Result of SIM4 for
pF1KE2094
seq1 = pF1KE2094.tfa, 2388 bp
seq2 = pF1KE2094/gi568815597f_156760935.tfa (gi568815597f:156760935_156981639), 220705 bp
>pF1KE2094 2388
>gi568815597f:156760935_156981639 (Chr1)
1-212 (100001-100212) 99% ->
213-287 (103420-103494) 100% ->
288-359 (103794-103865) 100% ->
360-428 (105976-106044) 100% ->
429-574 (107170-107315) 100% ->
575-717 (107571-107713) 100% ->
718-850 (110689-110821) 100% ->
851-1177 (112699-113025) 100% ->
1178-1251 (113621-113692) 88% ->
1252-1354 (113972-114074) 100% ->
1355-1501 (114586-114732) 100% ->
1502-1632 (115146-115276) 100% ->
1633-1805 (115466-115638) 100% ->
1806-2046 (118188-118428) 99% ->
2047-2205 (119065-119223) 100% ->
2206-2388 (120523-120705) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGC
50 . : . : . : . : . :
51 GGAGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCG
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCG
100 . : . : . : . : . :
101 CACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGATGC
150 . : . : . : . : . :
151 ACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 ACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAA
200 . : . : . : . : . :
201 CCTGACTGAGCT CTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
100201 CCTGACTGAGCTGTG...CAGCTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGC
250 . : . : . : . : . :
242 ATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
103449 ATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTGTG.
300 . : . : . : . : . :
288 CACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103499 ..CAGCACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTT
350 . : . : . : . : . :
333 CCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCT GAATCTCTCCTTCA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
103839 CCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGTG...CAGGAATCTCTCCTTCA
400 . : . : . : . : . :
374 ACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105990 ACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAG
450 . : . : . : . : . :
424 GAACT GGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106040 GAACTGTG...CAGGGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGC
500 . : . : . : . : . :
465 CCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107206 CCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG
550 . : . : . : . : . :
515 AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107256 AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAAT
600 . : . : . : . : . :
565 GCCAGCTGTG GTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
107306 GCCAGCTGTGGTA...CAGGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAA
650 . : . : . : . : . :
606 TGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107602 TGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGG
700 . : . : . : . : . :
656 GGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107652 GGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCA
750 . : . : . : . : . :
706 GCCACGGTGATG AAATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
107702 GCCACGGTGATGGTG...TAGAAATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCT
800 . : . : . : . : . :
747 GACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110718 GACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCT
850 . : . : . : . : . :
797 GGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110768 GGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTC
900 . : . : . : . : . :
847 TCCT TCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGAT
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110818 TCCTGTG...CAGTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGAT
950 . : . : . : . : . :
888 GCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112736 GCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTC
1000 . : . : . : . : . :
938 TGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112786 TGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTC
1050 . : . : . : . : . :
988 ACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112836 ACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCT
1100 . : . : . : . : . :
1038 GCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112886 GCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGG
1150 . : . : . : . : . :
1088 CTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112936 CTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATG
1200 . : . : . : . : . :
1138 GACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTG T
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>-
112986 GACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTGGTG...CTG
1250 . : . : . : . : . :
1179 CTCCT TCTCGCCGGTGGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAG
|-|||-| ||-|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
113621 C CCTGTGTC CCTACAGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAG
1300 . : . : . : . : . :
1228 AAGAAGGACGAAACACCTTTTGGG GTCTCGGTGGCTGTGGG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
113669 AAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTG...CAGGTCTCGGTGGCTGTGGG
1350 . : . : . : . : . :
1269 CCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113989 CCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCA
1400 . : . : . : . : . :
1319 ACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACC GCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
114039 ACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGTG...TAGGCCCG
1450 . : . : . : . : . :
1360 GCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCATGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114591 GCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCATGAC
1500 . : . : . : . : . :
1410 ATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114641 ATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC
1550 . : . : . : . : . :
1460 AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
114691 AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTG...CA
1600 . : . : . : . : . :
1502 GTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115145 GGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG
1650 . : . : . : . : . :
1551 GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115195 GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGC
1700 . : . : . : . : . :
1601 CTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAG GCACTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
115245 CTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAGGTG...CAGGCACTGAAG
1750 . : . : . : . : . :
1642 GAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115475 GAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCT
1800 . : . : . : . : . :
1692 CACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115525 CACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCG
1850 . : . : . : . : . :
1742 AGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115575 AGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTC
1900 . : . : . : . : . :
1792 AACCGCTTCCTCCG ATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
115625 AACCGCTTCCTCCGGTA...CAGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCT
1950 . : . : . : . : . :
1833 GGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118215 GGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGC
2000 . : . : . : . : . :
1883 TGGCTGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTG
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118265 TGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTG
2050 . : . : . : . : . :
1933 CATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118315 CATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGG
2100 . : . : . : . : . :
1983 ACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118365 ACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCA
2150 . : . : . : . : . :
2033 CCGACTATTACCGT GTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCATT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
118415 CCGACTATTACCGTGTA...CAGGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCATT
2200 . : . : . : . : . :
2074 CGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119092 CGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAG
2250 . : . : . : . : . :
2124 CGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119142 CGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCA
2300 . : . : . : . : . :
2174 AGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAG GCAATCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
119192 AGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGTC...CAGGCAATCGAC
2350 . : . : . : . : . :
2215 TGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120532 TGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGA
2400 . : . : . : . : . :
2265 GGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120582 GGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCC
2450 . : . : . : . : . :
2315 ACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120632 ACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT
2500 . : . :
2365 CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC
||||||||||||||||||||||||
120682 CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC