seq1 = pF1KE1612.tfa, 357 bp
seq2 = pF1KE1612/gi568815591r_75711799.tfa (gi568815591r:75711799_75913715), 201917 bp

>pF1KE1612 357
>gi568815591r:75711799_75913715 (Chr7)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-191  (100293-100410)   100% ->
192-357  (101752-101917)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCCTGATGACCATAGTAACCAGCCTTCTGTTCCTTGGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGCCTGATGACCATAGTAACCAGCCTTCTGTTCCTTGGTGTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCCACCACATCATCCCTACGG         GCTCTGTGGTCATCCCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 TGCCCACCACATCATCCCTACGGGTA...TAGGCTCTGTGGTCATCCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCCCTGCTGCATGTTCTTTGTTTCCAAGAGAATTCCTGAGAACCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100311 CTCCCTGCTGCATGTTCTTTGTTTCCAAGAGAATTCCTGAGAACCGAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCAGCTACCAGCTGTCCAGCAGGAGCACATGCCTCAAGGCAGGAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100361 GTCAGCTACCAGCTGTCCAGCAGGAGCACATGCCTCAAGGCAGGAGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          CTTCACCACCAAGAAGGGCCAGCAGTTCTGTGGCGACCCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100411 GTA...CAGCTTCACCACCAAGAAGGGCCAGCAGTTCTGTGGCGACCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCAGGAGTGGGTCCAGAGGTACATGAAGAACCTGGACGCCAAGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101793 AGCAGGAGTGGGTCCAGAGGTACATGAAGAACCTGGACGCCAAGCAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGCTTCCCCTAGGGCCAGGGCAGTGGCTGTCAAGGGCCCTGTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101843 AAGGCTTCCCCTAGGGCCAGGGCAGTGGCTGTCAAGGGCCCTGTCCAGAG

    350     .    :    .    :    .
    333 ATATCCTGGCAACCAAACCACCTGC
        |||||||||||||||||||||||||
 101893 ATATCCTGGCAACCAAACCACCTGC