seq1 = pF1KE1745.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KE1745/gi568815584r_24405519.tfa (gi568815584r:24405519_24608235), 202717 bp

>pF1KE1745 741
>gi568815584r:24405519_24608235 (Chr14)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-209  (100730-100880)   100% ->
210-345  (101632-101767)   100% ->
346-600  (101954-102208)   99% ->
601-741  (102577-102717)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTTCTTCCTCTCCCCCTGCTGCTCTTTCTCTTGTGCTCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTTCTTCCTCTCCCCCTGCTGCTCTTTCTCTTGTGCTCCAGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAAGCTG         GGGAGATCATCGGGGGCACAGAATGCAAGCCAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAAGCTGGTG...CAGGGGAGATCATCGGGGGCACAGAATGCAAGCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTCCCGCCCCTACATGGCCTACCTGGAAATTGTAACTTCCAACGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100763 ATTCCCGCCCCTACATGGCCTACCTGGAAATTGTAACTTCCAACGGTCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAAATTTTGTGGTGGTTTCCTTATAAGACGGAACTTTGTGCTGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100813 TCAAAATTTTGTGGTGGTTTCCTTATAAGACGGAACTTTGTGCTGACGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTCATTGTGCAGGAAG         GTCTATAACAGTCACCCTTGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100863 TGCTCATTGTGCAGGAAGGTG...CAGGTCTATAACAGTCACCCTTGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCATAACATAACAGAGGAAGAAGACACATGGCAGAAGCTTGAGGTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101655 CCCATAACATAACAGAGGAAGAAGACACATGGCAGAAGCTTGAGGTTATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGCAATTCCGTCATCCAAAATATAACACTTCTACTCTTCACCACGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 AAGCAATTCCGTCATCCAAAATATAACACTTCTACTCTTCACCACGATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGTTACTAAAG         TTGAAGGAGAAAGCCAGCCTGACCCTGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101755 CATGTTACTAAAGGTG...CAGTTGAAGGAGAAAGCCAGCCTGACCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGTGGGGACACTCCCCTTCCCATCACAATTCAACTTTGTCCCACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 101982 CTGTGGGGACACTCCCCTTCCCATCCCAATTCAACTTTGTCCCACCTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGAATGTGCCGGGTGGCTGGCTGGGGAAGAACAGGTGTGTTGAAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102032 AGAATGTGCCGGGTGGCTGGCTGGGGAAGAACAGGTGTGTTGAAGCCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCAGACACTCTGCAAGAGGTGAAGCTGAGACTCATGGATCCCCAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102082 CTCAGACACTCTGCAAGAGGTGAAGCTGAGACTCATGGATCCCCAGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAGCCACTTCAGAGACTTTGACCACAATCTTCAGCTGTGTGTGGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102132 GCAGCCACTTCAGAGACTTTGACCACAATCTTCAGCTGTGTGTGGGCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCCAGGAAGACAAAATCTGCATTTAAG         GGAGACTCTGGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102182 CCCAGGAAGACAAAATCTGCATTTAAGGTG...CAGGGAGACTCTGGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCTCTTCTGTGTGCTGGGGTGGCCCAGGGCATCGTATCCTATGGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 CCCTCTTCTGTGTGCTGGGGTGGCCCAGGGCATCGTATCCTATGGACGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGGATGCAAAGCCCCCTGCTGTCTTCACCCGAATCTCCCATTACCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102641 CGGATGCAAAGCCCCCTGCTGTCTTCACCCGAATCTCCCATTACCGGCCC

    750     .    :    .    :    .
    715 TGGATCAACCAGATCCTGCAGGCAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||
 102691 TGGATCAACCAGATCCTGCAGGCAAAT