seq1 = pF1KE1828.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE1828/gi568815585f_48606818.tfa (gi568815585f:48606818_48807855), 201038 bp

>pF1KE1828 1038
>gi568815585f:48606818_48807855 (Chr13)

1-1038  (100001-101038)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGAAAATTTATGTCCTTGCAACCATCCATCTCCGTATCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGAAAATTTATGTCCTTGCAACCATCCATCTCCGTATCAGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAACCAAATGGCACCTTCAGCAATAACAACAGCAGGAACTGCACAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAACCAAATGGCACCTTCAGCAATAACAACAGCAGGAACTGCACAATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAACTTCAAGAGAGAATTTTTCCCAATTGTATATCTGATAATATTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAACTTCAAGAGAGAATTTTTCCCAATTGTATATCTGATAATATTTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGGAGTCTTGGGAAATGGGTTGTCCATATATGTTTTCCTGCAGCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGGGAGTCTTGGGAAATGGGTTGTCCATATATGTTTTCCTGCAGCCTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAGAAGTCCACATCTGTGAACGTTTTCATGCTAAATCTGGCCATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAAGAAGTCCACATCTGTGAACGTTTTCATGCTAAATCTGGCCATTTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTCCTGTTCATAAGCACGCTTCCCTTCAGGGCTGACTATTATCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTCCTGTTCATAAGCACGCTTCCCTTCAGGGCTGACTATTATCTTAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTCCAATTGGATATTTGGAGACCTGGCCTGCAGGATTATGTCTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTCCAATTGGATATTTGGAGACCTGGCCTGCAGGATTATGTCTTATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTGTATGTCAACATGTACAGCAGTATTTATTTCCTGACCGTGCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTGTATGTCAACATGTACAGCAGTATTTATTTCCTGACCGTGCTGAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGTGCGTTTCCTGGCAATGGTTCACCCCTTTCGGCTTCTGCATGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGTGCGTTTCCTGGCAATGGTTCACCCCTTTCGGCTTCTGCATGTCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCATCAGGAGTGCCTGGATCCTCTGTGGGATCATATGGATCCTTATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCATCAGGAGTGCCTGGATCCTCTGTGGGATCATATGGATCCTTATCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCTTCCTCAATAATGCTCCTGGACAGTGGCTCTGAGCAGAACGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCTTCCTCAATAATGCTCCTGGACAGTGGCTCTGAGCAGAACGGCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCACATCATGCTTAGAGCTGAATCTCTATAAAATTGCTAAGCTGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCACATCATGCTTAGAGCTGAATCTCTATAAAATTGCTAAGCTGCAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGAACTATATTGCCTTGGTGGTGGGCTGCCTGCTGCCATTTTTCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGAACTATATTGCCTTGGTGGTGGGCTGCCTGCTGCCATTTTTCACACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGCATCTGTTATCTGCTGATCATTCGGGTTCTGTTAAAAGTGGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAGCATCTGTTATCTGCTGATCATTCGGGTTCTGTTAAAAGTGGAGGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGAATCGGGGCTGCGGGTTTCTCACAGGAAGGCACTGACCACCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGAATCGGGGCTGCGGGTTTCTCACAGGAAGGCACTGACCACCATCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCACCTTGATCATCTTCTTCTTGTGTTTCCTGCCCTATCACACACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCACCTTGATCATCTTCTTCTTGTGTTTCCTGCCCTATCACACACTGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACCGTCCACTTGACGACATGGAAAGTGGGTTTATGCAAAGACAGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACCGTCCACTTGACGACATGGAAAGTGGGTTTATGCAAAGACAGACTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATAAAGCTTTGGTTATCACACTGGCCTTGGCAGCAGCCAATGCCTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATAAAGCTTTGGTTATCACACTGGCCTTGGCAGCAGCCAATGCCTGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AATCCTCTGCTCTATTACTTTGCTGGGGAGAATTTTAAGGACAGACTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATCCTCTGCTCTATTACTTTGCTGGGGAGAATTTTAAGGACAGACTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCTGCACTCAGAAAAGGCCATCCACAGAAGGCAAAGACAAAGTGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCTGCACTCAGAAAAGGCCATCCACAGAAGGCAAAGACAAAGTGTGTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 TCCCTGTTAGTGTGTGGTTGAGAAAGGAAACAAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCCCTGTTAGTGTGTGGTTGAGAAAGGAAACAAGAGTA