seq1 = pF1KE1869.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KE1869/gi568815579r_41231055.tfa (gi568815579r:41231055_41452981), 221927 bp

>pF1KE1869 1170
>gi568815579r:41231055_41452981 (Chr19)

(complement)

1-355  (99938-100292)   99% ->
356-516  (104527-104687)   100% ->
517-634  (108118-108235)   100% ->
635-712  (110735-110812)   100% ->
713-860  (110952-111099)   100% ->
861-1014  (120701-120854)   100% ->
1015-1170  (121772-121927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCCTCCGGGCTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTACCGCTGCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  99938 ATGCCGCCCTCCGGGCTGCGGCTGCTGCCGCTGCTGCTACCGCTGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTACTGGTGCTGACGCCTGGCCGGCCGGCCGCGGGACTATCCACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99988 GCTACTGGTGCTGACGCCTGGCCGGCCGGCCGCGGGACTATCCACCTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACTATCGACATGGAGCTGGTGAAGCGGAAGCGCATCGAGGCCATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100038 AGACTATCGACATGGAGCTGGTGAAGCGGAAGCGCATCGAGGCCATCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCAGATCCTGTCCAAGCTGCGGCTCGCCAGCCCCCCGAGCCAGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100088 GGCCAGATCCTGTCCAAGCTGCGGCTCGCCAGCCCCCCGAGCCAGGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGCCGCCCGGCCCGCTGCCCGAGGCCGTGCTCGCCCTGTACAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100138 GGTGCCGCCCGGCCCGCTGCCCGAGGCCGTGCTCGCCCTGTACAACAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCGCGACCGGGTGGCCGGGGAGAGTGCAGAACCGGAGCCCGAGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100188 CCCGCGACCGGGTGGCCGGGGAGAGTGCAGAACCGGAGCCCGAGCCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGACTACTACGCCAAGGAGGTCACCCGCGTGCTAATGGTGGAAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100238 GCCGACTACTACGCCAAGGAGGTCACCCGCGTGCTAATGGTGGAAACCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAACG         AAATCTATGACAAGTTCAAGCAGAGTACACACAGCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100288 CAACGGTG...TAGAAATCTATGACAAGTTCAAGCAGAGTACACACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TATATATGTTCTTCAACACATCAGAGCTCCGAGAAGCGGTACCTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104563 TATATATGTTCTTCAACACATCAGAGCTCCGAGAAGCGGTACCTGAACCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGTTGCTCTCCCGGGCAGAGCTGCGTCTGCTGAGGCTCAAGTTAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104613 GTGTTGCTCTCCCGGGCAGAGCTGCGTCTGCTGAGGCTCAAGTTAAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAGCAGCACGTGGAGCTGTACCAG         AAATACAGCAACAATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 104663 GGAGCAGCACGTGGAGCTGTACCAGGTG...TAGAAATACAGCAACAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTGGCGATACCTCAGCAACCGGCTGCTGGCACCCAGCGACTCGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108134 CCTGGCGATACCTCAGCAACCGGCTGCTGGCACCCAGCGACTCGCCAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGGTTATCTTTTGATGTCACCGGAGTTGTGCGGCAGTGGTTGAGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108184 TGGTTATCTTTTGATGTCACCGGAGTTGTGCGGCAGTGGTTGAGCCGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AG         GGGAAATTGAGGGCTTTCGCCTTAGCGCCCACTGCTCCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108234 AGGTG...CAGGGGAAATTGAGGGCTTTCGCCTTAGCGCCCACTGCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTGACAGCAGGGATAACACACTGCAAGTGGACATCAACG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110774 GTGACAGCAGGGATAACACACTGCAAGTGGACATCAACGGTG...CAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCACTACCGGCCGCCGAGGTGACCTGGCCACCATTCATGGCATGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110954 TTCACTACCGGCCGCCGAGGTGACCTGGCCACCATTCATGGCATGAACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCCTTTCCTGCTTCTCATGGCCACCCCGCTGGAGAGGGCCCAGCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111004 GCCTTTCCTGCTTCTCATGGCCACCCCGCTGGAGAGGGCCCAGCATCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAAGCTCCCGGCACCGCCGAGCCCTGGACACCAACTATTGCTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111054 AAAGCTCCCGGCACCGCCGAGCCCTGGACACCAACTATTGCTTCAGGTG.

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861      CTCCACGGAGAAGAACTGCTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111104 ..CAGCTCCACGGAGAAGAACTGCTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCGCAAGGACCTCGGCTGGAAGTGGATCCACGAGCCCAAGGGCTACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120746 CCGCAAGGACCTCGGCTGGAAGTGGATCCACGAGCCCAAGGGCTACCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCAACTTCTGCCTCGGGCCCTGCCCCTACATTTGGAGCCTGGACACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120796 CCAACTTCTGCCTCGGGCCCTGCCCCTACATTTGGAGCCTGGACACGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TACAGCAAG         GTCCTGGCCCTGTACAACCAGCATAACCCGGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120846 TACAGCAAGGTA...CAGGTCCTGGCCCTGTACAACCAGCATAACCCGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGCCTCGGCGGCGCCGTGCTGCGTGCCGCAGGCGCTGGAGCCGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121804 CGCCTCGGCGGCGCCGTGCTGCGTGCCGCAGGCGCTGGAGCCGCTGCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCGTGTACTACGTGGGCCGCAAGCCCAAGGTGGAGCAGCTGTCCAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121854 TCGTGTACTACGTGGGCCGCAAGCCCAAGGTGGAGCAGCTGTCCAACATG

   1200     .    :    .    :
   1147 ATCGTGCGCTCCTGCAAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||
 121904 ATCGTGCGCTCCTGCAAGTGCAGC