seq1 = pF1KE1681.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KE1681/gi568815587f_71900348.tfa (gi568815587f:71900348_72101858), 201511 bp

>pF1KE1681 582
>gi568815587f:71900348_72101858 (Chr11)

1-28  (99638-99665)   100% ->
29-235  (100004-100210)   100% ->
236-359  (100854-100977)   100% ->
360-507  (101058-101205)   100% ->
508-582  (101437-101511)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCATGAGACACAACTGGACACCAG         ACCTCAGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  99638 ATGACCATGAGACACAACTGGACACCAGGTA...CAGACCTCAGCCCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTGGGTCCTGCTCCTGTGTGCCCACGTCGTCACTCTCCTGGTCAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 GTGGGTCCTGCTCCTGTGTGCCCACGTCGTCACTCTCCTGGTCAGAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCTGTCTCGCAGACCACCACAGCTGCCACTGCCTCAGTTAGAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 CACCTGTCTCGCAGACCACCACAGCTGCCACTGCCTCAGTTAGAAGCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGACCCCTGCCCCTCCCAGCCCCCAGTGTTCCCAGCAGCTAAGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100117 AAGGACCCCTGCCCCTCCCAGCCCCCAGTGTTCCCAGCAGCTAAGCAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCAGCATTGGAAGTGACCTGGCCAGAGGTGGAAGTGCCACTGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100167 TCCAGCATTGGAAGTGACCTGGCCAGAGGTGGAAGTGCCACTGAGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    ATGGAACGCTGAGCTTATCCTGTGTGGCCTGCAGCCGCTTCCCCAAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAGATGGAACGCTGAGCTTATCCTGTGTGGCCTGCAGCCGCTTCCCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCAGCATCCTCTACTGGCTGGGCAATGGTTCCTTCATTGAGCACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCAGCATCCTCTACTGGCTGGGCAATGGTTCCTTCATTGAGCACCTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGCCGACTGTGGGAGGGGAGCACCAG         CCGGGAACGTGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100951 AGGCCGACTGTGGGAGGGGAGCACCAGGTG...CAGCCGGGAACGTGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCACAGGTACGCAGCTGTGCAAGGCCTTGGTGCTGGAGCAGCTGACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101072 GCACAGGTACGCAGCTGTGCAAGGCCTTGGTGCTGGAGCAGCTGACCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCTGCACAGCACCAACTTCTCCTGTGTGCTCGTGGACCCTGAACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101122 GCCCTGCACAGCACCAACTTCTCCTGTGTGCTCGTGGACCCTGAACAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTCCAGCGTCACGTCGTCCTGGCCCAGCTCTGG         GCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101172 TGTCCAGCGTCACGTCGTCCTGGCCCAGCTCTGGGTG...TAGGCTGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGAGGGCAACCTTGCCCCCCACCCAAGAAGCCCTGCCCTCCAGCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101444 TGAGGGCAACCTTGCCCCCCACCCAAGAAGCCCTGCCCTCCAGCCACAGC

    600     .    :    .
    565 AGTCCACAGCAGCAGGGT
        ||||||||||||||||||
 101494 AGTCCACAGCAGCAGGGT