seq1 = pF1KE1932.tfa, 1410 bp
seq2 = pF1KE1932/gi568815587r_102763103.tfa (gi568815587r:102763103_102974937), 211835 bp

>pF1KE1932 1410
>gi568815587r:102763103_102974937 (Chr11)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-350  (101826-102073)   100% ->
351-499  (102986-103134)   100% ->
500-625  (103219-103344)   100% ->
626-787  (106869-107030)   100% ->
788-911  (107545-107668)   100% ->
912-1045  (108490-108623)   100% ->
1046-1205  (109003-109162)   100% ->
1206-1312  (110686-110792)   100% ->
1313-1410  (111738-111835)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTTCTTCTAATACTGCTCCTGCAGGCCACTGCTTCTGGAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTTTCTTCTAATACTGCTCCTGCAGGCCACTGCTTCTGGAGCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCCTGAACAGCTCTACAAGCCTGGAAAAAAATAATGTGCTATTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCCTGAACAGCTCTACAAGCCTGGAAAAAAATAATGTGCTATTTGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AA         AGATACTTAGAAAAATTTTATGGCCTTGAGATAAACAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTA...CAGAGATACTTAGAAAAATTTTATGGCCTTGAGATAAACAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTCCAGTGACAAAAATGAAATATAGTGGAAACTTAATGAAGGAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101865 CTTCCAGTGACAAAAATGAAATATAGTGGAAACTTAATGAAGGAAAAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAAGAAATGCAGCACTTCTTGGGTCTGAAAGTGACCGGGCAACTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101915 CCAAGAAATGCAGCACTTCTTGGGTCTGAAAGTGACCGGGCAACTGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATCTACCCTGGAGATGATGCACGCACCTCGATGTGGAGTCCCCGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101965 CATCTACCCTGGAGATGATGCACGCACCTCGATGTGGAGTCCCCGATGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATCATTTCAGGGAAATGCCAGGGGGGCCCGTATGGAGGAAACATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102015 CATCATTTCAGGGAAATGCCAGGGGGGCCCGTATGGAGGAAACATTATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACCTACAG         AATCAATAATTACACACCTGACATGAACCGTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 CACCTACAGGTA...AAGAATCAATAATTACACACCTGACATGAACCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGATGTTGACTACGCAATCCGGAAAGCTTTCCAAGTATGGAGTAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103018 AGGATGTTGACTACGCAATCCGGAAAGCTTTCCAAGTATGGAGTAATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCCCCTTGAAATTCAGCAAGATTAACACAGGCATGGCTGACATTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103068 ACCCCCTTGAAATTCAGCAAGATTAACACAGGCATGGCTGACATTTTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTTTTTGCCCGTGGAG         CTCATGGAGACTTCCATGCTTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103118 GGTTTTTGCCCGTGGAGGTA...AAGCTCATGGAGACTTCCATGCTTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGGCAAAGGTGGAATCCTAGCCCATGCTTTTGGACCTGGATCTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103243 ATGGCAAAGGTGGAATCCTAGCCCATGCTTTTGGACCTGGATCTGGCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGAGGGGATGCACATTTCGATGAGGACGAATTCTGGACTACACATTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103293 GGAGGGGATGCACATTTCGATGAGGACGAATTCTGGACTACACATTCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AG         GCACAAACTTGTTCCTCACTGCTGTTCACGAGATTGGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103343 AGGTG...TAGGCACAAACTTGTTCCTCACTGCTGTTCACGAGATTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATTCCTTAGGTCTTGGCCATTCTAGTGATCCAAAGGCCGTAATGTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106908 ATTCCTTAGGTCTTGGCCATTCTAGTGATCCAAAGGCCGTAATGTTCCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACCTACAAATATGTTGACATCAACACATTTCGCCTCTCTGCTGATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106958 ACCTACAAATATGTTGACATCAACACATTTCGCCTCTCTGCTGATGACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACGTGGCATTCAGTCCCTGTATG         GAGACCCAAAAGAGAACC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107008 ACGTGGCATTCAGTCCCTGTATGGTG...CAGGAGACCCAAAAGAGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AACGCTTGCCAAATCCTGACAATTCAGAACCAGCTCTCTGTGACCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107563 AACGCTTGCCAAATCCTGACAATTCAGAACCAGCTCTCTGTGACCCCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTGAGTTTTGATGCTGTCACTACCGTGGGAAATAAGATCTTTTTCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107613 TTGAGTTTTGATGCTGTCACTACCGTGGGAAATAAGATCTTTTTCTTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGACAG         GTTCTTCTGGCTGAAGGTTTCTGAGAGACCAAAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107663 AGACAGGTA...CAGGTTCTTCTGGCTGAAGGTTTCTGAGAGACCAAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCAGTGTTAATTTAATTTCTTCCTTATGGCCAACCTTGCCATCTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108525 CCAGTGTTAATTTAATTTCTTCCTTATGGCCAACCTTGCCATCTGGCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAAGCTGCTTATGAAATTGAAGCCAGAAATCAAGTTTTTCTTTTTAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 108575 GAAGCTGCTTATGAAATTGAAGCCAGAAATCAAGTTTTTCTTTTTAAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1046         ATGACAAATACTGGTTAATTAGCAATTTAAGACCAGAGCCAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108625 TA...CAGATGACAAATACTGGTTAATTAGCAATTTAAGACCAGAGCCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATTATCCCAAGAGCATACATTCTTTTGGTTTTCCTAACTTTGTGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109045 ATTATCCCAAGAGCATACATTCTTTTGGTTTTCCTAACTTTGTGAAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATTGATGCAGCTGTTTTTAACCCACGTTTTTATAGGACCTACTTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109095 ATTGATGCAGCTGTTTTTAACCCACGTTTTTATAGGACCTACTTCTTTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGATAACCAGTATTGGAG         GTATGATGAAAGGAGACAGATGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109145 AGATAACCAGTATTGGAGGTG...CAGGTATGATGAAAGGAGACAGATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGACCCTGGTTATCCCAAACTGATTACCAAGAACTTCCAAGGAATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110709 TGGACCCTGGTTATCCCAAACTGATTACCAAGAACTTCCAAGGAATCGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCTAAAATTGATGCAGTCTTCTACTCTAAAAACA         AATACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110759 CCTAAAATTGATGCAGTCTTCTACTCTAAAAACAGTA...CAGAATACTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTATTTCTTCCAAGGATCTAACCAATTTGAATATGACTTCCTACTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111745 CTATTTCTTCCAAGGATCTAACCAATTTGAATATGACTTCCTACTCCAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GTATCACCAAAACACTGAAAAGCAATAGCTGGTTTGGTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111795 GTATCACCAAAACACTGAAAAGCAATAGCTGGTTTGGTTGT