seq1 = pF1KE1910.tfa, 1332 bp
seq2 = pF1KE1910/gi568815579r_6395209.tfa (gi568815579r:6395209_6602212), 207004 bp

>pF1KE1910 1332
>gi568815579r:6395209_6602212 (Chr19)

(complement)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-166  (100590-100698)   100% ->
167-277  (100816-100926)   100% ->
278-1332  (105992-107046)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGGAGATCGTGCACCTGCAGGCCGGCCAGTGCGGCAACCAGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGGAGATCGTGCACCTGCAGGCCGGCCAGTGCGGCAACCAGATCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCAAG         TTTTGGGAGGTTATCAGTGACGAACATGGCATCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCAAGGTG...TAGTTTTGGGAGGTTATCAGTGACGAACATGGCATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCCCACAGGCACATACCATGGGGACAGTGACCTGCAACTGGAGAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100624 ACCCCACAGGCACATACCATGGGGACAGTGACCTGCAACTGGAGAGGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACGTGTACTACAACGAGGCCACAG         GAGGAAATTATGTCCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100674 AACGTGTACTACAACGAGGCCACAGGTA...CAGGAGGAAATTATGTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGAGCGGTGCTGGTGGACCTGGAACCCGGCACCATGGACTCTGTCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 CAGAGCGGTGCTGGTGGACCTGGAACCCGGCACCATGGACTCTGTCCGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGCCCCTTCGGTCAGATCTTTCGGCCGGACAACTTCGTGTTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100882 CTGGCCCCTTCGGTCAGATCTTTCGGCCGGACAACTTCGTGTTTGGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     GCCAATCCGGAGCCGGCAACAACTGGGCAAAGGGGCACTACACGGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100932 .TAGGCCAATCCGGAGCCGGCAACAACTGGGCAAAGGGGCACTACACGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGCGCAGAGCTGGTGGACGCTGTCCTGGACGTAGTCCGGAAGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106038 GGGCGCAGAGCTGGTGGACGCTGTCCTGGACGTAGTCCGGAAGGAGGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAGCTGCGACTGCCTTCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTCGCTGGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106088 AGAGCTGCGACTGCCTTCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTCGCTGGGGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCACGGGGTCCGGAATGGGCACGCTGCTCATCAGTAAGATCCGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106138 GGCACGGGGTCCGGAATGGGCACGCTGCTCATCAGTAAGATCCGCGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCCCAGACCGCATCATGAACACCTTCAGCGTGGTGCCCTCGCCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106188 GTTCCCAGACCGCATCATGAACACCTTCAGCGTGGTGCCCTCGCCCAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGTCAGACACGGTGGTGGAGCCCTACAACGCCACGCTGTCTGTGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106238 TGTCAGACACGGTGGTGGAGCCCTACAACGCCACGCTGTCTGTGCACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGTGGAGAATACGGATGAGACCTACTGCATCGACAACGAGGCACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106288 CTGGTGGAGAATACGGATGAGACCTACTGCATCGACAACGAGGCACTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGACATCTGTTTCCGCACCCTCAAGCTGACCACCCCCACCTACGGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106338 CGACATCTGTTTCCGCACCCTCAAGCTGACCACCCCCACCTACGGGGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCAACCACCTGGTGTCGGCCACCATGAGCGGGGTCACCACCTGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106388 TCAACCACCTGGTGTCGGCCACCATGAGCGGGGTCACCACCTGCCTGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTCCCGGGCCAGCTGAACGCCGACCTGCGCAAGCTGGCCGTCAACATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106438 TTCCCGGGCCAGCTGAACGCCGACCTGCGCAAGCTGGCCGTCAACATGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCCCTTTCCTCGCCTGCACTTCTTCATGCCCGGCTTCGCACCCCTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106488 TCCCTTTCCTCGCCTGCACTTCTTCATGCCCGGCTTCGCACCCCTGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCCGGGGCAGCCAGCAGTACCGGGCCCTGACGGTGCCCGAGCTCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106538 GCCGGGGCAGCCAGCAGTACCGGGCCCTGACGGTGCCCGAGCTCACCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGATGTTCGATGCCAAGAACATGATGGCGGCGTGCGACCCGCGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106588 CAGATGTTCGATGCCAAGAACATGATGGCGGCGTGCGACCCGCGCCACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCGCTACCTGACCGTGGCCGCCGTGTTCCGGGGCCGCATGTCCATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106638 CCGCTACCTGACCGTGGCCGCCGTGTTCCGGGGCCGCATGTCCATGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGGTGGACGAGCAGATGCTGAGCGTGCAGAGCAAGAACAGCAGCTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106688 AGGTGGACGAGCAGATGCTGAGCGTGCAGAGCAAGAACAGCAGCTACTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GTGGAGTGGATCCCCAACAACGTGAAGACGGCCGTGTGCGACATCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106738 GTGGAGTGGATCCCCAACAACGTGAAGACGGCCGTGTGCGACATCCCGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCGCGGCCTGAAGATGGCCGCGACCTTCATCGGCAACAGCACGGCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106788 CCGCGGCCTGAAGATGGCCGCGACCTTCATCGGCAACAGCACGGCCATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGGAGCTGTTCAAGCGCATCTCCGAGCAGTTCACGGCCATGTTCCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106838 AGGAGCTGTTCAAGCGCATCTCCGAGCAGTTCACGGCCATGTTCCGGCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAGGCCTTCTTGCACTGGTACACGGGCGAGGGCATGGACGAGATGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106888 AAGGCCTTCTTGCACTGGTACACGGGCGAGGGCATGGACGAGATGGAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CACCGAGGCCGAGAGCAACATGAATGACCTGGTATCTGAGTACCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106938 CACCGAGGCCGAGAGCAACATGAATGACCTGGTATCTGAGTACCAGCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ACCAGGACGCCACGGCCGAGGAGGGCGAGTTCGAGGAGGAGGCGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106988 ACCAGGACGCCACGGCCGAGGAGGGCGAGTTCGAGGAGGAGGCGGAGGAG

   1350     .
   1324 GAGGTGGCC
        |||||||||
 107038 GAGGTGGCC