seq1 = pF1KE1875.tfa, 1194 bp
seq2 = pF1KE1875/gi568815589r_33013457.tfa (gi568815589r:33013457_33267169), 253713 bp

>pF1KE1875 1194
>gi568815589r:33013457_33267169 (Chr9)

(complement)

1-412  (100001-100412)   100% ->
413-648  (131746-131981)   100% ->
649-836  (146564-146751)   100% ->
837-959  (151057-151179)   100% ->
960-1064  (153292-153396)   100% ->
1065-1194  (153584-153713)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCTTCGGGAGCCGCTCCTGAGCGGCAGCGCCGCGATGCCAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCTTCGGGAGCCGCTCCTGAGCGGCAGCGCCGCGATGCCAGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCCTACAGCGGGCCTGCCGCCTGCTCGTGGCCGTCTGCGCTCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCCCTACAGCGGGCCTGCCGCCTGCTCGTGGCCGTCTGCGCTCTGCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGCGTCACCCTCGTTTACTACCTGGCTGGCCGCGACCTGAGCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGGCGTCACCCTCGTTTACTACCTGGCTGGCCGCGACCTGAGCCGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCAACTGGTCGGAGTCTCCACACCGCTGCAGGGCGGCTCGAACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCAACTGGTCGGAGTCTCCACACCGCTGCAGGGCGGCTCGAACAGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCGCCATCGGGCAGTCCTCCGGGGAGCTCCGGACCGGAGGGGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCGCCATCGGGCAGTCCTCCGGGGAGCTCCGGACCGGAGGGGCCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCGCCTCCTCTAGGCGCCTCCTCCCAGCCGCGCCCGGGTGGCGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCGCCTCCTCTAGGCGCCTCCTCCCAGCCGCGCCCGGGTGGCGACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCCAGTCGTGGATTCTGGCCCTGGCCCCGCTAGCAACTTGACCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCCAGTCGTGGATTCTGGCCCTGGCCCCGCTAGCAACTTGACCTCGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCAGTGCCCCACACCACCGCACTGTCGCTGCCCGCCTGCCCTGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCAGTGCCCCACACCACCGCACTGTCGCTGCCCGCCTGCCCTGAGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCCGCTGCTTG         TGGGCCCCATGCTGATTGAGTTTAACATG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCCGCTGCTTGGTA...TAGTGGGCCCCATGCTGATTGAGTTTAACATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCTGTGGACCTGGAGCTCGTGGCAAAGCAGAACCCAAATGTGAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131775 CCTGTGGACCTGGAGCTCGTGGCAAAGCAGAACCCAAATGTGAAGATGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGGCCGCTATGCCCCCAGGGACTGCGTCTCTCCTCACAAGGTGGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131825 CGGCCGCTATGCCCCCAGGGACTGCGTCTCTCCTCACAAGGTGGCCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCATTCCATTCCGCAACCGGCAGGAGCACCTCAAGTACTGGCTATATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131875 TCATTCCATTCCGCAACCGGCAGGAGCACCTCAAGTACTGGCTATATTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTGCACCCAGTCCTGCAGCGCCAGCAGCTGGACTATGGCATCTATGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131925 TTGCACCCAGTCCTGCAGCGCCAGCAGCTGGACTATGGCATCTATGTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAACCAG         GCGGGAGACACTATATTCAATCGTGCTAAGCTCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131975 CAACCAGGTG...CAGGCGGGAGACACTATATTCAATCGTGCTAAGCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCAATGTTGGCTTTCAAGAAGCCTTGAAGGACTATGACTACACCTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146598 TCAATGTTGGCTTTCAAGAAGCCTTGAAGGACTATGACTACACCTGCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GTGTTTAGTGACGTGGACCTCATTCCAATGAATGACCATAATGCGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146648 GTGTTTAGTGACGTGGACCTCATTCCAATGAATGACCATAATGCGTACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GTGTTTTTCACAGCCACGGCACATTTCCGTTGCAATGGATAAGTTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146698 GTGTTTTTCACAGCCACGGCACATTTCCGTTGCAATGGATAAGTTTGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCAG         CCTACCTTATGTTCAGTATTTTGGAGGTGTCTCTGCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146748 TCAGGTA...CAGCCTACCTTATGTTCAGTATTTTGGAGGTGTCTCTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTAAGTAAACAACAGTTTCTAACCATCAATGGATTTCCTAATAATTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151094 CTAAGTAAACAACAGTTTCTAACCATCAATGGATTTCCTAATAATTATTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGGCTGGGGAGGAGAAGATGATGACATTTTTAACAG         ATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 151144 GGGCTGGGGAGGAGAAGATGATGACATTTTTAACAGGTA...CAGATTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TTTTTAGAGGCATGTCTATATCTCGCCCAAATGCTGTGGTCGGGAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153297 TTTTTAGAGGCATGTCTATATCTCGCCCAAATGCTGTGGTCGGGAGGTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CGCATGATCCGCCACTCAAGAGACAAGAAAAATGAACCCAATCCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153347 CGCATGATCCGCCACTCAAGAGACAAGAAAAATGAACCCAATCCTCAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065          GTTTGACCGAATTGCACACACAAAGGAGACAATGCTCTCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153397 GTG...TAGGTTTGACCGAATTGCACACACAAAGGAGACAATGCTCTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATGGTTTGAACTCACTCACCTACCAGGTGCTGGATGTACAGAGATACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153625 ATGGTTTGAACTCACTCACCTACCAGGTGCTGGATGTACAGAGATACCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1156 TTGTATACCCAAATCACAGTGGACATCGGGACACCGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153675 TTGTATACCCAAATCACAGTGGACATCGGGACACCGAGC