seq1 = pF1KE1623.tfa, 411 bp
seq2 = pF1KE1623/gi568815581r_35913200.tfa (gi568815581r:35913200_36117897), 204698 bp

>pF1KE1623 411
>gi568815581r:35913200_36117897 (Chr17)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-136  (103505-103564)   100% ->
137-302  (103989-104154)   100% ->
303-411  (104590-104698)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTCTCCGTGGCTGCCCTCTCCTGCCTCATGCTTGTTACTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTCTCCGTGGCTGCCCTCTCCTGCCTCATGCTTGTTACTGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGATCCCAGGCCCGGGTCACAAAAG         ATGCAGAGACAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 TGGATCCCAGGCCCGGGTCACAAAAGGTG...CAGATGCAGAGACAGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATGATGTCAAAGCTTCCATTGGAAAATCCAGTACTTCTGGACA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103520 TCATGATGTCAAAGCTTCCATTGGAAAATCCAGTACTTCTGGACAGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     TGCTCTGGAGGAGAAAGATTGGTCCTCAGATGACCCTTTCTCATGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103570 .CAGTGCTCTGGAGGAGAAAGATTGGTCCTCAGATGACCCTTTCTCATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCAGGATTCCATGCTACTAGTGCTGACTGCTGCATCTCCTACACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104035 TGCAGGATTCCATGCTACTAGTGCTGACTGCTGCATCTCCTACACCCCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAGCATCCCGTGTTCACTCCTGGAGAGTTACTTTGAAACGAACAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104085 GAAGCATCCCGTGTTCACTCCTGGAGAGTTACTTTGAAACGAACAGCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCTCCAAGCCGGGTGTCAT         CTTCCTCACCAAGAAGGGGCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104135 TGCTCCAAGCCGGGTGTCATGTA...TAGCTTCCTCACCAAGAAGGGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACGTTTCTGTGCCAACCCCAGTGATAAGCAAGTTCAGGTTTGCGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 104611 ACGTTTCTGTGCCAACCCCAGTGATAAGCAAGTTCAGGTTTGCATGAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .
    374 TGCTGAAGCTGGACACACGGATCAAGACCAGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104661 TGCTGAAGCTGGACACACGGATCAAGACCAGGAAGAAT