seq1 = pF1KE1899.tfa, 2475 bp
seq2 = pF1KE1899/gi568815582f_27240204.tfa (gi568815582f:27240204_27463827), 223624 bp

>pF1KE1899 2475
>gi568815582f:27240204_27463827 (Chr16)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-209  (101918-102056)   100% ->
210-361  (104666-104817)   100% ->
362-513  (106264-106415)   100% ->
514-670  (112337-112493)   100% ->
671-770  (115605-115704)   100% ->
771-849  (118713-118791)   100% ->
850-899  (120563-120612)   100% ->
900-2475  (122049-123624)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTGGCTTTGCTCTGGGCTCCTGTTCCCTGTGAGCTGCCTGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTGGCTTTGCTCTGGGCTCCTGTTCCCTGTGAGCTGCCTGGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCAGGTGGCAAGCTCTG         GGAACATGAAGGTCTTGCAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCAGGTGGCAAGCTCTGGTA...CAGGGAACATGAAGGTCTTGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCCCACCTGCGTCTCCGACTACATGAGCATCTCTACTTGCGAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101939 AGCCCACCTGCGTCTCCGACTACATGAGCATCTCTACTTGCGAGTGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAATGGTCCCACCAATTGCAGCACCGAGCTCCGCCTGTTGTACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101989 ATGAATGGTCCCACCAATTGCAGCACCGAGCTCCGCCTGTTGTACCAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTTTTTCTGCTCTCCGA         AGCCCACACGTGTATCCCTGAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102039 GGTTTTTCTGCTCTCCGAGTA...CAGAGCCCACACGTGTATCCCTGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAACGGAGGCGCGGGGTGCGTGTGCCACCTGCTCATGGATGACGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104689 ACAACGGAGGCGCGGGGTGCGTGTGCCACCTGCTCATGGATGACGTGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTGCGGATAACTATACACTGGACCTGTGGGCTGGGCAGCAGCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104739 AGTGCGGATAACTATACACTGGACCTGTGGGCTGGGCAGCAGCTGCTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGGGCTCCTTCAAGCCCAGCGAGCATG         TGAAACCCAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104789 GAAGGGCTCCTTCAAGCCCAGCGAGCATGGTG...CAGTGAAACCCAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCCAGGAAACCTGACAGTTCACACCAATGTCTCCGACACTCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106276 CCCCAGGAAACCTGACAGTTCACACCAATGTCTCCGACACTCTGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCTGGAGCAACCCGTATCCCCCTGACAATTACCTGTATAATCATCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106326 ACCTGGAGCAACCCGTATCCCCCTGACAATTACCTGTATAATCATCTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTATGCAGTCAACATTTGGAGTGAAAACGACCCGGCAGAT         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106376 CTATGCAGTCAACATTTGGAGTGAAAACGACCCGGCAGATGTG...CAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAGAATCTATAACGTGACCTACCTAGAACCCTCCCTCCGCATCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112338 TCAGAATCTATAACGTGACCTACCTAGAACCCTCCCTCCGCATCGCAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCACCCTGAAGTCTGGGATTTCCTACAGGGCACGGGTGAGGGCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112388 AGCACCCTGAAGTCTGGGATTTCCTACAGGGCACGGGTGAGGGCCTGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCAGTGCTATAACACCACCTGGAGTGAGTGGAGCCCCAGCACCAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112438 TCAGTGCTATAACACCACCTGGAGTGAGTGGAGCCCCAGCACCAAGTGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAACT         CCTACAGGGAGCCCTTCGAGCAGCACCTCCTGCTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112488 ACAACTGTG...CAGCCTACAGGGAGCCCTTCGAGCAGCACCTCCTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCGTCAGCGTTTCCTGCATTGTCATCCTGGCCGTCTGCCTGTTGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115640 