seq1 = pF1KE1602.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE1602/gi568815592f_27039309.tfa (gi568815592f:27039309_27239617), 200309 bp

>pF1KE1602 309
>gi568815592f:27039309_27239617 (Chr6)

1-309  (100001-100309)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGGACGCGGCAAAGGAGGTAAGGGCCTGGGGAAAGGGGGTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGGACGCGGCAAAGGAGGTAAGGGCCTGGGGAAAGGGGGTGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCACCGCAAGGTGCTGCGCGACAACATCCAGGGTATCACCAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCCACCGCAAGGTGCTGCGCGACAACATCCAGGGTATCACCAAGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATTCGGCGCCTTGCTCGCCGCGGCGGCGTGAAGCGCATTTCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATTCGGCGCCTTGCTCGCCGCGGCGGCGTGAAGCGCATTTCTGGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTATGAGGAGACCCGCGGAGTGTTGAAGGTGTTCCTGGAGAACGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTATGAGGAGACCCGCGGAGTGTTGAAGGTGTTCCTGGAGAACGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGGACGCCGTGACCTACACGGAGCACGCCAAGCGCAAGACGGTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGGACGCCGTGACCTACACGGAGCACGCCAAGCGCAAGACGGTCACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATGGACGTGGTCTACGCGCTCAAGCGCCAGGGCCGCACCCTCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCATGGACGTGGTCTACGCGCTCAAGCGCCAGGGCCGCACCCTCTATGGC

    300     .
    301 TTCGGCGGC
        |||||||||
 100301 TTCGGCGGC