seq1 = pF1KE1708.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KE1708/gi568815577r_28776388.tfa (gi568815577r:28776388_28985345), 208958 bp

>pF1KE1708 642
>gi568815577r:28776388_28985345 (Chr21)

(complement)

1-134  (100001-100134)   100% ->
135-221  (102275-102361)   100% ->
222-312  (103096-103186)   100% ->
313-396  (105393-105476)   100% ->
397-538  (107013-107154)   100% ->
539-642  (108855-108958)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGGGAGAACTTCGCTACGCCGTTCCACGGGCACGTGGGCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGGGAGAACTTCGCTACGCCGTTCCACGGGCACGTGGGCCGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCTTCAGCGACGTGTACGAGCCCGCGGAGGACACGTTTCTGCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCTTCAGCGACGTGTACGAGCCCGCGGAGGACACGTTTCTGCTTTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCGCTGGAGGCAGCGGCTGCCGAACTGGCAGG         AGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100101 ACGCGCTGGAGGCAGCGGCTGCCGAACTGGCAGGGTG...CAGAGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATATGCCTGGAAGTAGGGTCAGGGTCTGGTGTAGTATCTGCATTCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102282 ATATGCCTGGAAGTAGGGTCAGGGTCTGGTGTAGTATCTGCATTCCTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCTATGATAGGCCCTCAGGCTTTGTACAT         GTGCACTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102332 CTCTATGATAGGCCCTCAGGCTTTGTACATGTA...TAGGTGCACTGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAACCCTGAGGCAGCAGCTTGTACCCTAGAGACAGCACGCTGTAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103107 TCAACCCTGAGGCAGCAGCTTGTACCCTAGAGACAGCACGCTGTAACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCACATTCAACCAGTTATTACAGATTTG         GTCAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103157 GTTCACATTCAACCAGTTATTACAGATTTGGTA...TAGGTCAAAGGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTACCAAGATTGACCGAAAAAGTTGATCTTCTGGTGTTTAATCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105404 GCTACCAAGATTGACCGAAAAAGTTGATCTTCTGGTGTTTAATCCCCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGTAGTGACTCCACCTCAAGAG         GTAGGAAGTCACGGAATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105454 ATGTAGTGACTCCACCTCAAGAGGTA...CAGGTAGGAAGTCACGGAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGGCAGCTTGGGCTGGTGGCAGAAATGGTCGGGAAGTCATGGACAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107031 GAGGCAGCTTGGGCTGGTGGCAGAAATGGTCGGGAAGTCATGGACAGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTTCCCCTGGTTCCAGATCTCCTTTCACCAAGAGGATTATTCTATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107081 TTTTCCCCTGGTTCCAGATCTCCTTTCACCAAGAGGATTATTCTATTTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTACCATTAAAGAAAACAACCCAG         AAGAAATTTTGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107131 TTACCATTAAAGAAAACAACCCAGGTA...TAGAAGAAATTTTGAAAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGAAGACAAAAGGTCTGCAAGGAACCACTGCACTTTCCAGACAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108872 ATGAAGACAAAAGGTCTGCAAGGAACCACTGCACTTTCCAGACAAGCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .
    606 CCAAGAAACTCTTTCAGTCCTCAAGTTCACCAAGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108922 CCAAGAAACTCTTTCAGTCCTCAAGTTCACCAAGTCT