seq1 = pF1KE1916.tfa, 1359 bp
seq2 = pF1KE1916/gi568815588f_131801234.tfa (gi568815588f:131801234_132055960), 254727 bp

>pF1KE1916 1359
>gi568815588f:131801234_132055960 (Chr10)

1-100  (99998-100097)   98% ->
101-198  (133225-133322)   100% ->
199-364  (138798-138963)   100% ->
365-477  (139349-139461)   100% ->
478-655  (142735-142912)   100% ->
656-820  (144062-144226)   100% ->
821-1082  (146297-146558)   100% ->
1083-1359  (154451-154727)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGAGCCGGAGGCGGCGGCTGCCCCGCGGGCGGCAACGACTTCCA
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 TTTGCAGGAGCCGGAGGCGGCGGCTGCCCCGCGGGCGGCAACGACTTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGTGCTTCTCGCAGGTCAAGGGGGCCATCGACGAGGACGTGGCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 GTGGTGCTTCTCGCAGGTCAAGGGGGCCATCGACGAGGACGTGGCCGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          CGGACATCATTTCCACCGTTGAGTTTAATTACTCTGGAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 GTG...CAGCGGACATCATTTCCACCGTTGAGTTTAATTACTCTGGAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTCTTGCAACAGGAGACAAGGGCGGCAGAGTTGTTATTTTTCAGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133266 CTTCTTGCAACAGGAGACAAGGGCGGCAGAGTTGTTATTTTTCAGCGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAAGAG         AATAAAAGCCGCCCTCATTCTAGGGGAGAATATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133316 ACAAGAGGTC...CAGAATAAAAGCCGCCCTCATTCTAGGGGAGAATATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTTTACAGCACCTTTCAAAGTCATGAACCGGAGTTTGACTATTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138832 ATGTTTACAGCACCTTTCAAAGTCATGAACCGGAGTTTGACTATTTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTCTAGAAATTGAGGAAAAAATTAATAAAATTAGGTGGTTACCACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138882 AGTCTAGAAATTGAGGAAAAAATTAATAAAATTAGGTGGTTACCACAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAATGCTGCTCATTTTCTACTGTCTACAAATG         ATAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 138932 GAATGCTGCTCATTTTCTACTGTCTACAAATGGTA...CAGATAAAACTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAAAATTATGGAAAATAAGTGAACGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139358 TAAAATTATGGAAAATAAGTGAACGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTATAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGAAAGACGAAGATGGAAGACTTCGAGACCCATTTAGGATCACGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139408 CTGAAAGACGAAGATGGAAGACTTCGAGACCCATTTAGGATCACGGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACGG         GTCCCAATATTGAAGCCCATGGATCTTATGGTAGAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139458 ACGGGTA...TAGGTCCCAATATTGAAGCCCATGGATCTTATGGTAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGAGTCCACGGCGAATTTTTGCAAATGCTCACACATATCATATAAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142772 CGAGTCCACGGCGAATTTTTGCAAATGCTCACACATATCATATAAATTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTTCAGTAAATAGTGATCATGAAACATATCTTTCTGCAGATGACCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142822 ATTTCAGTAAATAGTGATCATGAAACATATCTTTCTGCAGATGACCTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATTAATTTATGGCACTTAGAAATCACAGATAGAAGCTTTA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 142872 AATTAATTTATGGCACTTAGAAATCACAGATAGAAGCTTTAGTA...CAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACATCGTGGACATCAAGCCTGCTAACATGGAGGAGCTGACCGAAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144062 ACATCGTGGACATCAAGCCTGCTAACATGGAGGAGCTGACCGAAGTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACTGCAGCCGAGTTCCACCCGCACCAGTGCAACGTGTTCGTCTACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144112 ACTGCAGCCGAGTTCCACCCGCACCAGTGCAACGTGTTCGTCTACAGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAGCAAAGGGACCATCCGCCTGTGTGACATGCGCTCCTCGGCCCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144162 TAGCAAAGGGACCATCCGCCTGTGTGACATGCGCTCCTCGGCCCTGTGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACAGACACTCCAAGT         TTTTTGAAGAGCCTGAAGATCCCAGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 144212 ACAGACACTCCAAGTGTA...CAGTTTTTGAAGAGCCTGAAGATCCCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGTAGGTCCTTCTTCTCAGAAATAATTTCATCCATATCCGATGTAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146323 AGTAGGTCCTTCTTCTCAGAAATAATTTCATCCATATCCGATGTAAAATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAGTCATAGTGGGCGGTACATGATGACCAGAGACTACCTGTCGGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146373 CAGTCATAGTGGGCGGTACATGATGACCAGAGACTACCTGTCGGTGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGTGGGACCTCAACATGGAGAGCAGGCCGGTGGAGACCCACCAGGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146423 TGTGGGACCTCAACATGGAGAGCAGGCCGGTGGAGACCCACCAGGTCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGTACCTGCGCAGCAAGCTCTGCTCTCTCTATGAGAACGACTGCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146473 GAGTACCTGCGCAGCAAGCTCTGCTCTCTCTATGAGAACGACTGCATCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGACAAGTTTGAGTGTTGCTGGAACGGTTCGGATAG         CGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 146523 TGACAAGTTTGAGTGTTGCTGGAACGGTTCGGATAGGTA...CAGCGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCATGACCGGGTCCTATAACAACTTCTTCAGGATGTTTGATAGAGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154456 TCATGACCGGGTCCTATAACAACTTCTTCAGGATGTTTGATAGAGACACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGGAGGGATGTGACCCTGGAGGCCTCGAGAGAGAGCAGCAAACCGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154506 CGGAGGGATGTGACCCTGGAGGCCTCGAGAGAGAGCAGCAAACCGCGCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAGCCTCAAACCCCGGAAGGTGTGTACGGGGGGTAAGCGGAGGAAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154556 CAGCCTCAAACCCCGGAAGGTGTGTACGGGGGGTAAGCGGAGGAAAGACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGATCAGTGTGGACAGTCTGGACTTCAACAAGAAGATCCTGCACACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154606 AGATCAGTGTGGACAGTCTGGACTTCAACAAGAAGATCCTGCACACAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGGCACCCCGTGGACAATGTCATTGCCGTGGCTGCCACCAATAACTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154656 TGGCACCCCGTGGACAATGTCATTGCCGTGGCTGCCACCAATAACTTGTA

   1400     .    :    .    :
   1338 CATATTCCAGGACAAAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||
 154706 CATATTCCAGGACAAAATCAAC