seq1 = pF1KE1675.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KE1675/gi568815589f_21309177.tfa (gi568815589f:21309177_21509743), 200567 bp

>pF1KE1675 567
>gi568815589f:21309177_21509743 (Chr9)

1-567  (100001-100567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGACTTTTTATTTACTGGTGGCCCTAGTGGTGCTCAGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTGACTTTTTATTTACTGGTGGCCCTAGTGGTGCTCAGCTACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCATTCAGCTCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGACTCACAGCCTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCATTCAGCTCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGACTCACAGCCTGGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGCACAAATGCGAAGAATCTCTCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGGAGGGCCTTGATACTCCTGGCACAAATGCGAAGAATCTCTCCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGACTTTGAATTCCCCCAGGAGGAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGACTTTGAATTCCCCCAGGAGGAGTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATAAACAGTTCCAGAAGGCTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATAAACAGTTCCAGAAGGCTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGCAGACCTTCAACCTCTTCAGCACAAAGGACTCATCTGCTGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGCAGACCTTCAACCTCTTCAGCACAAAGGACTCATCTGCTGCTTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGAGACCCTTCTAGATGAATTCTACATCGAACTTGACCAGCAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGAGACCCTTCTAGATGAATTCTACATCGAACTTGACCAGCAGCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACCTGGAGTCCTGTGTGATGCAGGAAGTGGGGGTGATAGAGTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACCTGGAGTCCTGTGTGATGCAGGAAGTGGGGGTGATAGAGTCTCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGTACGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGTACGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCAAAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCTATATCTGACAGAGAAGAAATACAGCTCTTGTGCCTGGGAGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTCTATATCTGACAGAGAAGAAATACAGCTCTTGTGCCTGGGAGGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCTTCTCTTTATCAATCAACTTGCAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCTTCTCTTTATCAATCAACTTGCAAAAAA

    550     .    :    .
    551 GATTGAAGAGTAAGGAA
        |||||||||||||||||
 100551 GATTGAAGAGTAAGGAA