seq1 = pF1KE1692.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KE1692/gi568815579f_39196422.tfa (gi568815579f:39196422_39398513), 202092 bp

>pF1KE1692 600
>gi568815579f:39196422_39398513 (Chr19)

1-171  (100001-100171)   100% ->
172-249  (100384-100461)   100% ->
250-393  (101543-101686)   100% ->
394-477  (101792-101875)   100% ->
478-600  (101970-102092)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAGCTTGGACCGTGGTGCTGGTGACTTTGGTGCTAGGCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAGCTTGGACCGTGGTGCTGGTGACTTTGGTGCTAGGCTTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGCAGGCCCTGTCCCCACTTCCAAGCCCACCACAACTGGGAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGGCAGGCCCTGTCCCCACTTCCAAGCCCACCACAACTGGGAAGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACATTGGCAGGTTCAAATCTCTGTCACCACAGGAGCTAGCGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACATTGGCAGGTTCAAATCTCTGTCACCACAGGAGCTAGCGAGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGGCCAGGGACGCCTTG         GAAGAGTCACTCAAGCTGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 AAGAAGGCCAGGGACGCCTTGGTG...TAGGAAGAGTCACTCAAGCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAACTGGAGTTGCAGCTCTCCTGTCTTCCCCGGGAATTGGGACCTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 AAACTGGAGTTGCAGCTCTCCTGTCTTCCCCGGGAATTGGGACCTGAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCTCCAG         GTGAGGGAGCGCCCTGTGGCCTTGGAGGCTGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100454 TTCTCCAGGTG...CAGGTGAGGGAGCGCCCTGTGGCCTTGGAGGCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGCCCTGACGCTGAAGGTCCTGGAGGCCGCTGCTGGCCCAGCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 CTGGCCCTGACGCTGAAGGTCCTGGAGGCCGCTGCTGGCCCAGCCCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACGTCCTAGACCAGCCCCTTCACACCCTGCACCACATCCTCTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 GGACGTCCTAGACCAGCCCCTTCACACCCTGCACCACATCCTCTCCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCAGGCCTGT         ATCCAGCCTCAGCCCACAGCAGGGCCCAGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101676 TCCAGGCCTGTGTG...CAGATCCAGCCTCAGCCCACAGCAGGGCCCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCCCGGGGCCGCCTCCACCACTGGCTGCACCGGCTCCAGGAGGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101822 CCCCGGGGCCGCCTCCACCACTGGCTGCACCGGCTCCAGGAGGCCCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAG         GAGTCCGCTGGCTGCCTGGAGGCATCTGTCACCTTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101872 AAAGGTG...CAGGAGTCCGCTGGCTGCCTGGAGGCATCTGTCACCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCTCTTCCGCCTCCTCACGCGAGACCTCAAATATGTGGCCGATGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102007 ACCTCTTCCGCCTCCTCACGCGAGACCTCAAATATGTGGCCGATGGGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .
    565 CTGTGTCTGAGAACGTCAACCCACCCTGAGTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102057 CTGTGTCTGAGAACGTCAACCCACCCTGAGTCCACC