seq1 = pF1KE1610.tfa, 345 bp
seq2 = pF1KE1610/gi568815581r_28973855.tfa (gi568815581r:28973855_29174199), 200345 bp

>pF1KE1610 345
>gi568815581r:28973855_29174199 (Chr17)

(complement)

1-345  (100001-100345)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATCTCCATCTTCACCCTTCAGAGAGCAGTCCTTTCTCTGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATCTCCATCTTCACCCTTCAGAGAGCAGTCCTTTCTCTGTGCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGACGCTGGTGAGGAGAGCCGGGTCCAGGTTCTTAAGAATGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGACGCTGGTGAGGAGAGCCGGGTCCAGGTTCTTAAGAATGAGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGGGGCTCTCCGGTGCTGCTGGGCTGGGTTGAGCAAGCCTACGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAGGGGCTCTCCGGTGCTGCTGGGCTGGGTTGAGCAAGCCTACGCAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGTGTGTGTGTGGACCATCCGCACCTCCAGCCCCCACCCCACCCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGTGTGTGTGTGGACCATCCGCACCTCCAGCCCCCACCCCACCCTCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCTCAGCGTGTTATGTGCAATGACCTATTTAAGGTAAACCCATTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCTCAGCGTGTTATGTGCAATGACCTATTTAAGGTAAACCCATTCCAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACAGCAGTTCAGGGCTGATCCAAGCACTGCCTCCCTCCTGCTCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACAGCAGTTCAGGGCTGATCCAAGCACTGCCTCCCTCCTGCTCTGTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    301 GGTGGTCTGGACCATAAACTCAACTTGAGAGGGAAGGCTTGGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGGTCTGGACCATAAACTCAACTTGAGAGGGAAGGCTTGGGGT