seq1 = pF1KE2077.tfa, 2235 bp
seq2 = pF1KE2077/gi568815588r_34910314.tfa (gi568815588r:34910314_35171317), 261004 bp

>pF1KE2077 2235
>gi568815588r:34910314_35171317 (Chr10)

(complement)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-222  (108256-108358)   100% ->
223-317  (110350-110444)   100% ->
318-423  (116779-116884)   100% ->
424-506  (121553-121635)   100% ->
507-603  (126450-126546)   100% ->
604-714  (126642-126752)   100% ->
715-877  (132236-132398)   100% ->
878-1002  (136022-136146)   100% ->
1003-1110  (138045-138152)   100% ->
1111-1170  (138824-138883)   100% ->
1171-1299  (139699-139827)   100% ->
1300-1386  (139932-140018)   100% ->
1387-1539  (141678-141830)   100% ->
1540-1617  (142431-142508)   100% ->
1618-1684  (146120-146186)   100% ->
1685-1887  (154924-155126)   100% ->
1888-1989  (157518-157619)   99% ->
1990-2106  (159354-159470)   100% ->
2107-2235  (160876-161004)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATGGAATGACCGTTTCTC         AGATATCTATGCTTTATGTGTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 CATGGAATGACCGTTTCTCGTA...TAGAGATATCTATGCTTTATGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108278 GCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG         AGAGTTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 108328 TTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGGTA...TAGAGAGTTTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110360 AGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAG         GTATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110410 AGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGGTG...CAGGTATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116785 CAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116835 ATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          CTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116885 GTA...CAGCTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 121594 TCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAAGTG...TA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    507  TGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126449 GTGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 126499 AACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604        TTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126549 A...CAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126685 GAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCACAGTATATGGAAAAG         GTTCTAGGTAGATTAAAAGATGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 126735 TCACAGTATATGGAAAAGGTA...TAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132259 AGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132309 TTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 132359 GCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGGTA...CAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136023 CATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136073 ATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ACCAGCAACCTTACTCAGGAAAAC         ATGCCAACACTATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 136123 ACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACGTG...TAGATGCCAACACTATTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138062 GGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 138112 TTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAGGTA...CAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138824 GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACCTGAACTG         CTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 138874 ACCTGAACTGGTA...GAGCTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139730 AGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 139780 TTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1300        TTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139830 A...TAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 139975 CCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGGTA...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387    CAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141675 TAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141725 AGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141775 AAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CTACAG         GCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141825 CTACAGGTA...TAGGCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 142466 TACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGGTA...C

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1618   TTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146118 AGTTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TTACATTATCTGTGTACAG         GTGAAGTTAAAATGAACTATTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 146168 TTACATTATCTGTGTACAGGTA...TAGGTGAAGTTAAAATGAACTATTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154946 GGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154996 TTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 ACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155046 ACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAG         GAAGATATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 155096 TGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGTA...TAGGAAGATATTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ATGCAGAATCTTCATTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157528 ATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 AAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 157578 AAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGTA...CA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1990  GAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159353 GGAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 TCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159403 TCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AATGCCCTTATTCAAGAG         GTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 159453 AATGCCCTTATTCAAGAGGTA...CAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 GTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160899 GTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 ACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160949 ACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTAC

   2400     .
   2230 GTCGCG
        ||||||
 160999 GTCGCG