seq1 = pF1KE1601.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE1601/gi568815597r_149760823.tfa (gi568815597r:149760823_149961131), 200309 bp

>pF1KE1601 309
>gi568815597r:149760823_149961131 (Chr1)

1-309  (71863-72171)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGCAGAGGAAAGGGCGGAAAAGGCTTAGGCAAAGGGGGCGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  71863 ATGTCCGGCAGAGGAAAGGGCGGAAAAGGCTTAGGCAAAGGGGGCGCTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCACCGCAAGGTCTTGAGAGACAACATTCAGGGCATCACCAAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  71913 GCGCCACCGCAAGGTCTTGAGAGACAACATTCAGGGCATCACCAAGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATTCGGCGTCTAGCTCGGCGTGGCGGCGTTAAGCGGATCTCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  71963 CCATTCGGCGTCTAGCTCGGCGTGGCGGCGTTAAGCGGATCTCTGGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTACGAGGAGACCCGCGGTGTGCTGAAGGTGTTCCTGGAGAATGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  72013 ATTTACGAGGAGACCCGCGGTGTGCTGAAGGTGTTCCTGGAGAATGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCGGGACGCAGTCACCTACACCGAGCACGCCAAGCGCAAGACCGTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  72063 TCGGGACGCAGTCACCTACACCGAGCACGCCAAGCGCAAGACCGTCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATGGATGTGGTGTACGCGCTCAAGCGCCAGGGGCGCACCCTGTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  72113 CCATGGATGTGGTGTACGCGCTCAAGCGCCAGGGGCGCACCCTGTACGGC

    300     .
    301 TTCGGAGGC
        |||||||||
  72163 TTCGGAGGC