GGCGTCAGCGTTTCCTGCATTGTCATCCTGGCCGTCTGCCTGTTGTGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTCAGCATCACCAA         GATTAAGAAAGAATGGTGGGATCAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115690 TGTCAGCATCACCAAGTG...CAGGATTAAGAAAGAATGGTGGGATCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTCCCAACCCAGCCCGCAGCCGCCTCGTGGCTATAATAATCCAGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118739 TTCCCAACCCAGCCCGCAGCCGCCTCGTGGCTATAATAATCCAGGATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAG         GGGTCACAGTGGGAGAAGCGGTCCCGAGGCCAGGAACC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118789 CAGGTA...TAGGGGTCACAGTGGGAGAAGCGGTCCCGAGGCCAGGAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGCCAAGTGCCC         ACACTGGAAGAATTGTCTTACCAAGCTCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 120601 AGCCAAGTGCCCGTA...CAGACACTGGAAGAATTGTCTTACCAAGCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGCCCTGTTTTCTGGAGCACAACATGAAAAGGGATGAAGATCCTCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122078 TGCCCTGTTTTCTGGAGCACAACATGAAAAGGGATGAAGATCCTCACAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCTGCCAAAGAGATGCCTTTCCAGGGCTCTGGAAAATCAGCATGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122128 GCTGCCAAAGAGATGCCTTTCCAGGGCTCTGGAAAATCAGCATGGTGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGTGGAGATCAGCAAGACAGTCCTCTGGCCAGAGAGCATCAGCGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122178 AGTGGAGATCAGCAAGACAGTCCTCTGGCCAGAGAGCATCAGCGTGGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GATGTGTGGAGTTGTTTGAGGCCCCGGTGGAGTGTGAGGAGGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122228 GATGTGTGGAGTTGTTTGAGGCCCCGGTGGAGTGTGAGGAGGAGGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTAGAGGAAGAAAAAGGGAGCTTCTGTGCATCGCCTGAGAGCAGCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122278 GTAGAGGAAGAAAAAGGGAGCTTCTGTGCATCGCCTGAGAGCAGCAGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGACTTCCAGGAGGGAAGGGGGGGCATTGTGGCCCGGCTAACAGAGAGCC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 122328 TGACTTCCAGGAGGGAAGGGAGGGCATTGTGGCCCGGCTAACAGAGAGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGTTCCTGGACCTGCTCGGAGAGGAGAATGGGGGCTTTTGCCAGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122378 TGTTCCTGGACCTGCTCGGAGAGGAGAATGGGGGCTTTTGCCAGCAGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGGGGGAGTCATGCCTTCTTCCACCTTCGGGAAGTACGAGTGCTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122428 ATGGGGGAGTCATGCCTTCTTCCACCTTCGGGAAGTACGAGTGCTCACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCCCTGGGATGAGTTCCCAAGTGCAGGGCCCAAGGAGGCACCTCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122478 GCCCTGGGATGAGTTCCCAAGTGCAGGGCCCAAGGAGGCACCTCCCTGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCAAGGAGCAGCCTCTCCACCTGGAGCCAAGTCCTCCTGCCAGCCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122528 GCAAGGAGCAGCCTCTCCACCTGGAGCCAAGTCCTCCTGCCAGCCCGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CAGAGTCCAGACAACCTGACTTGCACAGAGACGCCCCTCGTCATCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122578 CAGAGTCCAGACAACCTGACTTGCACAGAGACGCCCCTCGTCATCGCAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CAACCCTGCTTACCGCAGCTTCAGCAACTCCCTGAGCCAGTCACCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122628 CAACCCTGCTTACCGCAGCTTCAGCAACTCCCTGAGCCAGTCACCGTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCAGAGAGCTGGGTCCAGACCCACTGCTGGCCAGACACCTGGAGGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122678 CCAGAGAGCTGGGTCCAGACCCACTGCTGGCCAGACACCTGGAGGAAGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GAACCCGAGATGCCCTGTGTCCCCCAGCTCTCCGAGCCAACCACTGTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 