seq1 = pF1KE1645.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KE1645/gi568815590f_73891443.tfa (gi568815590f:73891443_74129051), 237609 bp

>pF1KE1645 480
>gi568815590f:73891443_74129051 (Chr8)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-202  (113354-113443)   98% ->
203-331  (118559-118687)   100% ->
332-384  (135347-135399)   100% ->
385-480  (137514-137609)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTACCATTTCTGTTTTTTTCCACCCTGTTTTCTTCCATATTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTACCATTTCTGTTTTTTTCCACCCTGTTTTCTTCCATATTTACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTCAGAAGCAGTATTGGGTCTGCAACTCATCCGATGCAAGTATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTCAGAAGCAGTATTGGGTCTGCAACTCATCCGATGCAAGTATTTCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACACCTACTGTG         ATAAAATGCAATACCCAATTTCAATTAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACACCTACTGTGGTA...TAGATAAAATGCAATACCCAATTTCAATTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTAACCCCTGTATAGAATTGAAAGGATCCAAAGGATTATTGCACATTTT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 113383 GTTAACCCCTGTATAGAATTGAAAAGATCCAAAGGATTATTGCACATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACATTCCAA         GGAGAGATTTAAAGCAATTATATTTCAATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 113433 CTACATTCCAAGTA...AAGGGAGAGATTTAAAGCAATTATATTTCAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTATATAACTGTCAACACCATGAATCTTCCAAAGCGCAAAGAAGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118589 TCTATATAACTGTCAACACCATGAATCTTCCAAAGCGCAAAGAAGTTATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCCGAGGATCTGATGACGATTACTCTTTTTGCAGAGCTCTGAAGGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118639 TGCCGAGGATCTGATGACGATTACTCTTTTTGCAGAGCTCTGAAGGGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332         AGACTGTGAATACAACAATATCATTCTCCTTCAAGGGAATAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118689 TA...CAGAGACTGTGAATACAACAATATCATTCTCCTTCAAGGGAATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AATTTTCTAAG         GGAAAATACAAATGTGTTGTTGAAGCTATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 135389 AATTTTCTAAGGTA...TAGGGAAAATACAAATGTGTTGTTGAAGCTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCTGGGAGCCCAGAAGAAATGCTCTTTTGCTTGGAGTTTGTCATCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137544 TCTGGGAGCCCAGAAGAAATGCTCTTTTGCTTGGAGTTTGTCATCCTACA

    500     .    :    .
    465 CCAACCTAATTCAAAT
        ||||||||||||||||
 137594 CCAACCTAATTCAAAT