAGGAGGCGCGCCGACGTCTGGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 AGGAAGAAAAGAGAGCCAGCCGAGCACCCTCCAAGCAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 153499 AGGAAGAAAAGAGAGCCAGCCGAGCACCCTCCAAGCAGAGGTA...CAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 ACAAGATCGCAGAGGAAGGTGGGCGGCGGGAGTGCCCAGCCGTGTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157420 ACAAGATCGCAGAGGAAGGTGGGCGGCGGGAGTGCCCAGCCGTGTGACAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 CATCGTTGTGGCGTACTACTTCTGCGGGGAACCCATCCCCTACCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157470 CATCGTTGTGGCGTACTACTTCTGCGGGGAACCCATCCCCTACCGCACCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 TGGTGAGGGGCCGCGCTGTCACCCTGGGCCAGTTCAAGGAGCTGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157520 TGGTGAGGGGCCGCGCTGTCACCCTGGGCCAGTTCAAGGAGCTGCTGACC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 AAAAAGGGCAGCTACAG         ATACTACTTCAAGAAAGTGAGCGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 157570 AAAAAGGGCAGCTACAGGTG...CAGATACTACTTCAAGAAAGTGAGCGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 CGAGTTTGACTGTGGGGTGGTGTTTGAGGAGGTTCGAGAGGACGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158802 CGAGTTTGACTGTGGGGTGGTGTTTGAGGAGGTTCGAGAGGACGAGGCCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 TCCTGCCCGTCTTTGAGGAGAAGATCATCGGCAAAGTGGAGAAGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158852 TCCTGCCCGTCTTTGAGGAGAAGATCATCGGCAAAGTGGAGAAGGTGGAC