122728 GAACCCGAGATGCCCTGTGTCCCCCAGCTCTCTGAGCCAACCACTGTGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CCAACCTGAGCCAGAAACCTGGGAGCAGATCCTCCGCCGAAATGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122778 CCAACCTGAGCCAGAAACCTGGGAGCAGATCCTCCGCCGAAATGTCCTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AGCATGGGGCAGCTGCAGCCCCCGTCTCGGCCCCCACCAGTGGCTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122828 AGCATGGGGCAGCTGCAGCCCCCGTCTCGGCCCCCACCAGTGGCTATCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GAGTTTGTACATGCGGTGGAGCAGGGTGGCACCCAGGCCAGTGCGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122878 GAGTTTGTACATGCGGTGGAGCAGGGTGGCACCCAGGCCAGTGCGGTGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GGGCTTGGGTCCCCCAGGAGAGGCTGGTTACAAGGCCTTCTCAAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122928 GGGCTTGGGTCCCCCAGGAGAGGCTGGTTACAAGGCCTTCTCAAGCCTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TTGCCAGCAGTGCTGTGTCCCCAGAGAAATGTGGGTTTGGGGCTAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122978 TTGCCAGCAGTGCTGTGTCCCCAGAGAAATGTGGGTTTGGGGCTAGCAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GGGGAAGAGGGGTATAAGCCTTTCCAAGACCTCATTCCTGGCTGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123028 GGGGAAGAGGGGTATAAGCCTTTCCAAGACCTCATTCCTGGCTGCCCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GGACCCTGCCCCAGTCCCTGTCCCCTTGTTCACCTTTGGACTGGACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123078 GGACCCTGCCCCAGTCCCTGTCCCCTTGTTCACCTTTGGACTGGACAGGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 AGCCACCTCGCAGTCCGCAGAGCTCACATCTCCCAAGCAGCTCCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123128 AGCCACCTCGCAGTCCGCAGAGCTCACATCTCCCAAGCAGCTCCCCAGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 CACCTGGGTCTGGAGCCGGGGGAAAAGGTAGAGGACATGCCAAAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123178 CACCTGGGTCTGGAGCCGGGGGAAAAGGTAGAGGACATGCCAAAGCCCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 ACTTCCCCAGGAGCAGGCCACAGACCCCCTTGTGGACAGCCTGGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123228 ACTTCCCCAGGAGCAGGCCACAGACCCCCTTGTGGACAGCCTGGGCAGTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GCATTGTCTACTCAGCCCTTACCTGCCACCTGTGCGGCCACCTGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123278 GCATTGTCTACTCAGCCCTTACCTGCCACCTGTGCGGCCACCTGAAACAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 TGTCATGGCCAGGAGGATGGTGGCCAGACCCCTGTCATGGCCAGTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123328 TGTCATGGCCAGGAGGATGGTGGCCAGACCCCTGTCATGGCCAGTCCTTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 CTGTGGCTGCTGCTGTGGAGACAGGTCCTCGCCCCCTACAACCCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123378 CTGTGGCTGCTGCTGTGGAGACAGGTCCTCGCCCCCTACAACCCCCCTGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 GGGCCCCAGACCCCTCTCCAGGTGGGGTTCCACTGGAGGCCAGTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123428 GGGCCCCAGACCCCTCTCCAGGTGGGGTTCCACTGGAGGCCAGTCTGTGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CCGGCCTCCCTGGCACCCTCGGGCATCTCAGAGAAGAGTAAATCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123478 CCGGCCTCCCTGGCACCCTCGGGCATCTCAGAGAAGAGTAAATCCTCATC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 ATCCTTCCATCCTGCCCCTGGCAATGCTCAGAGCTCAAGCCAGACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123528 ATCCTTCCATCCTGCCCCTGGCAATGCTCAGAGCTCAAGCCAGACCCCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2429 AAATCGTGAACTTTGTCTCCGTGGGACCCACATACATGAGGGTCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123578 AAATCGTGAACTTTGTCTCCGTGGGACCCACATACATGAGGGTCTCT