seq1 = pF1KE1773.tfa, 840 bp
seq2 = pF1KE1773/gi568815591r_152548645.tfa (gi568815591r:152548645_152776079), 227435 bp

>pF1KE1773 840
>gi568815591r:152548645_152776079 (Chr7)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-121  (115298-115379)   100% ->
122-840  (126717-127435)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTAGTGCCTTCCATAGGGCTGAGTCTGGGACCGAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGTGTAGTGCCTTCCATAGGGCTGAGTCTGGGACCGAGGTG...AAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTTGCCCGACTTGAAGGTAGAAGTTCCTTGAAAGAAATAGAACCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115300 CCTTGCCCGACTTGAAGGTAGAAGTTCCTTGAAAGAAATAGAACCAAATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTTTGCTGATGAAGATTCACCTGTGCATG         GTGATATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115350 TGTTTGCTGATGAAGATTCACCTGTGCATGGTA...CAGGTGATATTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAATTTCATGGCCCAGAAGGAACAGGAAAAACAGAAATGCTTTATCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126728 GAATTTCATGGCCCAGAAGGAACAGGAAAAACAGAAATGCTTTATCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AACAGCACGATGTATACTTCCCAAATCAGAAGGTGGCCTGGAAGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126778 AACAGCACGATGTATACTTCCCAAATCAGAAGGTGGCCTGGAAGTAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTTATTTATTGATACAGATTACCACTTTGATATGCTCCGGCTAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126828 TCTTATTTATTGATACAGATTACCACTTTGATATGCTCCGGCTAGTTACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTCTTGAGCACAGACTATCCCAAAGCTCTGAAGAAATAATCAAATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126878 ATTCTTGAGCACAGACTATCCCAAAGCTCTGAAGAAATAATCAAATACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGGAAGATTTTTTTTGGTGTACTGCAGTAGTAGCACCCACTTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126928 CCTGGGAAGATTTTTTTTGGTGTACTGCAGTAGTAGCACCCACTTACTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTACACTTTACTCACTAGAAAGTATGTTTTGTAGTCACCCATCTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126978 TTACACTTTACTCACTAGAAAGTATGTTTTGTAGTCACCCATCTCTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTTTGATTTTGGATAGCCTGTCAGCTTTTTACTGGATAGACCGCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127028 CTTTTGATTTTGGATAGCCTGTCAGCTTTTTACTGGATAGACCGCGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGAGGAGAAAGTGTGAACTTACAGGAGTCTACTCTGAGGAAATGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127078 TGGAGGAGAAAGTGTGAACTTACAGGAGTCTACTCTGAGGAAATGTTCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTGCTTAGAGAAGCTTGTAAATGACTATCGCCTGGTTCTTTTTGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127128 AGTGCTTAGAGAAGCTTGTAAATGACTATCGCCTGGTTCTTTTTGCAACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACACAAACTATAATGCAGAAAGCCTCGAGCTCATCAGAAGAACCTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127178 ACACAAACTATAATGCAGAAAGCCTCGAGCTCATCAGAAGAACCTTCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGCCTCTCGACGACTGTGTGATGTGGACATAGACTACAGACCTTATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127228 TGCCTCTCGACGACTGTGTGATGTGGACATAGACTACAGACCTTATCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTAAGGCATGGCAGCAACTGGTGAAGCACAGGATGTTTTTCTCCAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127278 GTAAGGCATGGCAGCAACTGGTGAAGCACAGGATGTTTTTCTCCAAACAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GATGATTCTCAAAGCAGCAACCAATTTTCATTAGTTTCACGTTGTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127328 GATGATTCTCAAAGCAGCAACCAATTTTCATTAGTTTCACGTTGTTTAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AAGTAACAGTTTAAAAAAACATTTTTTTATTATTGGAGAAAGTGGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127378 AAGTAACAGTTTAAAAAAACATTTTTTTATTATTGGAGAAAGTGGGGTTG

    850     .
    833 AATTTTGT
        ||||||||
 127428 AATTTTGT